| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 610426 | 192 (0.460) | 21 (0.060) | 4/96 | NT | 10.4% | coding (814/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| ? | CP009273 | = 610453 | 198 (0.560) | coding (841/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent | |||||
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
GGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTGCGGCGCA > CP009273/610388‑610520 | ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg > 1:2166333‑M2/1‑66 (MQ=255)ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:361384‑M2/68‑3 (MQ=255)ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:19278844‑M2/68‑3 (MQ=255) gCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:25625924‑M2/67‑3 (MQ=255) gCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCAcg > 1:13235783/1‑67 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:34503113‑M2/1‑62 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:6038378‑M2/1‑62 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:21534381‑M2/1‑62 (MQ=255) gggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc < 1:11831646‑M2/68‑8 (MQ=255) gggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:31928049‑M2/1‑61 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:5508446‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:11262829‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:6944803‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:1354877‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:22305682‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGAACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:8620112‑M2/1‑60 (MQ=255) gCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcg > 1:14302061‑M2/1‑59 (MQ=255) cGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgt > 1:18969578‑M2/1‑58 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:10377533‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:19097213‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:17417190‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:29626972‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:3251967‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGCATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:2058856‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGGGCAATCAAATGGCCTACGCCGCCGGATTAATCTTTATGCGGCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:32171429‑M2/1‑55 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:28271008‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:18084465‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:33853031‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACg < 1:25554950/68‑1 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACg < 1:33420620/68‑1 (MQ=255) tgtgCAATCGAATGTAATACGCCGCCGGATATCTCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:212228‑M2/1‑54 (MQ=255) tgggCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:32549108‑M2/1‑54 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGc < 1:4848820/67‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:29314286/68‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:25450213/68‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:20216892/68‑1 (MQ=255) cAATCGTATGGACGACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:11038600/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:18502934‑M2/1‑49 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:24702238‑M2/1‑49 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:14551888‑M2/1‑49 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:9484049/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:29769719/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:11681223/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:31030474/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:3229453/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa > 1:7710865/1‑67 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:14082493/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa > 1:9171972/1‑67 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:22203670/67‑1 (MQ=255) aTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTAcc > 1:6250578/1‑68 (MQ=255) aTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTAc > 1:22140421/1‑67 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:12028228/1‑68 (MQ=255) gTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGa < 1:22435472/68‑1 (MQ=255) aTGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGAcc < 1:32863877/68‑1 (MQ=255) tGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGAcc < 1:26634598/67‑1 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:4314384/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:1226456/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:11344752/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:2761681/1‑68 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:15874118/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:26816144/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:5801797/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:27096713/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:21272924/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:7344641/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCGTTATGCGTCGAGGGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:16280414/1‑67 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTg < 1:3430198/67‑1 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGc < 1:26984630/68‑1 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:24265507/1‑67 (MQ=255) ccgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGCCGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc > 1:17556833/1‑68 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:12119850/67‑1 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:1293037/67‑1 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:16349862/67‑1 (MQ=255) tttATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGc < 1:22969421/67‑1 (MQ=255) tCTTTATGGGTCGTCTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTg < 1:7461433/68‑1 (MQ=255) tCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTg > 1:26125469/1‑68 (MQ=255) tCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTg > 1:19763689/1‑68 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:6505545/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:11223636/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:2991493/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:33119054/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:21130188/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:23894027/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:10218803/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:17128740/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:25793712/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:26504384/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:20998422/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:12785131/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTAACGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:635232/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCGCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:2279501/68‑1 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAtt < 1:28007876/68‑1 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAtt < 1:6710484/68‑1 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAtt < 1:17848925/68‑1 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAt > 1:28566573/1‑67 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAt > 1:31444000/1‑67 (MQ=255) gCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTc < 1:15161291/68‑1 (MQ=255) gCGTCGACGGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTc < 1:30660519/68‑1 (MQ=255) ggCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTgcggc > 1:5214307/1‑68 (MQ=255) gCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTgcggc < 1:16020704/67‑1 (MQ=255) | GGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTGCGGCGCA > CP009273/610388‑610520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |