| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 619586 | 247 (0.640) | 11 (0.030) | 6/94 | NT | 5.1% | coding (381/957 nt) | fepB | iron‑enterobactin transporter subunit |
| ? | CP009273 | = 619639 | 202 (0.630) | coding (328/957 nt) | fepB | iron‑enterobactin transporter subunit | |||||
Only 100 of 399 total aligned reads displayed.
GTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTT > CP009273/619520‑619653 | tcgtcgTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAAt > 1:8327213/1‑67 (MQ=255) tcgtcgTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAAt > 1:14862761/1‑67 (MQ=255) tcgtcgTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAAt > 1:4888882/1‑67 (MQ=255) tcgtcgTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAAt > 1:25879040/1‑67 (MQ=255) cgtcgtAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATc < 1:11838025/67‑1 (MQ=255) aaTTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCccgccg < 1:27683579/68‑1 (MQ=255) ttGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGt > 1:19125833/1‑68 (MQ=255) ttGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGt < 1:1802576/68‑1 (MQ=255) ttGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGt > 1:16837493/1‑68 (MQ=255) tgatgaTTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGtt > 1:20495176/1‑68 (MQ=255) tgatgaTTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCAGGtt > 1:6999223/1‑68 (MQ=255) tgatTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTgc > 1:7733335/1‑67 (MQ=255) tgatTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTgc < 1:29077106/67‑1 (MQ=255) tAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTaa < 1:26187146/68‑1 (MQ=255) tAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTaa < 1:21487072/68‑1 (MQ=255) tAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTaa < 1:6725264/68‑1 (MQ=255) aaTGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAAt < 1:25983896/68‑1 (MQ=255) aaTGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAAt < 1:28897227/68‑1 (MQ=255) aaTGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAAt < 1:26703671/68‑1 (MQ=255) aaTGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAAt < 1:9499982/68‑1 (MQ=255) aaTGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAAt < 1:1003267/68‑1 (MQ=255) tGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATACCCGCCGGTTGCGCTAAttt > 1:6169799/1‑67 (MQ=255) gTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTaa > 1:9735743/1‑68 (MQ=255) gTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTaa > 1:25126361/1‑68 (MQ=255) gTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTaa > 1:24208070/1‑68 (MQ=255) gTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTaa > 1:30677388/1‑68 (MQ=255) gTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTaa > 1:556622/1‑68 (MQ=255) gTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCGAATTaa > 1:13908559/1‑68 (MQ=255) tCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTaaa > 1:25502988/1‑68 (MQ=255) cGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTaaaa < 1:22201980/68‑1 (MQ=255) cGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTaaaa < 1:8017977/68‑1 (MQ=255) cGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTaaa < 1:2406480/67‑1 (MQ=255) ggCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCa > 1:19253126/1‑68 (MQ=255) ggCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCa > 1:9186094/1‑68 (MQ=255) cGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGa > 1:17270815/1‑68 (MQ=255) gATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGa < 1:10318566/67‑1 (MQ=255) ggtggAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCg > 1:7838717/1‑68 (MQ=255) tggAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCgg < 1:8778591/67‑1 (MQ=255) aaaGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCAtt > 1:28389779/1‑68 (MQ=255) aaaGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCAtt > 1:28618716/1‑68 (MQ=255) aaaGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCAtt > 1:13634443/1‑68 (MQ=255) aaaGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCAtt > 1:16625762/1‑68 (MQ=255) aGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCAttt > 1:27419754/1‑67 (MQ=255) gCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGCAgccgttgccgcgcaaatgccggatctgattttaattagcgca > 1:20752541‑M1/1‑26 (MQ=255) gCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTgc > 1:7304457/1‑68 (MQ=255) gCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTgc > 1:2112378/1‑68 (MQ=255) gCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTgc > 1:12560471/1‑68 (MQ=255) gCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTgc > 1:20153455/1‑68 (MQ=255) tCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGc > 1:1154045/1‑68 (MQ=255) aTACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCa > 1:6320315/1‑67 (MQ=255) aTACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCa > 1:19913738/1‑67 (MQ=255) tACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAAc > 1:29442872/1‑68 (MQ=255) cAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg > 1:10918281/1‑67 (MQ=255) cAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg > 1:10647650/1‑67 (MQ=255) cAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg > 1:11306585/1‑67 (MQ=255) cAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg > 1:532209/1‑67 (MQ=255) cAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg > 1:3580745/1‑67 (MQ=255) cAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg > 1:13739255/1‑67 (MQ=255) cAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg > 1:15052333/1‑67 (MQ=255) cAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg > 1:20294679/1‑67 (MQ=255) cAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg > 1:26989762/1‑67 (MQ=255) cAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg > 1:19725862/1‑67 (MQ=255) aGTGCCAGCGCCGAAgccgttgccgcgcaaatgccggatctgattttaattagcgcaaccggcgggga > 1:10095923‑M1/1‑15 (MQ=255) aGTGCCAGCGCCGAAgccgttgccgcgcaaatgccggatctgattttaattagcgcaaccggcgggga > 1:22792599‑M1/1‑15 (MQ=255) aGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg > 1:13056429/1‑66 (MQ=255) aGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg > 1:5163795/1‑66 (MQ=255) gCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCttc < 1:14158987‑M2/68‑4 (MQ=255) ccAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAATTCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCttcg < 1:30498196‑M2/68‑5 (MQ=255) ccAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCttcg < 1:15920695‑M2/68‑5 (MQ=255) 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aTCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGt < 1:4747784/67‑1 (MQ=255) | GTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTT > CP009273/619520‑619653 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |