| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3615265 | NA (NA) | 5 (0.010) | 3/100 | NT | 100% | coding (2714/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3615283 | 0 (0.000) | coding (2732/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCG > CP009273/3615216‑3615350 | cacaCCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCC > 1:18748169‑M2/1‑68 (MQ=255) accaccGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCGCGTATGCCACAGACCCGGCTGGTAAACGACTGCCgg < 1:24237720‑M2/67‑3 (MQ=255) gCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtggcattcgggatgcggatatccagattc < 1:8712506‑M2/65‑37 (MQ=255) ccACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtggcttacgggatgcggatatccagattcgct < 1:19838486‑M2/67‑40 (MQ=255) ccACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgct < 1:8753565‑M2/67‑40 (MQ=255) ccACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggagatccagattcgctg < 1:17512533‑M2/68‑41 (MQ=255) acaGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCggggctgtggcatacgggatgcggatatccagagtcgcggcg < 1:29111813‑M2/68‑43 (MQ=255) gCCTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtca < 1:15601726‑M2/68‑62 (MQ=255) gCCTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtca < 1:13469507‑M2/68‑62 (MQ=255) ccTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag > 1:11422816‑M2/1‑6 (MQ=255) ccTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag > 1:1932853‑M2/1‑6 (MQ=255) ccTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtca < 1:10324726‑M2/67‑62 (MQ=255) ccTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtca < 1:10692425‑M2/67‑62 (MQ=255) catccgggtctttggcctacgggatgcggatatccagaatcgctgcggtggtgggaacgccggtcagc > 1:48018‑M2/4‑5 (MQ=255) cTGCGgggtcactggcagacgggaagcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:29453998‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgtgtctggggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:13717142‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:27999917‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:28039374‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:28685185‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:23171733‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:9281506‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:22429405‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:29646695‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:32833894‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:33335178‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:34195801‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:34422456‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:3845736‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:4531706‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:6048125‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:8498630‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:9040785‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:9073240‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:20294140‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:13435749‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:14367516‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:13076654‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:15691052‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:13002295‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:18548303‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:12316503‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:10727435‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:3220202‑M2/67‑63 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:5881678‑M2/67‑63 (MQ=255) cTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:6239907‑M2/67‑63 (MQ=255) cTGCCgggtctggggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:12341820‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtcggtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:15482953‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtcggtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:26307521‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtcgggggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:5619538‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCgggtcagtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:7973201‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCggggctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:7230809‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGCCggggctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:23182869‑M2/1‑5 (MQ=255) tGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcaggc < 1:12746327‑M2/68‑65 (MQ=255) tGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:22351131‑M2/1‑4 (MQ=255) tGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:20236988‑M2/1‑4 (MQ=255) tGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:15376485‑M2/1‑4 (MQ=255) tGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:24131943‑M2/1‑4 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:11159071‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:32744277‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:2178354‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:15152894‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:1389840‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:31472916‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:31363316‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:4035417‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:5696958‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:21810828‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:16153490‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:16236423‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:28572150‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:28481068‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:16500762‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:17109238‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:6080867‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:7030961‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:26044302‑M2/65‑63 (MQ=255) gCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:23600478‑M2/65‑63 (MQ=255) cgggtctgtggcatgcgggatgcggatatccagattcgctgcggtggggtgaacgccggtcagcctgc > 1:8100470‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:13030520‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:21682478‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:31745334‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:22738221‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:27671883‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:23293590‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:24950468‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:10291683‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:32644917‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:9255331‑M2/1‑1 (MQ=255) 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cgggtctggggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg > 1:27178294‑M2/1‑1 (MQ=255) cgggactggggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 1:7456424‑M2/1‑1 (MQ=255) | CACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCG > CP009273/3615216‑3615350 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |