| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2845465 = | 321 (0.770) | 26 (0.070) | 12/96 | NT | 7.6% | coding (243/273 nt) | hypC | hydrogenase maturation protein |
| ? | CP009273 | 2845525 = | 353 (0.990) | coding (31/1122 nt) | hypD | hydrogenase maturation protein | |||||
Only 100 of 502 total aligned reads displayed.
CGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGA > CP009273/2845458‑2845589 | cctgttccggcgcgcgatattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcgcgccgg < 1:17136523‑M2/1‑1 (MQ=255) ggATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGa < 1:10327580/68‑1 (MQ=255) ctgttcCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGa < 1:28424187‑M1/62‑1 (MQ=255) aTGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAAc > 1:702071/1‑68 (MQ=255) tccggcgcgcgatattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcgcgccgGAACAg < 1:206433‑M2/6‑1 (MQ=255) tccggcgcgcgaaattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcgcgccgGAACAg < 1:29531863‑M2/6‑1 (MQ=255) gTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAg < 1:1869934/68‑1 (MQ=255) gTCGGCGCGCTGTTGGATGGCGAGGAAAAATAATCCGTTGTGGTGATGAATATCGCGCGCCGGCACAg > 1:30959471/1‑68 (MQ=255) cCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAgg < 1:25848793‑M1/67‑1 (MQ=255) CGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAgg > 1:14609371‑M1/1‑67 (MQ=255) GGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTg < 1:6747125‑M1/68‑1 (MQ=255) GGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTg < 1:5984774‑M1/68‑1 (MQ=255) GGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTg < 1:30079414‑M1/68‑1 (MQ=255) GGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGCTTTGTTGATGTATATCGCGCGCCGGATCAGGt > 1:828579‑M1/1‑67 (MQ=255) CGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGAt < 1:7925580‑M1/68‑1 (MQ=255) tgttgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGTAACAGGTGATGCAg < 1:10071531/67‑1 (MQ=255) tgttgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAg < 1:1364616/67‑1 (MQ=255) tgttgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAg < 1:9061685/67‑1 (MQ=255) tgttgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAg < 1:31809734/67‑1 (MQ=255) gatattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcgcgccgGAACAGGTGATGCAg < 1:24560833‑M2/15‑1 (MQ=255) gttgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGtt < 1:23689962/68‑1 (MQ=255) gttgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGtt < 1:22786553/68‑1 (MQ=255) ttgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAg < 1:32280225/65‑1 (MQ=255) ttgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTa > 1:7649983/1‑68 (MQ=255) tattcatcaacaaaccgcattatttttcctcgccaaacaacagcgcgccgGAACAGGTGATGCAGTTa < 1:20012264‑M2/18‑1 (MQ=255) tattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcgcgccgGAACAGGTGATGCAGtt < 1:30846737‑M2/17‑1 (MQ=255) tattcatcaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacagcgcgccgGAACAGGTGATGCAGtt < 1:11810132‑M2/17‑1 (MQ=255) tgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTaa > 1:26047296/1‑68 (MQ=255) tgtATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTa < 1:28803188/67‑1 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAAtt < 1:26816536/67‑1 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:16648750/1‑68 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:1122857/1‑68 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:8111320/1‑68 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:30241807/1‑68 (MQ=255) aTGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTg > 1:22315489/1‑68 (MQ=255) aacaacaaaacgcattatttttcctcgccatacaacaccgcgccgGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa < 1:14520186‑M2/23‑1 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:344584/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:17555313/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:25311910/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:25569755/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:33067091/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:32511056/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:15074447/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:27536637/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:15891169/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:4683549/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:24122791/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:6350933/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:6486289/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:22945797/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:18060818/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:21621254/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:13047686/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:18446657/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:2032921/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:12646552/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGa > 1:8408523/1‑67 (MQ=255) ggCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGACGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCGGTTAATTGa > 1:33409385/1‑67 (MQ=255) gAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCAt < 1:8569002/68‑1 (MQ=255) aaaaTAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTgc < 1:19244202/67‑1 (MQ=255) aaaaTAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTCAGCATCTgc < 1:15156332/67‑1 (MQ=255) ataatGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGa < 1:17874568/68‑1 (MQ=255) aatGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAAc > 1:26979777/1‑68 (MQ=255) gCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGt > 1:29140259/1‑67 (MQ=255) gCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGt > 1:320826/1‑67 (MQ=255) gCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGAATCTGCGCGAACGt > 1:3064250/1‑67 (MQ=255) gTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCt < 1:21141342/68‑1 (MQ=255) tttGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTc < 1:28038194/68‑1 (MQ=255) tttGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTc < 1:14185286/68‑1 (MQ=255) tgttgATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTcac > 1:29943478/1‑68 (MQ=255) gttgATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTcaca > 1:3679531/1‑68 (MQ=255) gttgATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTcaca < 1:5446939/68‑1 (MQ=255) gatgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtct < 1:4520238/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:5713980/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:1337981/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:14084678/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:4069462/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:16835419/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:24975679/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:7445313/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:12368781/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:19139187/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:10801365/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctct < 1:16167637/68‑1 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctc > 1:9509742/1‑67 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctc > 1:8825858/1‑67 (MQ=255) tgaATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACAtctc > 1:24816677/1‑67 (MQ=255) aaTATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATctctct > 1:23277408/1‑68 (MQ=255) aaTATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATctctct > 1:19023192/1‑68 (MQ=255) aaTATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATctctct > 1:19762909/1‑68 (MQ=255) aaTATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATctctct > 1:31314337/1‑68 (MQ=255) aaTATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATctctct > 1:28244169/1‑68 (MQ=255) atatCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCtt > 1:17407958/1‑68 (MQ=255) atCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTac > 1:4814132/1‑68 (MQ=255) atCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTac > 1:20199142/1‑68 (MQ=255) atCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTac > 1:20092028/1‑68 (MQ=255) tCGCACGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTac > 1:33720986/1‑67 (MQ=255) cgcgccgGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACAcc > 1:4980478‑M2/8‑67 (MQ=255) gcgccgGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACAccg > 1:2729332‑M2/7‑67 (MQ=255) gccgGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACAccgccg < 1:26550222‑M2/64‑1 (MQ=255) | CGGATGTCGGCGCGCTGTTGTATGGCGAGGAAAAATAATGCGTTTTGTTGATGAATATCGCGCGCCGGAACAGGTGATGCAGTTAATTGAGCATCTGCGCGAACGTGCTTCACATCTCTCTTACACCGCCGA > CP009273/2845458‑2845589 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |