| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4311466 = | 471 (1.220) | 23 (0.070) | 11/94 | NT | 6.6% | coding (48/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit |
| ? | CP009273 | 4311493 = | 259 (0.800) | coding (21/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit | |||||
Only 100 of 617 total aligned reads displayed.
GCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTG > CP009273/4311426‑4311559 | cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:14166306/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:8081391/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:13748923/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:21144785/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:27795471/1‑68 (MQ=255) gcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGt < 1:19044657/68‑1 (MQ=255) gTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcg < 1:10186713/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:4925045/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:6621199/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:13109917/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:10737544/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:14541369/68‑1 (MQ=255) tgtcCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCgg < 1:20270376‑M1/64‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:16057966/1‑67 (MQ=255) cgcgctgcCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt < 1:18592906/62‑1 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCCTCCGGGTGGCTGTGAGCCAGCACGGCCCTACAGGGCTGGCGCGTCGCGGTGTc > 1:23014612/1‑68 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGAGATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa < 1:13948197‑M1/66‑1 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt > 1:18017870‑M1/1‑65 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt > 1:25996176‑M1/1‑65 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt > 1:27552454‑M1/1‑65 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt > 1:27953209‑M1/1‑65 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt > 1:10916806‑M1/1‑65 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTAt > 1:22718052‑M1/1‑67 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGACGCGGTa < 1:4258256‑M1/66‑1 (MQ=255) GTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATc > 1:24178054‑M1/1‑67 (MQ=255) GCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGc < 1:29927846‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCGGGCGGGTCGCGGTATCTg > 1:2570434‑M1/1‑67 (MQ=255) ctggcgcacagccaaccggctgaactggcagcacgGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCg > 1:12062825‑M2/36‑68 (MQ=255) TGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCg > 1:28787504‑M1/1‑67 (MQ=255) TGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCg > 1:4448241‑M1/1‑67 (MQ=255) TGCCAGTTCAGCCGGGTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCg > 1:3599264‑M1/1‑67 (MQ=255) atgcacgcagataccgcgacccgccagccctggaggtccgtgctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGc < 1:17704091‑M2/19‑1 (MQ=255) tgTTCAGGCGGGTGGGTGTGCGCCAGCACGGAGTTGCAGTTCTGGTGGGTCGCGGTTTCTGAGTGGAt < 1:6069114/67‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGcct < 1:23273329/65‑3 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCAt < 1:17346215/65‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCAt < 1:28508210/65‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCAt < 1:14828656/65‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCAt < 1:31367458/65‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCa < 1:21447654/68‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCa < 1:11721110/68‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCa < 1:29067317/68‑1 (MQ=255) gccaaccggctgaactggcagcacgGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt > 1:6170078‑M2/26‑68 (MQ=255) gCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt > 1:778664/1‑67 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:6749401/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:10591795/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:9478432/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:20800621/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:32103256/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:30505622/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:11294790/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:2342576/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGCACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:21993657/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGATGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc > 1:976265/1‑67 (MQ=255) ggTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTc < 1:22242030/68‑1 (MQ=255) ggTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTc < 1:16378516/68‑1 (MQ=255) ataccgcgaccCGCCCGCCCGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCt < 1:29583149‑M1/56‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:26483282/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:27115247/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:1225150/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:17113202/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:18237225/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:8625802/67‑1 (MQ=255) cggCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCAt < 1:28312748/67‑1 (MQ=255) ggCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATa > 1:6389802/1‑68 (MQ=255) ggCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATa > 1:19650916/1‑68 (MQ=255) cgcgaccCGCCAGCACGGACATCGAGGGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCAGGCAGTGGTCCATa < 1:16513671‑M1/61‑1 (MQ=255) cgcgaccCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTGAGTGCTCCATa < 1:26221807‑M1/61‑1 (MQ=255) cTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGt > 1:24968337/1‑68 (MQ=255) tgtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTg > 1:4736014/1‑68 (MQ=255) gtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGa < 1:15726561/68‑1 (MQ=255) gtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGa < 1:7534478/68‑1 (MQ=255) gtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGa < 1:23136978/68‑1 (MQ=255) gcgcCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGaa < 1:13529254/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAt < 1:19469773/68‑1 (MQ=255) GCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTc < 1:15240655‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTc < 1:297478‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTc < 1:24756906‑M1/68‑1 (MQ=255) CAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCaa > 1:30897045‑M1/1‑68 (MQ=255) CAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCa > 1:31818222‑M1/1‑67 (MQ=255) CAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCa > 1:25272219‑M1/1‑67 (MQ=255) CAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCa > 1:10033792‑M1/1‑67 (MQ=255) CAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCa > 1:12682269‑M1/1‑67 (MQ=255) CACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCa < 1:30774620‑M1/68‑1 (MQ=255) aCATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCg > 1:5528184/1‑68 (MQ=255) cATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCg > 1:3837174/1‑67 (MQ=255) cgtgctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGgcgcgc > 1:5210471‑M2/11‑68 (MQ=255) tgctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGcgcgcg > 1:26649803‑M2/9‑67 (MQ=255) tgctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGcgcgcg > 1:22343844‑M2/9‑67 (MQ=255) tgctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCAATAGTGAATTCAATCATGTCGGcgcgcg > 1:5728273‑M2/9‑67 (MQ=255) tgctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGAGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGcgcgcg > 1:20124254‑M2/9‑67 (MQ=255) gctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTc > 1:21831052‑M2/8‑68 (MQ=255) gctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTc > 1:7310170‑M2/8‑68 (MQ=255) gctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTc > 1:11938109‑M2/8‑68 (MQ=255) gctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTc > 1:23902810‑M2/8‑68 (MQ=255) ctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCa > 1:8406488‑M2/7‑68 (MQ=255) tggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCa < 1:18798909‑M2/62‑1 (MQ=255) ggcgGGGCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAgg < 1:16712826‑M2/64‑1 (MQ=255) cgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAg > 1:2937154‑M2/3‑65 (MQ=255) cgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAg > 1:9140647‑M2/3‑65 (MQ=255) cgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAg > 1:1750201‑M2/3‑65 (MQ=255) | GCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTG > CP009273/4311426‑4311559 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |