| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 610426 | 192 (0.460) | 21 (0.060) | 4/96 | NT | 10.4% | coding (814/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| ? | CP009273 | = 610453 | 198 (0.560) | coding (841/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent | |||||
Only 100 of 404 total aligned reads displayed.
GATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTT > CP009273/610360‑610492 | gATTTAGCGCTTGCGCTGGGAGCCTTGTGGGTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCcggcgg < 1:22017282/68‑1 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:20757252/68‑1 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg > 1:6430665/1‑68 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:15248049/68‑1 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:25938923/68‑1 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:32161215/68‑1 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:22782329/68‑1 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:1280938/68‑1 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGa < 1:10246628/67‑1 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:7366892/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:33604558/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:24994476/1‑68 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:23012784/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:30221350/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:1475478/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:8984104/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:7706066/1‑66 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTTTCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:23574537/66‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCTCCGGATTTATCt > 1:16089979/1‑68 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:27394272/66‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:4609417/66‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCt > 1:33097008/1‑68 (MQ=255) ccTTGCGATGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCTATTGTGCAATAGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCt > 1:12506937/1‑68 (MQ=255) cTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCtt < 1:26845702/68‑1 (MQ=255) cTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCtt < 1:21825287/68‑1 (MQ=255) cTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCtt < 1:7344074/68‑1 (MQ=255) gcTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATg < 1:1941641/67‑1 (MQ=255) cTTGTGGCTGGGGAGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTgg < 1:32201873/68‑1 (MQ=255) tgtgGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGc < 1:27831054/68‑1 (MQ=255) ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg > 1:11372707‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:29083493‑M2/68‑5 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:32495180‑M2/68‑5 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:1129778‑M2/68‑5 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:6038378‑M2/1‑62 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:34503113‑M2/1‑62 (MQ=255) ggggCGATGGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:8256235‑M2/1‑62 (MQ=255) gggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:31928049‑M2/1‑61 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGAACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:8620112‑M2/1‑60 (MQ=255) gATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtag > 1:10774578‑M2/1‑57 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:503251‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:17628426‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:13070551‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:19097213‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGa < 1:1363544/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGa < 1:12154321/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGAc < 1:29562307/68‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:11709769‑M2/1‑55 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:20125059‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACg < 1:33420620/68‑1 (MQ=255) tgggCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:32549108‑M2/1‑54 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGc < 1:22147747/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:22303690‑M2/1‑49 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:18502934‑M2/1‑49 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:31030474/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:9484049/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:2990446/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:21503296/67‑1 (MQ=255) aTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTAcc > 1:6250578/1‑68 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:12028228/1‑68 (MQ=255) gTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGa < 1:4185697/68‑1 (MQ=255) gTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGa < 1:1427168/68‑1 (MQ=255) gTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGa < 1:22435472/68‑1 (MQ=255) aTGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGAcc < 1:30676028/68‑1 (MQ=255) tGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCGcggcggcgtagtccatacgattgcac > 1:2645643‑M2/1‑42 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcaca > 1:28271008‑M1/1‑14 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcaca > 1:28441822‑M1/1‑14 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:11246102/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:2666722/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:25637546/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:7924847/1‑68 (MQ=255) gACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:29693488/1‑68 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgccgcataaagataaatccggcggcggaggccctacgcttgcacca > 1:1829423‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatgcggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:2058856‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcccaa > 1:2122792‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:18034764‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:25442241‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:14509911‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:31571433‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:34339511‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:27095108‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:9733349‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:5801797/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:25572279/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:10680448/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:24613003/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:13288326/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:15874118/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:17473142/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:17167153/1‑67 (MQ=255) aCGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcg > 1:18969578‑M1/1‑9 (MQ=255) ggcgccaGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCCCTGACGGCTACCAGCGGCGTGCTCaa > 1:16304253/3‑68 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccc < 1:5294228‑M1/68‑62 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:32751483‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:6944803‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:21040955/1‑67 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:24265507/1‑67 (MQ=255) ccgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc > 1:34015672/1‑68 (MQ=255) gccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccag < 1:16587726‑M1/68‑65 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccagcc < 1:361384‑M1/68‑67 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccagcc > 1:2166333‑M1/1‑2 (MQ=255) | GATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTT > CP009273/610360‑610492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |