New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4512275 = | 358 (0.860) | 24 (0.070) | 11/92 | NT | 7.0% | coding (1637/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
? | CP009273 | 4512318 = | 340 (1.000) | coding (1594/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4512351‑4512275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgcatcggTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTCTT > CP009273/4512318‑4512383 CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGC > 1:28293112/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:10028890/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:19960728/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:3852364/1‑68 TCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:33535642/68‑1 TCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:1838206/68‑1 TCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTGCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:5676103/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGgg < 1:25041207/68‑3 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:32726746/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:27443040/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:18063798/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:14367797/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:7233413/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:29568676/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:28873388/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:108921/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:20113126/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:29262068/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT > 1:28147149/1‑67 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT > 1:7823477/1‑67 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT > 1:33335548/1‑67 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT > 1:17721188/1‑67 TGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGC < 1:34452492/68‑1 TGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGC < 1:9156441/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:15512940/1‑68 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:34066198/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:12693527/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:1166705/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:1070162/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:24794119/68‑1 CATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATC > 1:6925292/1‑68 CATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATC > 1:12125352/1‑68 CATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATC > 1:11686612/1‑68 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:27290931/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:25583687/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:16910125/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:19975491/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:31700995/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:32063950/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:16847825/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:10094072/68‑1 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGT < 1:16111468/68‑1 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:30836866/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:25277846/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:26185634/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:25509167/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:6703782/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:13349824/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:14431666/1‑67 TTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACA < 1:33889528/68‑1 TTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACA < 1:19139094/68‑1 TCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACAT < 1:23398098/68‑1 CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:34266825/68‑1 TCACCGCTGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:18542853/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:938049/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:25340384/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:13413940/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:26818332/68‑1 TCACCGATGCACGTTGCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTTATTAACGAAACATGCTTACC < 1:5594902/68‑1 TCACCGATCCACGTTTCACGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:2387056/68‑1 ACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGT < 1:10369000/68‑1 CCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTA < 1:21521731/68‑1 TGCACGTTGCCCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGAC < 1:3157940/68‑1 GTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATG < 1:3172325/68‑1 TTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:20788155/68‑1 TTCGCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:28258785/68‑1 GGGCGTTGCTCCGGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGG < 1:20953876/68‑1 CGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTA > 1:17768074/1‑68 GTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAG > 1:19439028/1‑68 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTAGCGTATGACAGATGCTTCAGTGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:17590144/67‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGT < 1:7434736/68‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGT < 1:1104794/68‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGT < 1:6586950/68‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:15928303/67‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:12918654/67‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:28053395/67‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:21233610/67‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:29673311/67‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACAGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:26428538/67‑1 ATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTT > 1:12339489/1‑67 TCGGTGATTTACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTC < 1:23941670/68‑1 TCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTC < 1:1304995/68‑1 TCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTC < 1:20364199/68‑1 TCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTC < 1:23669455/68‑1 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1:31539501/68‑1 GGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTCT > 1:33636816/1‑67 GGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTCT > 1:726569/1‑67 GGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTCT < 1:22534285/67‑1 GGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTCT > 1:21198229/1‑67 CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4512351‑4512275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgcatcggTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTCTT > CP009273/4512318‑4512383 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |