| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2691481 | 362 (0.940) | 29 (0.080) | 15/100 | NT | 7.8% | coding (429/636 nt) | pgpC | phosphatidylglycerophosphatase C, membrane bound |
| ? | CP009273 | = 2691501 | 364 (1.060) | coding (409/636 nt) | pgpC | phosphatidylglycerophosphatase C, membrane bound | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2691410‑2691481‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggctgCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGTT < CP009273/2691501‑2691435 TGTGCGACCTTTTCCTGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCCTAGCCACGCTGAATTTG > 1:6239928/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATCCCCAACCACCATAGCCCCGCTGATTTTG > 1:27147998/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:16005198/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:23190091/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:23041422/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:19481944/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:13361973/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:4251104/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:12611661/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:26897905/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:2474921/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:5540158/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:6232158/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:21324265/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:103231/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:23917044/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAAAACCCAACCACCCTAGCCCCGCTGAATTTG > 1:6434669/1‑68 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCCCCCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:2056534/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:28075062/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:18455468/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:2944785/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:25012184/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:15190923/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:32057424/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:3366202/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:1378704/1‑66 TGCGACCTTTTCATGGCCCAGACAACGCATCGTCAGTGGCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:22067421/1‑66 GACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:15514505/1‑67 GACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:15421787/1‑67 TGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAg > 1:12668691/1‑67 ACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCGGCCGGGGGGTAATGTTATC > 1:31323482/1‑67 GTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAAT > 1:31997643/1‑68 ACCCAACCACCATAGACACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCCGCCAAATTCAGCG > 1:767689/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGGTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGGGT > 1:5395844/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGGGTATCTTATCGCCCGCCAAATTCCGCGg > 1:22001803/1‑67 ACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATG > 1:25613593/1‑68 CATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGGTAATCTTATCGCCGGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGT > 1:27218858/1‑68 ATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATAGCCAGGCATATTCAGCGTGGCTATGGTG > 1:23779198/1‑68 TAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGG > 1:20201153/1‑68 GCCACGCTGAATTTGGCTGGCGCGGGGTATTCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGGGATGGTGGTT > 1:28190313/1‑68 GCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATGGTATCGCGCGGCAAATTCAGCGTGGCGATGGTGGTT > 1:28940063/1‑68 GCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTT > 1:24867802/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTG > 1:27924434/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTG > 1:22840772/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTG > 1:12421806/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGGTG > 1:22762835/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCGAGGGTGGTTG > 1:10378861/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGGTAATCTTATAGCCAGCCAAATTCAGCGGGGCGATGGTGGTTG > 1:8263237/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATGTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:24326413/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:29888788/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:1194810/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:26353583/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:25148685/1‑68 GCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTA > 1:14773231/1‑68 GCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTA > 1:23250712/1‑68 ATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGAC > 1:19066722/1‑68 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:16720816/68‑1 GGCTGCCGCGGGGTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:6174327/68‑1 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:20999622/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:17934190/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:30486865/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:19917982/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:24541996/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:11229234/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:9636869/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:4985297/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:10776075/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:8060075/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:9166678/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:23211532/1‑68 GCTGCCGCGGCTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:23690969/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCCGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:26794090/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGGTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:31487146/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGag > 1:31177568/1‑66 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:5256713/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:12576529/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:12232443/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:5165670/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:6866352/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:23308747/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:12903658/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:21895919/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:2068617/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:20403103/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:3826103/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:29880997/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:18580999/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:19334942/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:3845347/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGAGGCG > 1:29214411/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTCGGTATTGACGATGCG > 1:26063660/1‑68 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTTTGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT < 1:21664969/68‑1 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT > 1:12384986/1‑68 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT < 1:14491091/68‑1 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT > 1:708867/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |