| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3293574 = | 363 (0.940) | 15 (0.050) | 8/90 | NT | 5.4% | coding (250/303 nt) | yhbQ | GIY‑YIG nuclease superfamily protein |
| ? | CP009273 | 3293608 = | 233 (0.750) | coding (284/303 nt) | yhbQ | GIY‑YIG nuclease superfamily protein | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3293649‑3293574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tctgcaaacccCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCAGCGCGTCA > CP009273/3293608‑3293674 CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:6240883/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:5153314/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:12396269/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:12482227/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:8084267/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:5647657/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTC < 1:16501956/67‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTC < 1:12787619/67‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:22318981/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:15702006/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:18884688/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:14711009/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:19864711/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:2034246/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:20614285/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:1359308/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:3419714/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:12103435/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:30550819/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:10814157/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:24264358/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:4610021/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTACGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:6533896/68‑1 TTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:27128150/1‑68 TTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCA > 1:4039143/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:22209696/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:22915184/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:29706781/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:25455512/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:14242156/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:13754000/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:13178060/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:7017862/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:11691384/1‑67 TGAGAATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:23044627/1‑67 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:3937557/68‑1 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:9897385/68‑1 AGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:14010764/1‑67 AGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGCTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:28717085/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:15043299/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:10017539/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:10390952/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:3607511/1‑66 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:10053606/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:9439311/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:31510582/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:337558/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:6744925/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:3667751/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:12993142/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:16367402/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:19043291/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCGTTACAGCTCTGCAAAC > 1:6752731/1‑65 CGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:585548/68‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:16824079/68‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:30318913/68‑1 TTTTAATCTCCGGGGATTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAA < 1:17689174/67‑1 CTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGT < 1:5294446/68‑1 TCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT > 1:26472811/1‑67 TCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT > 1:2145300/1‑67 TCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT > 1:24001644/1‑67 CTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTC > 1:20675904/1‑68 CTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT < 1:29835837/66‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |