| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3615065 | NA (NA) | 6 (0.020) | 5/94 | NT | 100% | coding (2514/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3615271 | 0 (0.000) | coding (2720/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
TGACCGGCGTTCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTAT > CP009273/3615205‑3615337 | tGACCGGCGTTCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGG > 1:747856‑M2/1‑67 (MQ=255)tGACCGGCGTTCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGG > 1:11759857‑M2/1‑67 (MQ=255)tGACCGGCGTTCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGG > 1:17269149‑M2/1‑67 (MQ=255) cGTTCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGC > 1:6878842‑M2/1‑67 (MQ=255) gTTCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCC > 1:24100113‑M2/1‑67 (MQ=255) gTTCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCC > 1:16553627‑M2/1‑67 (MQ=255) tCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGGATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGC > 1:12705287‑M2/1‑68 (MQ=255) tCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGC > 1:29306574‑M2/1‑68 (MQ=255) tCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGC > 1:22533513‑M2/1‑68 (MQ=255) tCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGC > 1:22855891‑M2/1‑68 (MQ=255) tCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGC > 1:27469969‑M2/1‑68 (MQ=255) tCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGC > 1:5203635‑M2/1‑68 (MQ=255) tCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTG < 1:10972937‑M2/67‑1 (MQ=255) tCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTG < 1:11239317‑M2/67‑1 (MQ=255) tCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTG > 1:16454498‑M2/1‑67 (MQ=255) accGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGggtataagcggtggtgag < 1:25920441‑M2/68‑19 (MQ=255) aGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtgg > 1:27721933‑M2/1‑57 (MQ=255) cGCATCCCGTATGCCCCAGACCCGGCTGGcgtaaaagcggtggtgagttcataacggccgaagctgc < 1:9312653‑M2/67‑39 (MQ=255) tCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagc < 1:20832051‑M2/68‑44 (MQ=255) gCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattc < 1:10917064‑M2/65‑37 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:26297711‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:23334304‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:21797900‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:22324785‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:8928347‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:7628415‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:23744508‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:24094973‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:7244302‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:3216109‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:6679232‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:6152821‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:5415326‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:28184469‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:4685940‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:4685645‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:28768908‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc > 1:3734760‑M2/1‑9 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:10467161‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:17634102‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:17590812‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:11978890‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:18357648‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:17105181‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:14501007‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:15452307‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:16053851‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:1424257‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:13550079‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:12483231‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:12201222‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagatgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:20736632‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacagccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:10054328‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcgatggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:5812310‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagaggtgctgagttcaaaacggcccaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:17033217‑M2/68‑60 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcg < 1:2863805‑M2/68‑61 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcg < 1:11571450‑M2/68‑61 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcg > 1:31787241‑M2/1‑8 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcg < 1:10264992‑M2/68‑61 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc > 1:1668649‑M2/1‑8 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc > 1:19531687‑M2/1‑8 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc > 1:31178563‑M2/1‑8 (MQ=255) cGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcgg > 1:18680304‑M2/1‑7 (MQ=255) cGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcgg > 1:8018625‑M2/1‑7 (MQ=255) cGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcgg > 1:3056114‑M2/1‑7 (MQ=255) cGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcgg > 1:10354505‑M2/1‑7 (MQ=255) cGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcaccgtttcccggtgcaggcgg < 1:1886010‑M2/68‑62 (MQ=255) ggCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggt > 1:2475591‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggt > 1:32005826‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggt > 1:31989744‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggt > 1:436725‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggt > 1:1633633‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCAGGggtataagcggtggtaagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggt > 1:23111155‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCAGGggtataagcggtggggagttcatcacggccgcagctgcgcagcgtttcccggggcaggcggt > 1:2783478‑M2/1‑6 (MQ=255) gCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtc < 1:2842817‑M2/68‑64 (MQ=255) gCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtc < 1:7948288‑M2/68‑64 (MQ=255) cAGGggtataagcggtggtgagttcttaacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtc > 1:5089459‑M2/1‑4 (MQ=255) cAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtc > 1:22145382‑M2/1‑4 (MQ=255) cAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtc > 1:825999‑M2/1‑4 (MQ=255) cAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtc > 1:13349906‑M2/1‑4 (MQ=255) cAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtc > 1:19683920‑M2/1‑4 (MQ=255) cAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtc > 1:5741824‑M2/1‑4 (MQ=255) cAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtc > 1:12666585‑M2/1‑4 (MQ=255) cAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatcgagattcgctgcggtggtgtga < 1:21669377‑M2/67‑52 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgggcagcgtttcccggtgcaggcggtcgg < 1:23641611‑M2/68‑66 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcgc < 1:7097433‑M2/68‑66 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcgc < 1:29768253‑M2/68‑66 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcgc < 1:13111558‑M2/68‑66 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcgc < 1:31279039‑M2/68‑66 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcgc < 1:27966748‑M2/68‑66 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcgc < 1:25629965‑M2/68‑66 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcgc < 1:19114556‑M2/68‑66 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcgc < 1:19665333‑M2/68‑66 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcgc < 1:21217564‑M2/68‑66 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcgc < 1:20354655‑M2/68‑66 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcg > 1:6694347‑M2/1‑3 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcg > 1:2202738‑M2/1‑3 (MQ=255) aGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcg > 1:8882493‑M2/1‑3 (MQ=255) ggggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcgcg < 1:27063208‑M2/68‑67 (MQ=255) ggggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcggtcgcg < 1:22756641‑M2/68‑67 (MQ=255) | TGACCGGCGTTCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTAT > CP009273/3615205‑3615337 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |