| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4583141 = | NA (NA) | 11 (0.030) | 7/90 | NT | NA | intergenic (+12/+37) | tsr/yjjL | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor/L‑galactonate transporter |
| ? | CP009273 | 4583171 = | NA (NA) | intergenic (+42/+7) | tsr/yjjL | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor/L‑galactonate transporter | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4583218‑4583141‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttatcgggcatAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAGTGCC > CP009273/4583171‑4583235 TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATACCATTTTGCT > 1:27578581/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:10033005/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:7814317/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:21696436/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT < 1:28027696/68‑1 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:16809485/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:21815882/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:24018307/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:25741829/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:5619802/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTCCTTA > 1:30580174/1‑68 TGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTAT < 1:1557185/68‑1 TGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTAT < 1:7787562/68‑1 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:29659689/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:30813374/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:25713220/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:24884275/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:4007260/1‑68 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1:33958510/67‑1 TATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACG < 1:17298416/67‑1 TATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACG < 1:2754021/67‑1 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC > 1:11262856/1‑68 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC > 1:221683/1‑68 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC > 1:8893983/1‑68 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC > 1:21654576/1‑68 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC > 1:17315664/1‑68 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC < 1:18819196/68‑1 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC > 1:31796385/1‑68 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC > 1:34473271/1‑68 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC > 1:9024769/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |