| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2436008 | 308 (0.740) | 16 (0.050) | 7/94 | NT | 6.0% | coding (766/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme |
| ? | CP009273 | = 2436093 | 239 (0.690) | coding (851/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme | |||||
Only 100 of 306 total aligned reads displayed.
CAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAA > CP009273/2436028‑2436159 | agcaAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTacg < 1:17904947‑M2/68‑4 (MQ=255) gcaAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTacg < 1:31897906‑M2/67‑4 (MQ=255) aaaCGGGAAGCGGCGATTATGGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTacggc > 1:14535969‑M2/1‑62 (MQ=255) aaaCGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTacggc < 1:14925828‑M2/67‑6 (MQ=255) gggAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTacggcgcgga > 1:30449311‑M2/1‑58 (MQ=255) gggAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTacggcgcgga > 1:19668196‑M2/1‑58 (MQ=255) gggAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTacggcgcgga > 1:13487173‑M2/1‑58 (MQ=255) gggAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTAGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGc < 1:16074964/68‑1 (MQ=255) gggAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGGTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGc < 1:12963812/68‑1 (MQ=255) gggAAGCGGCGATGAGCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGc < 1:29358840/68‑1 (MQ=255) gggAACCTGCGAGTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGGCGCTGGCGCTATTacggcgcgga > 1:1992670‑M2/1‑58 (MQ=255) ggAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTacggcgcg < 1:4968204‑M2/65‑9 (MQ=255) aGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTgg < 1:27388585/67‑1 (MQ=255) aGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTgg < 1:2572697/67‑1 (MQ=255) aGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGc > 1:10611487/1‑68 (MQ=255) aGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTACCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTgg < 1:10265119/67‑1 (MQ=255) aGCGGCGATTAGCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTgg < 1:29862259/67‑1 (MQ=255) ggcgATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAg < 1:28473062/67‑1 (MQ=255) ggcgATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAg < 1:24925249/67‑1 (MQ=255) cgATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTacggcgcggagcagggga > 1:596929‑M2/1‑49 (MQ=255) cgATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGGTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGt < 1:7860877/67‑1 (MQ=255) cgAATATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCCGGCGCTATTacggcgcggagcagggga > 1:28841587‑M2/1‑49 (MQ=255) ttATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAAc < 1:22220105/67‑1 (MQ=255) ttATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAAc < 1:19082790/67‑1 (MQ=255) ttAGCGGCGGCGGGATTGCCAGCGCGTTGTGGGCGCTGGCGCTAATacggcgcggagcaggggagcgg > 1:10722806‑M2/1‑46 (MQ=255) tATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGc < 1:13818369/68‑1 (MQ=255) tATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGc < 1:21367419/68‑1 (MQ=255) tATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGc < 1:27626433/68‑1 (MQ=255) aatCGGCGGTGGTAGTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTacggcgcggagcaggggagcggt > 1:5063755‑M2/2‑45 (MQ=255) tCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCtt < 1:33049082/68‑1 (MQ=255) ggcggTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTa > 1:14161940/1‑68 (MQ=255) gcggTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTAt > 1:9155143/1‑68 (MQ=255) gcggTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTAt > 1:2481898/1‑68 (MQ=255) cggTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTAt < 1:28137527/67‑1 (MQ=255) cggTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTAt < 1:18315135/67‑1 (MQ=255) ggtggtATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTAtt > 1:30869322/1‑67 (MQ=255) tggtATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTTGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTgc < 1:33833967/67‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:34092771/68‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:26058108/68‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:2417925/68‑1 (MQ=255) ttGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGa < 1:20645235/67‑1 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:28576678/1‑68 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:26203684/1‑68 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:5194030/1‑68 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:9753271/1‑68 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:18752617/1‑68 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:2043546/1‑68 (MQ=255) tGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATg > 1:22498117/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:6232189/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:28994842/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:13288292/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:28278944/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:3565796/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:13706548/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:17535597/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:6579945/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:6996023/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:17119739/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:23172135/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:16671566/1‑68 (MQ=255) cAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAgg < 1:4533666/68‑1 (MQ=255) cAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAgg < 1:8687894/68‑1 (MQ=255) cAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:23532623/1‑67 (MQ=255) cAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAg > 1:15196544/1‑67 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGGTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:10133199/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGccc > 1:24059178/1‑67 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:21318778/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:11826717/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:1895166/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:33455369/66‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 1:18809505/66‑1 (MQ=255) gttgttGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCg < 1:34488350/68‑1 (MQ=255) gttgttGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCg < 1:1841772/68‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc < 1:23289459/67‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc < 1:17372874/67‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc < 1:25163234/67‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc < 1:31352292/67‑1 (MQ=255) tgttgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCa < 1:25522302/68‑1 (MQ=255) tgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACt < 1:7242101/67‑1 (MQ=255) tgtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTg > 1:5646966/1‑68 (MQ=255) gtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTgg < 1:10868151/68‑1 (MQ=255) gtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTgg < 1:11496242/68‑1 (MQ=255) gtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTgg < 1:832996/68‑1 (MQ=255) gtCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGC‑TTATGGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTgg < 1:33177183/67‑1 (MQ=255) cGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTggg < 1:29214907/67‑1 (MQ=255) cGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:3653034/1‑68 (MQ=255) cGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt < 1:3003540/68‑1 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:17261339/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:21734851/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:1356301/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:890479/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:13929002/1‑66 (MQ=255) cTGGCGCGATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt > 1:3021654/1‑66 (MQ=255) tGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGc < 1:14402822/67‑1 (MQ=255) tGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCt < 1:920604/68‑1 (MQ=255) ggCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCt > 1:20806274/1‑67 (MQ=255) gcgcTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCtt > 1:20289955/1‑67 (MQ=255) cgcTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTcc > 1:22745477/1‑68 (MQ=255) tATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGc < 1:3242029/68‑1 (MQ=255) tACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCaa > 1:27732563/1‑67 (MQ=255) | CAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGCAA > CP009273/2436028‑2436159 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |