| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2657620 | 262 (0.740) | 13 (0.040) | 8/94 | NT | 5.1% | intergenic (+16/‑129) | suhB/yfhR | inositol monophosphatase/putative S9 family prolyl oligopeptidase |
| ? | CP009273 | = 2657626 | 266 (0.900) | intergenic (+22/‑123) | suhB/yfhR | inositol monophosphatase/putative S9 family prolyl oligopeptidase | |||||
Only 100 of 475 total aligned reads displayed.
AGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTT > CP009273/2657553‑2657686 | aGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA > 1:8763607‑M1/1‑68 (MQ=255)aGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA > 1:21490736‑M1/1‑68 (MQ=255)aGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGA < 1:4918162‑M1/68‑1 (MQ=255) gCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat > 1:21067325/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCTGGTGata > 1:12552916/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:23569616/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:11577095/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:12375533/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:7762278/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:13285840/1‑68 (MQ=255) ccATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGata > 1:25019048/1‑68 (MQ=255) cATGGTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAACCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat < 1:28466513/66‑1 (MQ=255) cATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat < 1:3690597/66‑1 (MQ=255) cATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat < 1:3809321/66‑1 (MQ=255) cATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat < 1:26216284/66‑1 (MQ=255) cATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGat < 1:1009946/66‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:7940876/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:14532357/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:11445372/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:26528934/68‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGAACAAGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc < 1:26176361/68‑1 (MQ=255) gCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATAtc > 1:16993669/1‑66 (MQ=255) tGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtc > 1:3280572‑M2/1‑66 (MQ=255) cGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcac < 1:22959788‑M2/67‑5 (MQ=255) aCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgc > 1:15710362‑M2/1‑60 (MQ=255) aCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccg > 1:13506421‑M2/1‑60 (MQ=255) cATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcc > 1:18764704‑M2/1‑59 (MQ=255) aTGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAAATACACAGGCGGGTGAgtgatatcacccgccg > 1:28977916‑M1/1‑52 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCg < 1:838006/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:16029689/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:15652291/67‑1 (MQ=255) cGAGTTAAGCGGCGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGGGCgtggtatcacccgccggggtcatt > 1:10393432‑M1/1‑44 (MQ=255) cGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCttt < 1:14691922/68‑1 (MQ=255) cGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCtt > 1:6072363/1‑67 (MQ=255) gAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTc > 1:24879739/1‑68 (MQ=255) aGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCa > 1:17799230/1‑68 (MQ=255) tAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgc > 1:1582811‑M2/1‑45 (MQ=255) tAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAg < 1:28113582/66‑1 (MQ=255) tAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGgc < 1:8976299/68‑1 (MQ=255) aaGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgcctgagtcattaacgct > 1:27068464‑M2/1‑44 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:9811677/1‑68 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:7491841/1‑68 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:12679783/1‑68 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCCCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:20044657/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:22447535/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:7081653/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:22216298/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:6623670/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:15082379/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:16548403/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:22328413/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:18256713/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCGTTCAGGCGCTAt > 1:2093798/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGATAATTAGTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTag > 1:6530915/1‑67 (MQ=255) cGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAtt < 1:29059332/67‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:3127270/68‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:8467381/68‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:23987209/68‑1 (MQ=255) tctGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGa < 1:5786370/68‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt < 1:8178150/68‑1 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:2585698/1‑66 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:20137468/1‑66 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgctta > 1:13326369‑M1/1‑21 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACtt > 1:19663250/1‑67 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:9297087/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:184526/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:20655296/66‑1 (MQ=255) tAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTcc < 1:21963966/67‑1 (MQ=255) tAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTcc < 1:24399889/67‑1 (MQ=255) aaTGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc < 1:23095386/68‑1 (MQ=255) tGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:24348206/1‑66 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtc > 1:23810558‑M1/1‑15 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:2454723/1‑65 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:1747636/68‑1 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:26663072/68‑1 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:7352596/68‑1 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:10604940/1‑67 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:5256415/1‑67 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:27011621/1‑67 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:24209720/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:9590569/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:27661986/68‑1 (MQ=255) gCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgt > 1:3517339‑M1/1‑8 (MQ=255) gCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgt > 1:14316572‑M1/1‑8 (MQ=255) gCGGGTGAgtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcat < 1:22841049‑M1/66‑59 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAct > 1:11918498/1‑68 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAct > 1:25126211/1‑68 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:28765144/67‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:21686565/67‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:25571597/67‑1 (MQ=255) gggTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAct < 1:13852029/67‑1 (MQ=255) gtgagtgatatcacccgccttagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcg < 1:12918221‑M1/67‑64 (MQ=255) gtgagtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcg > 1:18217307‑M1/1‑4 (MQ=255) gTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActtt < 1:22707441/67‑1 (MQ=255) gTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActtt < 1:12132298/67‑1 (MQ=255) tgagtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcgcc > 1:11018858‑M1/1‑3 (MQ=255) gagtgatatcacccgcctgagtcattaacgcttcagagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcgcca < 1:8689556‑M1/68‑67 (MQ=255) gATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttctt > 1:4595518/1‑68 (MQ=255) gATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttct < 1:5405458/67‑1 (MQ=255) gATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttct < 1:3623575/67‑1 (MQ=255) | AGCCATGCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTT > CP009273/2657553‑2657686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |