| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3202572 | 194 (0.550) | 18 (0.060) | 4/92 | NT | 11.0% | coding (1190/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| ? | CP009273 | = 3202615 | 131 (0.450) | coding (1233/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte | |||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
TACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGG > CP009273/3202548‑3202682 | tACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct < 1:15870999/68‑1 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:8316566/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:24848112/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:19282051/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:13508080/1‑67 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:10235324‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:25393695‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:21315694‑M2/1‑66 (MQ=255) gcgcTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc < 1:9425012‑M2/66‑3 (MQ=255) gcTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctg > 1:12744333‑M2/1‑62 (MQ=255) tACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggc > 1:9967388‑M2/1‑60 (MQ=255) tACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctgg > 1:17315608‑M2/1‑60 (MQ=255) tACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctgg > 1:24653196‑M2/1‑60 (MQ=255) aacTTTATCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctgg > 1:3577771‑M2/2‑60 (MQ=255) aCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcg > 1:18486723‑M2/1‑59 (MQ=255) aCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcg > 1:7846335‑M2/1‑59 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt < 1:16714478/68‑1 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt > 1:23260124/1‑68 (MQ=255) tttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGc < 1:12102630/68‑1 (MQ=255) tttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGc < 1:20500931/68‑1 (MQ=255) tttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGc < 1:11692799/68‑1 (MQ=255) tttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGc < 1:19704442/68‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaa > 1:669575‑M2/1‑54 (MQ=255) ttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGcc < 1:2777287/68‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGcc > 1:16116568/1‑68 (MQ=255) tgaccACCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCg < 1:25102486/65‑1 (MQ=255) gcCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATcc < 1:7683748/67‑1 (MQ=255) cACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagt > 1:22162481‑M2/1‑43 (MQ=255) cACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagt > 1:9107433‑M2/1‑43 (MQ=255) cACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGAGGATTGCAGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagt > 1:26400145‑M2/1‑43 (MQ=255) aCGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtag > 1:14777339‑M2/1‑42 (MQ=255) aCGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtag > 1:4179581‑M2/1‑42 (MQ=255) aCGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtag > 1:6489268‑M2/1‑42 (MQ=255) aCGGCGTATACCTCCGCCCGCGCACCGATGATGATAGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtag > 1:23590287‑M2/1‑42 (MQ=255) aCGGCGTAAACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtag > 1:26811706‑M2/1‑42 (MQ=255) ggCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtagat > 1:27037572‑M2/1‑40 (MQ=255) ggCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtagat < 1:15514613‑M2/68‑29 (MQ=255) cGTTTACCTCCGCTCTCTCACGGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGATATCCCGCTGcc < 1:11241331/67‑1 (MQ=255) cGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGcc < 1:1706862/67‑1 (MQ=255) cGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGcc < 1:8815738/67‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtg < 1:15730/68‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtg < 1:15386553/68‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtg > 1:5174314/1‑68 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtg < 1:13746771/68‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgt < 1:1346074/67‑1 (MQ=255) taCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt < 1:23022042/68‑1 (MQ=255) taCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt < 1:20870009/68‑1 (MQ=255) taCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt < 1:13897542/68‑1 (MQ=255) taCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt < 1:5723348/68‑1 (MQ=255) taCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:2492839/1‑68 (MQ=255) aCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:27302102/1‑67 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:17092434/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:14983617/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:15314914/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:28345490/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:13324982/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:17531390/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:24327288/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:5276919/1‑66 (MQ=255) cTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:19317839/1‑65 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:4859250/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:27828371/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:13533099/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:25921271/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:12238341/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:20693935/1‑67 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:26282162/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:13665755/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:887511/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:16033930/68‑1 (MQ=255) cGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTTTGcc < 1:6328361/68‑1 (MQ=255) gCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCt < 1:309461/68‑1 (MQ=255) aCCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttg > 1:25836864/1‑68 (MQ=255) aCCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttg > 1:28236109/1‑68 (MQ=255) aCCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttg > 1:25726551/1‑68 (MQ=255) aCCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttg > 1:12604920/1‑68 (MQ=255) aCCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCAGCCTTAtggttg > 1:14090179/1‑68 (MQ=255) cGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt < 1:20103404/68‑1 (MQ=255) gatgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCgg < 1:10152061/68‑1 (MQ=255) tgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCa < 1:10839482/68‑1 (MQ=255) tgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCa < 1:28897826/68‑1 (MQ=255) tgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCa < 1:23828197/68‑1 (MQ=255) atTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAAt > 1:28019607/1‑68 (MQ=255) atTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAAt > 1:9786102/1‑68 (MQ=255) atTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAAt > 1:7399292/1‑68 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:7335795/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:28505067/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:17453445/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:5008932/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:6849437/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:18693434/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:22262724/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:6257949/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:5884576/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:552055/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCGGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:6710904/68‑1 (MQ=255) gcagctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:3664458/65‑1 (MQ=255) tgcagcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTc < 1:4765317/68‑1 (MQ=255) tgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTgg < 1:14458082/68‑1 (MQ=255) tgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTgg < 1:19505744/68‑1 (MQ=255) | TACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGG > CP009273/3202548‑3202682 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |