| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1238033 = | 405 (1.150) | 17 (0.070) | 13/76 | NT | 7.0% | coding (504/915 nt) | ldcA | murein tetrapeptide carboxypeptidase; LD‑carboxypeptidase A |
| ? | CP009273 | 1238051 = | 180 (0.750) | coding (486/915 nt) | ldcA | murein tetrapeptide carboxypeptidase; LD‑carboxypeptidase A | |||||
Only 100 of 513 total aligned reads displayed.
GATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTAAAGG > CP009273/1237985‑1238118 | gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCt > 1:21440999/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCt > 1:2386873/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCt > 1:8955055/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:1032802/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:21014231/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:18279309/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:25323748/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:26299862/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:27746273/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:299226/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:14036374/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:9624465/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:8514610/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGACGGGCCt > 1:17474531/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCTTc > 1:19050269/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc < 1:403350/68‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc < 1:24021964/68‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc < 1:1676906/68‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:1363523/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:20416269/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:5533710/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:4909651/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:13143283/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCATc > 1:15432353/1‑67 (MQ=255) gtggcgttacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTcc < 1:17187671‑M2/4‑1 (MQ=255) ctggcgttacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc > 1:1660580‑M1/46‑67 (MQ=255) aGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCGTcc > 1:26570214/1‑66 (MQ=255) gAAATCAGCCTCGCAAGATTGCCTCACCACAACGTGCCTTCGGCCCGACCTGTCGGGCCTTCCCCtt < 1:25064795/67‑1 (MQ=255) gAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCtt > 1:19603846/1‑67 (MQ=255) tttacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGGCGGGCCTTCCCCTTGc > 1:6844000‑M1/41‑68 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc < 1:5095561/68‑1 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc < 1:22045479/68‑1 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc < 1:18138684/68‑1 (MQ=255) tacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc > 1:12817283‑M1/39‑67 (MQ=255) tCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt < 1:1505034/68‑1 (MQ=255) tCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt < 1:11109747/68‑1 (MQ=255) tCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt > 1:1884263/1‑68 (MQ=255) tCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt < 1:28167376/68‑1 (MQ=255) acgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCAt < 1:25837860‑M2/13‑1 (MQ=255) cAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt > 1:19324831/1‑67 (MQ=255) gCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCa > 1:23781317/1‑68 (MQ=255) aTCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCa < 1:10830492/66‑1 (MQ=255) cGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATgg < 1:20740240/68‑1 (MQ=255) aaccttcaccattgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGt < 1:21244957‑M2/21‑1 (MQ=255) aaccttcaccattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGt > 1:23833804‑M1/29‑67 (MQ=255) accttcaccatttaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGa < 1:25471924‑M2/23‑1 (MQ=255) aaGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGa > 1:24708127/1‑68 (MQ=255) aGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGaa > 1:5726485/1‑68 (MQ=255) ttttGCCTCTCTTCAACGTGCCTTCGGGCCGACATTTCGGGCATTCCCCTTGCCATTCAATGGTGTAg < 1:9129651/66‑1 (MQ=255) aTTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAgt > 1:974686/1‑67 (MQ=255) aTTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAgg > 1:15982380/1‑68 (MQ=255) ttGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGt < 1:3403347/68‑1 (MQ=255) ttGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTACCCTTGCCAATCAATGGTGAAGGt > 1:27380855/1‑68 (MQ=255) cTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGGTTCa > 1:6993406/1‑68 (MQ=255) tgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGGCATTCATTGGTGAAGGGTTCAtt < 1:16328289‑M1/51‑1 (MQ=255) ccACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGc < 1:21855356/68‑1 (MQ=255) acaACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGGGt > 1:22183743/1‑68 (MQ=255) acaACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGt > 1:24357417/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:18510138/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:8693001/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:15274781/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGGGAAGGGTTCATTGCGTAAc > 1:3083472/1‑68 (MQ=255) cGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:16181874/1‑67 (MQ=255) gTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACg > 1:26883461/1‑67 (MQ=255) ccTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgcca > 1:12196250/1‑67 (MQ=255) ggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTACGTAACgccag > 1:6360124‑M2/23‑67 (MQ=255) ggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccag < 1:6326284‑M1/63‑1 (MQ=255) cTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccagc < 1:7814430/68‑1 (MQ=255) cTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccag < 1:26698144/67‑1 (MQ=255) cTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCAATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccag < 1:29175962/67‑1 (MQ=255) gaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccagcc > 1:28833995‑M2/22‑68 (MQ=255) tCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgcccgcca > 1:8209106/1‑68 (MQ=255) tCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccagcca > 1:17829188/1‑68 (MQ=255) tCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccagcca < 1:9372517/68‑1 (MQ=255) GCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGaa < 1:3643844‑M1/68‑1 (MQ=255) CCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGaa > 1:13936247‑M1/1‑67 (MQ=255) catgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGt > 1:4575844‑M2/12‑67 (MQ=255) catgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGt > 1:6654344‑M2/12‑67 (MQ=255) atgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGc < 1:4317463‑M2/58‑1 (MQ=255) atgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGc < 1:15740055‑M2/58‑1 (MQ=255) atgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGc < 1:23169794‑M2/58‑1 (MQ=255) atgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGc < 1:25742404‑M2/58‑1 (MQ=255) ATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGt < 1:14683265‑M1/66‑1 (MQ=255) TCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg < 1:23949723‑M1/68‑1 (MQ=255) cgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg < 1:23259454‑M2/61‑1 (MQ=255) cgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg < 1:7210122‑M2/61‑1 (MQ=255) cgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg < 1:17253163‑M2/61‑1 (MQ=255) cgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg < 1:10035030‑M2/61‑1 (MQ=255) CGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCgg > 1:19278897‑M1/1‑68 (MQ=255) 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ttCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTAAAgg < 1:14788542/68‑1 (MQ=255) | GATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTAAAGG > CP009273/1237985‑1238118 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |