| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3851553 = | 472 (1.140) | 38 (0.120) | 11/86 | NT | 10.9% | coding (212/1494 nt) | yidJ | sulfatase/phosphatase superfamily protein |
| ? | CP009273 | 3851602 = | 259 (0.810) | coding (163/1494 nt) | yidJ | sulfatase/phosphatase superfamily protein | |||||
Only 100 of 356 total aligned reads displayed.
CCTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3851631‑3851553‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agtccggcccgtgCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAGACTATC > CP009273/3851602‑3851668 CCTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG > 1:28300156/1‑68 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCTGTATCTACGCTAACCAG < 1:7984976/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGT < 1:23821516/68‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:21805386/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:1552748/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:15917811/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:32848075/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG > 1:548756/1‑67 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:6000249/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:7544501/67‑1 TACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTC < 1:6142158/68‑1 CACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCG > 1:941015/1‑68 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG < 1:25396436/68‑1 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCG > 1:33889732/1‑67 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCG > 1:26270151/1‑67 CCTGTTCCCCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:8957771/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTACCCAGTCCGG > 1:11165903/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGC < 1:3479926/68‑1 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:24885075/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:16939722/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:9656145/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:30135416/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:32468652/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:12963750/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:11491084/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCCGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:3840756/1‑67 CTGTTCCCCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTA‑TTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC < 1:31392365/68‑1 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCC < 1:2877064/68‑1 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCC < 1:25728117/68‑1 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCC < 1:196382/68‑1 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGC > 1:18330960/1‑67 TGTTCACCGGTTTGTACGCCTTCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC < 1:14452095/68‑1 TGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC < 1:718581/68‑1 TGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC < 1:13341489/68‑1 TGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC < 1:4685657/68‑1 TGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC > 1:30968565/1‑68 TGTTCACCGGTTTGAACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC < 1:26581602/68‑1 tctCCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:17928109/64‑1 tccCCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG < 1:34296250/65‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG < 1:10980238/68‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG > 1:21535491/1‑68 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG > 1:30339541/1‑68 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:15245979/67‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGCGCCGGACTATTTACCCGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG > 1:28226932/1‑68 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGCCTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:14928549/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:10472449/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:16507517/68‑1 CGGGTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:19479406/68‑1 gTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCG < 1:5839269/66‑1 TTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTACCCCGTCCGGCCCGTGCAGGCG < 1:33300315/67‑1 TTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCG < 1:6921717/67‑1 TTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACCCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCG < 1:8835814/67‑1 CTGCACCGGCCGGACTATTTACCGGTATCTCCGCTAACCAGGCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGG < 1:23285757/68‑1 tcCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGT > 1:18464241/3‑68 TGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGT < 1:6191928/68‑1 CACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGA < 1:25873161/68‑1 cCGGGCCGGACTATTAACCGGTATCTCCGCTACCCAGCCCGGCCCGGGCAGGCGTACAAACCGGTGA < 1:17254793/66‑1 CCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGG < 1:27679337/67‑1 CCGGACTATTACCCGGTAGCTACGCTAACCACCCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGG < 1:26889642/67‑1 CGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGCCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGT < 1:10763452/67‑1 TTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGA < 1:31290584/68‑1 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGACCAGGTGAAGGCGGAAGTAAAGCGCATACCTTCCG > 1:18650594/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGACGCCCTTCCG > 1:334966/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:27296599/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:12242179/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:10096065/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:19892610/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:16101899/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:8547289/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:15380868/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:29613062/1‑67 GTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC > 1:4437469/1‑68 CCGGCCCGTTCAGGCGTACTCACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC < 1:20973599/66‑1 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CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:4057446/1‑67 CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:3208843/1‑67 CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:27409279/1‑67 CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:2440344/1‑67 CCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAGAC < 1:3168895/68‑1 CCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAGA < 1:20130261/67‑1 CCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:12778198/1‑66 CGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAGACT < 1:11860861/68‑1 CGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAGACT < 1:22136675/68‑1 CGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAGACT < 1:24190641/68‑1 CGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAGACT < 1:25155354/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |