| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2657620 | 262 (0.740) | 13 (0.040) | 8/94 | NT | 5.1% | intergenic (+16/‑129) | suhB/yfhR | inositol monophosphatase/putative S9 family prolyl oligopeptidase |
| ? | CP009273 | = 2657626 | 266 (0.900) | intergenic (+22/‑123) | suhB/yfhR | inositol monophosphatase/putative S9 family prolyl oligopeptidase | |||||
Only 100 of 357 total aligned reads displayed.
GCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGTCA > CP009273/2657559‑2657692 | ggCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtca > 1:11018858‑M2/1‑65 (MQ=255) cGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcac < 1:7399246‑M2/67‑5 (MQ=255) cGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcac < 1:25957072‑M2/67‑5 (MQ=255) cGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcac < 1:22263802‑M2/67‑5 (MQ=255) gAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacc > 1:14823149‑M2/1‑62 (MQ=255) aCATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgc > 1:8797950‑M2/1‑60 (MQ=255) aTGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACtcacccgc < 1:3436381‑M2/66‑9 (MQ=255) cGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTc > 1:6018982/1‑67 (MQ=255) gTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCg > 1:22391684/1‑67 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:15652291/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGcc < 1:1341948/67‑1 (MQ=255) gACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCt > 1:27919593/1‑68 (MQ=255) cGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGTCtt > 1:5403085/1‑67 (MQ=255) cGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCttt < 1:13741478/68‑1 (MQ=255) cGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCtt < 1:6822570/67‑1 (MQ=255) cGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCtt > 1:8349636/1‑67 (MQ=255) aGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCa > 1:17799230/1‑68 (MQ=255) aGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTGTCa > 1:27414377/1‑68 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:26680809/1‑68 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:7491841/1‑68 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:12679783/1‑68 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:22917278/1‑68 (MQ=255) gCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt > 1:22494301/1‑68 (MQ=255) cggcGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCACTCGCCTTACAGGCGCTa > 1:24383402/4‑68 (MQ=255) cGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTa > 1:25072528/1‑68 (MQ=255) cGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTa > 1:8611318/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt < 1:15996980/66‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCt < 1:29050706/66‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:18823632/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:21267017/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:23254426/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:26847384/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:1853016/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:15082379/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt < 1:12438406/68‑1 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCGTTCAGGCGCTAt > 1:2093798/1‑68 (MQ=255) gACGCTCTGAAGCGATAATTAGTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTag > 1:6530915/1‑67 (MQ=255) aaCGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTAt > 1:24540848/2‑68 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:14390417/68‑1 (MQ=255) gCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTcc < 1:7116766/68‑1 (MQ=255) tctGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGa > 1:3680916/1‑68 (MQ=255) tctGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGa > 1:17407517/1‑68 (MQ=255) ctGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGaa < 1:27619353/68‑1 (MQ=255) tGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGaaa < 1:19872130/68‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt < 1:8469923/68‑1 (MQ=255) gAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:3126544/1‑68 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:167371/1‑66 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAAt > 1:4906934/1‑66 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATa < 1:8046701/67‑1 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATa < 1:26594319/67‑1 (MQ=255) aGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATa < 1:13906104/67‑1 (MQ=255) gCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt > 1:20658319/1‑68 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGTTTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTc < 1:4641314/68‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACtt > 1:3845460/1‑67 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACtt > 1:25221092/1‑67 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:5570452/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:5241531/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:28790379/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:22814009/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:18259160/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:9746887/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:11506347/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:9297087/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:8394837/66‑1 (MQ=255) gTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACt < 1:23082719/66‑1 (MQ=255) tAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTcc < 1:7858015/67‑1 (MQ=255) aaTGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc < 1:23784550/68‑1 (MQ=255) aTGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTc > 1:26301179/1‑67 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:24107262/68‑1 (MQ=255) gACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt < 1:9021096/68‑1 (MQ=255) aCTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACt > 1:10604940/1‑67 (MQ=255) cTCCGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACGGc > 1:16128194/1‑68 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:13269969/68‑1 (MQ=255) cTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGc < 1:15775924/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCt < 1:24345503/68‑1 (MQ=255) ggCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCttt > 1:21559034/1‑67 (MQ=255) gCGGGTGATATCAGTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCttt > 1:5840077/1‑66 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTa < 1:28597109/66‑1 (MQ=255) cGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAc < 1:21686565/67‑1 (MQ=255) gggTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTAct < 1:20054357/67‑1 (MQ=255) gTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActtt < 1:12132298/67‑1 (MQ=255) tGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttc < 1:12853735/67‑1 (MQ=255) tGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttc < 1:28926675/67‑1 (MQ=255) gATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTActttct < 1:3623575/67‑1 (MQ=255) tatCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACtttctttc < 1:17484401/68‑1 (MQ=255) tctctcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGGGCTATTCGGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGt < 1:4182640/65‑1 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCCGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGt < 1:9542434/68‑1 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGGTTTACTTTCTTTCg > 1:9823231/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:3254832/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:2469606/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:22142809/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:20249310/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:19510925/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:18080662/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCg > 1:10104245/1‑67 (MQ=255) tcactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGt < 1:1202649/68‑1 (MQ=255) cactcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGTc < 1:2197686/68‑1 (MQ=255) tctcacccgccggagtcattaacgcttccgagcgtcgcttaactcgtcacgcatgttcgccagcatgg > 1:11656522‑M2/2‑2 (MQ=255) actcacCCGCCCTCGCCTTTCGGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGTc > 1:10273287/1‑67 (MQ=255) actcacCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGTc > 1:2390061/1‑67 (MQ=255) | GCTGGCGAACATGCGTGACGAGTTAAGCGACGCTCTGAAGCGTTAATGACTCAGGCGGGTGATATCACTCACCCGCCCTCGCCTTTCAGGCGCTATTCCGAAATACTTCCTCACTGCTTTACTTTCTTTCGTCA > CP009273/2657559‑2657692 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |