New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4512275 = | 363 (0.940) | 27 (0.090) | 10/92 | NT | 7.6% | coding (1637/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
? | CP009273 | 4512318 = | 354 (1.120) | coding (1594/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4512351‑4512275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgcatcggTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTCTT > CP009273/4512318‑4512383 CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGC > 1:10044093/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:19838687/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:20606707/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:24093011/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:7799361/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGC < 1:16603822/67‑1 TCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:21754968/68‑1 TCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:18682766/68‑1 TCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:19425137/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:15316040/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:20754154/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:23182677/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:26448203/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:7850481/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:28898174/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:3058733/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:383351/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:31918821/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:3560305/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT > 1:7065268/1‑67 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT > 1:13429278/1‑67 TGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGC < 1:12809713/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:12542840/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:25934319/68‑1 TCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:29883524/1‑67 TCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:11790500/1‑67 TCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:16766176/1‑67 TCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:31639006/1‑67 ATACGGTAATCATCTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG < 1:23266207/68‑1 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:18033920/1‑68 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG < 1:29607174/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:9126799/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:27513024/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:23587514/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:23919019/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:8316116/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:7241898/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:14302501/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:1939158/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:17131584/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:30187456/1‑67 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:1198493/1‑67 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCACGTGCATCGG < 1:1515761/68‑1 TACGGTAAGCAGGTTGAGTTAATCACCGATGCACGTTGCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:4190350/68‑1 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGT < 1:1575733/68‑1 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGT < 1:22895363/68‑1 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:10577416/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:516369/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:29316904/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:6494243/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:10858978/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:29453799/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:17920277/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:10534720/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:21053538/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:14568505/1‑67 GGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGGGCGTGCATCGGTGg > 1:9038311/1‑67 AGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAA < 1:30271948/68‑1 TTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACA < 1:2601902/68‑1 TCGTAACTCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACAT < 1:26842917/68‑1 CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:23336992/68‑1 CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:25366362/68‑1 cccCCGATGCACGTTTCTCGGGCGTATCTCCTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:26088355/65‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:12340212/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:552710/68‑1 TCACCGATGCACGTTGCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCAGCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:10024356/68‑1 CCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTA < 1:27784470/68‑1 GTTTCTCGGGCGTTTCTACAGGCGCGTGCACCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGAag < 1:4075906/68‑3 TTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:21477768/68‑1 TTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:14829571/68‑1 TTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:10200001/68‑1 TTCTCGGGCGTTTCAACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:24435412/68‑1 TCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTC < 1:15006443/67‑1 acCTACTGGCCCGTCCACCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACT < 1:8871616/65‑1 CGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGG > 1:27250452/1‑68 cCGTGGATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGT < 1:2079208/67‑1 CGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTA > 1:9391929/1‑68 CGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGA > 1:5923572/1‑38 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:9759449/67‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:30546243/67‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:20360161/67‑1 GCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG < 1:29024172/67‑1 ATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTT > 1:8027143/1‑67 TCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTC < 1:6539166/68‑1 TCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTT > 1:19921905/1‑66 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |