| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2436000 = | 271 (0.650) | 17 (0.050) | 8/94 | NT | 6.8% | coding (758/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme |
| ? | CP009273 | 2436103 = | 239 (0.690) | coding (861/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme | |||||
Only 100 of 351 total aligned reads displayed.
GGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGG > CP009273/2436036‑2436169 | caataccaccgccgataatcgccgcttcccgtttgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggc < 1:20420563‑M2/1‑1 (MQ=255) ataccaccgccgataatcgccgcttcccgtttgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTgg < 1:27991983‑M2/4‑1 (MQ=255) ataccaccgccgataatcgccgcttcccgtttgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTgg < 1:12069244‑M2/4‑1 (MQ=255) aGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTgg < 1:29245671/67‑1 (MQ=255) ccaccgccgataatcgccgcttcccgtttgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAg > 1:7327680‑M2/62‑68 (MQ=255) ggcgATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAg < 1:28473062/67‑1 (MQ=255) caccgccgataatcgccgcttcccgtttgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAgg < 1:18086982‑M2/8‑1 (MQ=255) cgATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGGTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGt < 1:7860877/67‑1 (MQ=255) gccgctcatcgccgcctcccgtgtgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAAc < 1:25974741‑M2/12‑1 (MQ=255) gccgataatcgccgcttcccgtttgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAAc < 1:30351551‑M2/12‑1 (MQ=255) gccgaaaatcgccgcttcccgtttgcggctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAAc < 1:3753923‑M2/12‑1 (MQ=255) ttATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAAc < 1:13438116/67‑1 (MQ=255) ttATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAAc < 1:29369544/67‑1 (MQ=255) tATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGc < 1:24500559/68‑1 (MQ=255) tATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGc < 1:14465505/68‑1 (MQ=255) cgataatcgccgcttcccgtttgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAACGc < 1:11114978‑M2/14‑1 (MQ=255) cgataatcgccgcttcccgtttgctgctgcccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAACGc < 1:17148460‑M2/14‑1 (MQ=255) cgataatcgccgctccccgtttgctgctgcccgtgcggtaaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAACGc < 1:8372105‑M2/14‑1 (MQ=255) cggcggTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCttt < 1:28905322/68‑1 (MQ=255) cggcggTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCttt < 1:3579851/68‑1 (MQ=255) ggcggTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTa > 1:14161940/1‑68 (MQ=255) gtggtATTGCAAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTgc > 1:27648221/1‑68 (MQ=255) tggtATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTTGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTgc < 1:33833967/67‑1 (MQ=255) ttcccgtttgctgctgcccgggcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:14619369‑M2/27‑1 (MQ=255) tccccgtttgctgctgcccgtgcgggtaacccacggcgcggCGGGCAGGAAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:19257680‑M2/27‑1 (MQ=255) aTTGCCTGCGCGGTGTTGTCGATGGCGCTATTTCGTCTCGGCTTGGAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:2745016/68‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:24044844/68‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:9380637/68‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:988029/68‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:13893882/68‑1 (MQ=255) ttGCCAGCGCGTTGTTGGCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:20574058/67‑1 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:5194030/1‑68 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:18466279/1‑68 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:28576678/1‑68 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:34259346/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:4617552/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:13541912/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:24134599/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:13706548/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:17535597/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:19692986/1‑68 (MQ=255) cAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:13793532/1‑67 (MQ=255) cAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:21747006/1‑67 (MQ=255) cAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:15196544/1‑67 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcccc < 1:3535845/68‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:28273225/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:33455369/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:21318778/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:20714826/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:3400670/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:9182382/66‑1 (MQ=255) gcgGTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:10676215/66‑1 (MQ=255) gcgGTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:30027596/66‑1 (MQ=255) cgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGccccc > 1:24970410/1‑68 (MQ=255) gttgttGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCg < 1:32220055/68‑1 (MQ=255) gttgttGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCg < 1:31252811/68‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc < 1:23083293/67‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc < 1:18333484/67‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc < 1:17322232/67‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCa < 1:10236900/68‑1 (MQ=255) tgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACt < 1:24868434/67‑1 (MQ=255) tgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACt < 1:22223555/67‑1 (MQ=255) tgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTg > 1:5646966/1‑68 (MQ=255) cccgtgcggttaaaccacggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTg > 1:16382883‑M2/26‑68 (MQ=255) gtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTgg < 1:6016549/68‑1 (MQ=255) gtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGC‑TTATGGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTgg < 1:33177183/67‑1 (MQ=255) cGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:10424123/1‑68 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:17261339/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:890479/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:4937575/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:30794344/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCGATTACGGCGCGGCTGGCAGGTACCGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:18893408/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCGATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:3021654/1‑66 (MQ=255) gcgcTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCtt > 1:32660626/1‑67 (MQ=255) gcgcTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCtt > 1:20289955/1‑67 (MQ=255) cgcTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTcc > 1:22745477/1‑68 (MQ=255) gcTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCg > 1:25791287/1‑68 (MQ=255) ttACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:16786454/45‑1 (MQ=255) tACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCaa > 1:23324899/1‑67 (MQ=255) acggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATc < 1:14896297‑M2/59‑1 (MQ=255) acggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATc < 1:1306603‑M2/59‑1 (MQ=255) acggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATc > 1:12587689‑M2/10‑68 (MQ=255) cggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg < 1:26138148‑M2/60‑1 (MQ=255) ggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg > 1:15947263‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg > 1:25602993‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg > 1:2142688‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg > 1:25473805‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg > 1:6413297‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg > 1:6788656‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCg > 1:7052351‑M2/8‑67 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGcc < 1:11696033‑M2/62‑1 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:26233790‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:11457779‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:8651947‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:10069207‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:23636106‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:6236765‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCa > 1:18806309‑M2/6‑68 (MQ=255) cgcggCTGGCAGGTAACGCGTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGcc < 1:29085775‑M2/62‑1 (MQ=255) ggCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAggg < 1:31769048‑M2/66‑1 (MQ=255) | GGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAATCGCCAGGGG > CP009273/2436036‑2436169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |