| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4311466 = | 471 (1.220) | 23 (0.070) | 11/94 | NT | 6.6% | coding (48/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit |
| ? | CP009273 | 4311493 = | 259 (0.800) | coding (21/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit | |||||
Only 100 of 760 total aligned reads displayed.
TCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAT > CP009273/4311399‑4311532 | cACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTgcg < 1:12297611/68‑1 (MQ=255) cACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTgcg < 1:14779544/68‑1 (MQ=255) agcctgacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccc < 1:14007977‑M1/1‑1 (MQ=255) cctgacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGcc < 1:18163996‑M1/4‑1 (MQ=255) ccTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGcc > 1:21876975/1‑68 (MQ=255) ctgacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCg > 1:9140647‑M1/64‑65 (MQ=255) ctgacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCg > 1:27262599‑M1/64‑65 (MQ=255) cTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCa < 1:23364894/68‑1 (MQ=255) tCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCa > 1:24020214/1‑67 (MQ=255) tCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCa > 1:22692071/1‑67 (MQ=255) tCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCa > 1:17564579/1‑67 (MQ=255) tCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCa > 1:10017305/1‑67 (MQ=255) tCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAg < 1:28598906/68‑1 (MQ=255) gacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGc > 1:2315490‑M1/62‑68 (MQ=255) aTAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGc > 1:11004396/1‑67 (MQ=255) cgcgcgccgacatgattgaattcactattgagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCa > 1:5728273‑M1/60‑67 (MQ=255) cgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGc < 1:6720452‑M1/7‑1 (MQ=255) cgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGc < 1:10165244‑M1/7‑1 (MQ=255) cgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCa > 1:5497602‑M1/60‑67 (MQ=255) cgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCa > 1:18439379‑M1/60‑67 (MQ=255) gcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCACg > 1:5210471‑M1/59‑68 (MQ=255) aGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACg < 1:19934226/68‑1 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:9391867/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:26837259/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:1675932/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:16955621/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:19529260/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:1351543/1‑68 (MQ=255) cggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGa < 1:3962954/67‑1 (MQ=255) cggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGa < 1:22887287/67‑1 (MQ=255) ggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACa > 1:14314435/1‑68 (MQ=255) ggcggTGATGTTTAGCGCGTGCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACa < 1:7054230/68‑1 (MQ=255) gTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCCGCCGGGTGGCTGTGCGCCAGCCCGGACATCCa > 1:26212903/1‑68 (MQ=255) gTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCa > 1:29111573/1‑68 (MQ=255) tGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCa < 1:172822/67‑1 (MQ=255) gATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGt > 1:18895830/1‑68 (MQ=255) gATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGt < 1:27773624/68‑1 (MQ=255) gATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGt < 1:16316528/68‑1 (MQ=255) ttAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTg > 1:25220290/1‑67 (MQ=255) ttAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTg > 1:21652897/1‑67 (MQ=255) ttAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTg > 1:27610522/1‑67 (MQ=255) ttAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTg > 1:13741477/1‑67 (MQ=255) ttAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGGTGGCTGTGCGACAGCACGGACATCCAGTGATg > 1:22302378/1‑67 (MQ=255) aGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCg > 1:12929918/1‑68 (MQ=255) aGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCg > 1:28355626/1‑68 (MQ=255) ttcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCACGGCCGTCCAGTGCTgggggg < 1:29920534‑M1/29‑1 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:3752699/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:8081391/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:851112/1‑68 (MQ=255) gcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:20209233/1‑67 (MQ=255) gcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:23590733/1‑67 (MQ=255) gcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg < 1:31327175/67‑1 (MQ=255) gcgTGCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTGGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGt < 1:31605191/68‑1 (MQ=255) gTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcg < 1:11356134/68‑1 (MQ=255) gTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcg < 1:13228481/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:11983106/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:4306858/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:12108094/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:10737544/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:14541369/68‑1 (MQ=255) ggCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:15185316/1‑68 (MQ=255) CGTGCTGCCTGTTCTGGCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt > 1:19200243‑M1/1‑65 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa < 1:26600372‑M1/66‑1 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa < 1:25968101‑M1/66‑1 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa < 1:29388371‑M1/66‑1 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTAt > 1:6455515‑M1/1‑67 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTAt > 1:22170882‑M1/1‑67 (MQ=255) GTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATc > 1:24178054‑M1/1‑67 (MQ=255) GTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCt > 1:29666839‑M1/1‑68 (MQ=255) actgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGc < 1:24925346‑M1/42‑1 (MQ=255) GCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCGGGCGGGTCGCGGTATCTg > 1:2570434‑M1/1‑67 (MQ=255) TGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCg > 1:4448241‑M1/1‑67 (MQ=255) cAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCa < 1:16000406/68‑1 (MQ=255) tgTTCAGGCGGGTGGGTGTGCGCCAGCACGGAGTTGCAGTTCTGGTGGGTCGCGGTTTCTGAGTGGAt < 1:6069114/67‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCAtt < 1:8721831/66‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCAt < 1:4929879/65‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCAt < 1:21444865/65‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCa > 1:7294874/1‑68 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCa < 1:28841249/68‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:17417964/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:30915206/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:10591795/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:2091489/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:4727688/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:7854998/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:31964183/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:30107636/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCt < 1:20564728/68‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGGCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:18687833/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGATGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc > 1:976265/1‑67 (MQ=255) ggTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTc < 1:12595035/68‑1 (MQ=255) ggTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTc < 1:27993111/68‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:3373173/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:16479928/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:30647214/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:11857890/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCa > 1:17835970/1‑68 (MQ=255) accgcgaccCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCa < 1:6341963‑M1/59‑1 (MQ=255) gtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGa < 1:7534478/68‑1 (MQ=255) gtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGa < 1:15726561/68‑1 (MQ=255) | TCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAT > CP009273/4311399‑4311532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |