| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3202572 | 194 (0.550) | 18 (0.060) | 4/92 | NT | 11.0% | coding (1190/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| ? | CP009273 | = 3202615 | 131 (0.450) | coding (1233/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte | |||||
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
TCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCC > CP009273/3202505‑3202638 | tCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGC < 1:18687729‑M1/68‑1 (MQ=255) cGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc < 1:1663758/68‑1 (MQ=255) gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:5126410/1‑67 (MQ=255) gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:20607896/1‑67 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:28893331/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:6698180/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:25168483/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:72426/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:7489187/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:21494102/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:22121418/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGGGATGGTGGCGGTGATTGTGGCGCTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:13665782/68‑1 (MQ=255) aCGATTGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:21310179/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:3161953/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:3756503/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:27177664/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc > 1:6679008/1‑68 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:22207245/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc > 1:12519406/1‑68 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:12261491/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:11151661/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:1032515/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTATTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:11833630/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGAATGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:26272502/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGGGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:19247357/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGGGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:15372311/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:23259889/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:17951087/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:27963025/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:15605237/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:29229207/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:6925724/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:4241807/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:16826329/68‑1 (MQ=255) gatggtgaaggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:27000791/68‑1 (MQ=255) tggtgatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGta < 1:23139784/67‑1 (MQ=255) tggggatggtgGCGGTGATTGTGGTGTTTAATCTACTGCGCTACTTTTTCTCCAGCGCCACGGCGt < 1:14360877/66‑1 (MQ=255) ggtgatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGtata < 1:12391710/68‑1 (MQ=255) tgatggtgGCGTTGATTGTGGAGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATAc < 1:2705458/67‑1 (MQ=255) gatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATAcc > 1:12708951/1‑67 (MQ=255) tggtggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTcc > 1:27711319/1‑68 (MQ=255) tggtggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTcc > 1:8283262/1‑68 (MQ=255) tggaggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTcc > 1:9321738/1‑68 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:9878033/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:22632931/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:8682740/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:10789930/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGc > 1:27589975/1‑66 (MQ=255) cGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCtctc > 1:13812602/1‑68 (MQ=255) tGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGGTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCa < 1:10141079/68‑1 (MQ=255) tGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCa < 1:8117999/68‑1 (MQ=255) aTTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCAcc < 1:22326859/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCTCCga < 1:18348536/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:21910344/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:10019857/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:10571710/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga > 1:4093215/1‑68 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:17739759/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:19585751/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:19686128/68‑1 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatga < 1:7649287/68‑1 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatga > 1:24068505/1‑68 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACATCCGCTCTCGCCCCgatga > 1:19034461/1‑68 (MQ=255) gtTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatgatga < 1:10896391/68‑1 (MQ=255) gtTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatgatg < 1:15171401/67‑1 (MQ=255) tttATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGAtt > 1:5385217/1‑68 (MQ=255) aTCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct < 1:3299937/68‑1 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagctatcatcatcggtgcgcgggcggaggtatacgccgt > 1:23590287‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagctatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgt > 1:1727368‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagcgcggaggtatacgccgt > 1:13931511‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtttacgccgt > 1:26811706‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgt > 1:16130660‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgt > 1:14789284‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:28338965/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:20037314/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:2019226/1‑66 (MQ=255) tACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct < 1:15870999/68‑1 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtg > 1:20779920‑M1/1‑24 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtg > 1:9107433‑M1/1‑24 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:23395436/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:3892242/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:13508080/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCAATGATGATtgctgct > 1:4781114/1‑67 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:25393695‑M2/1‑66 (MQ=255) gcgcTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgc > 1:11440419‑M2/1‑64 (MQ=255) gcgcTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc < 1:9425012‑M2/66‑3 (MQ=255) gcTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctg > 1:12744333‑M2/1‑62 (MQ=255) tACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctgg > 1:24653196‑M2/1‑60 (MQ=255) aCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcg > 1:7846335‑M2/1‑59 (MQ=255) aCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcg > 1:18486723‑M2/1‑59 (MQ=255) ttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATg < 1:5875752/68‑1 (MQ=255) tttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGc < 1:11692799/68‑1 (MQ=255) tgaccACCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCg < 1:25102486/65‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGa > 1:25737527/1‑68 (MQ=255) gCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGAGGATGATTGCGGCTGCGCTGGCGATGCCGGa < 1:8641647/68‑1 (MQ=255) ccAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgataaagtt > 1:3577771‑M1/1‑7 (MQ=255) ccAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagta > 1:2884919‑M1/1‑7 (MQ=255) ccAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagta > 1:14734417‑M1/1‑7 (MQ=255) gcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgcag > 1:17352015‑M1/1‑2 (MQ=255) gcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgcag > 1:10738890‑M1/1‑2 (MQ=255) | TCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCC > CP009273/3202505‑3202638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |