| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3614794 | NA (NA) | 4 (0.010) | 3/106 | NT | 100% | coding (2243/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3614820 | 0 (0.000) | coding (2269/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
AGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGC > CP009273/3614753‑3614883 | aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:29177502‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG > 1:10636668‑M2/1‑68 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:21910172‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:8564349‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:7919512‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:1373426‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:5492883‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:32004668‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG > 1:16680064‑M2/1‑68 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:33284292‑M2/68‑1 (MQ=255)aGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG < 1:25876721‑M2/68‑1 (MQ=255) gCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacct > 1:4919578‑M2/1‑50 (MQ=255) gCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacct > 1:16611322‑M2/1‑50 (MQ=255) aTTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGcctttctcgtcatacctgt > 1:22277074‑M2/1‑48 (MQ=255) tACCGGTATGATGACAAAGGCCGGCTGACCGGGGAGCGTCAGACGGcctttctcatcatacctgtaat > 1:1547385‑M2/1‑46 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:2739139‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:28587558‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:25870672‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:23455183‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:25390620‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:3166701‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:32971803‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:33215380‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:9004907‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:9047046‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:10178055‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:12507700‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:12891981‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:13679763‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:15251603‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:17753779‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:18796463‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:21262593‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:22661642‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:23258170‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:24350952‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtc > 1:21397956‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatg < 1:29952342‑M2/63‑61 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatg < 1:22077738‑M2/63‑61 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatg < 1:18420877‑M2/63‑61 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatg < 1:14529625‑M2/63‑61 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatg < 1:6409047‑M2/63‑61 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatg < 1:27038990‑M2/63‑61 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatg < 1:2326172‑M2/63‑61 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatg < 1:10509041‑M2/63‑61 (MQ=255) cGGcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggggcccttcgctgatatggctgatgtct > 1:28313608‑M2/1‑3 (MQ=255) | AGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGC > CP009273/3614753‑3614883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |