New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3615065 | NA (NA) | 6 (0.020) | 5/94 | NT | 100% | coding (2514/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
? | CP009273 | = 3615271 | 0 (0.000) | coding (2720/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
CGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCcctgccggg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3615000‑3615065 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCGG < CP009273/3615271‑3615196 CGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCC < 1:22756641/68‑1 GCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCT < 1:25629965/68‑1 GCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCT < 1:31279039/68‑1 GCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCT < 1:21217564/68‑1 GCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCT < 1:19114556/68‑1 GCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCT < 1:7824005/68‑1 GCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCT < 1:1493261/68‑1 CGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCT > 1:8882493/1‑67 CGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCT > 1:6729072/1‑67 GACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGC < 1:2842817/68‑1 GACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTG > 1:26224801/1‑67 GACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTG > 1:19683920/1‑67 GACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTG > 1:5741824/1‑67 GACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTAAGAACTCACCACCGCTTATACCCCTG > 1:5089459/1‑67 ACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTTACCACCGCTTATACCCCTGCC > 1:23111155/1‑68 ACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCCCCACCGCTTATACCCCTGCC > 1:23394944/1‑68 ACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCC > 1:27200683/1‑68 ACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCC > 1:20904806/1‑68 ACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCC > 1:31989744/1‑68 ACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCC > 1:436725/1‑68 ACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCC > 1:12521748/1‑68 ACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCC > 1:1633633/1‑68 ACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCC > 1:27879862/1‑68 ACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCC > 1:10350106/1‑68 ACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCC > 1:1317635/1‑68 CCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGACCTCACCACCGCTTATACCCCTGCCG > 1:31367331/1‑68 CCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCG > 1:3056114/1‑68 CCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCG > 1:8018625/1‑68 CCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCG > 1:10573677/1‑68 CGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGG < 1:11571450/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTGGGCCGTTTTGAACTCAGCACCTCTTATACCCCTGCCGGG < 1:17033217/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCTGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:10054328/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:23334304/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:24827708/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:28768908/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:23744508/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:29259936/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:24094973/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:14501007/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:2812498/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:22324785/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:21797900/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:743816/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:7244302/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:13550079/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:6152821/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:5553463/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:17550880/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:18357648/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:4685645/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG > 1:3734760/1‑68 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:12201222/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:3216109/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:1179108/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:3207859/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGG < 1:31815721/68‑1 GCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGG > 1:31178563/1‑67 GCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTTTACGCCAGCCGGGTCTGGGGCATACGGGATGCG < 1:9312653/67‑1 TTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATC < 1:6122910/68‑1 CCTGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCA > 1:12871235/1‑67 ctcCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGC < 1:22180628/65‑1 ctcCCGGGTCTGGGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGC < 1:19836310/65‑1 cgGCCTGGTCTCTTGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTTGTGTGAACGCCGGTCAGC < 1:19282831/66‑1 caGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGC < 1:18928681/66‑1 CTGCCGTTTCTGTGGCATACGTGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTTTGAACGCCGGTCAGC < 1:17219900/68‑1 CTGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGC < 1:26018847/68‑1 CTGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGC < 1:807955/68‑1 CTGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGC < 1:26943094/68‑1 CTGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGC < 1:28537011/68‑1 CTGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGC < 1:23926724/68‑1 CTGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGC < 1:28266035/68‑1 CTGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAG > 1:2769997/1‑67 TGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCC < 1:22483066/68‑1 TGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCC < 1:16247256/68‑1 GCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAG > 1:30515112/1‑65 GCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAG > 1:8482718/1‑65 GCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAG > 1:14293503/1‑65 GCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAG > 1:20194674/1‑65 GCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAG > 1:300988/1‑65 CGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGC < 1:3017799/68‑1 CGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTG < 1:18690112/67‑1 CGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTG < 1:14822329/67‑1 CGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTG > 1:25791277/1‑67 CGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTG > 1:893185/1‑67 CGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTG < 1:17752816/67‑1 CGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTG > 1:9033861/1‑67 CGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTG < 1:2215186/67‑1 GGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCG > 1:24694434/1‑68 GGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCG > 1:11284510/1‑68 GGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCG > 1:15553181/1‑68 GGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCG > 1:20415521/1‑68 GGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCG > 1:20635767/1‑68 GGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCG > 1:22933044/1‑68 GTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCGG > 1:4739003/1‑68 GTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCG < 1:10536987/67‑1 GTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCG < 1:11664503/67‑1 GTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCG < 1:6690386/67‑1 GTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCG < 1:16644068/67‑1 GTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCG < 1:19009459/67‑1 GTCTGGGGCATCCGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCG < 1:21927542/67‑1 CGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCcctgccggg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3615000‑3615065 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCCGGGTCTGTGGCATACGGGATGCGGATATCCAGATTCGCTGCGGTGGTGTGAACGCCGGTCAGCCTGCCGG < CP009273/3615271‑3615196 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |