| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3202855 = | NA (NA) | 5 (0.020) | 3/94 | NT | NA | intergenic (+9/+34) | ttdT/tsaD | L‑tartrate/succinate antiporte/tRNA(ANN) t(6)A37 threonylcarbamoyladenosine modification protein; glycation binding protein |
| ? | CP009273 | 3202881 = | NA (NA) | intergenic (+35/+8) | ttdT/tsaD | L‑tartrate/succinate antiporte/tRNA(ANN) t(6)A37 threonylcarbamoyladenosine modification protein; glycation binding protein | |||||
Only 100 of 564 total aligned reads displayed.
ATTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCGCCAGCGGCCAGCGC > CP009273/3202789‑3202922 | ggatctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgg > 1:3304057‑M1/67‑67 (MQ=255)ggatctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgg > 1:13859734‑M1/67‑67 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:10014070/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:26310516/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:26661415/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:28590313/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:17322736/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:5556802/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:6288021/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:1285311/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:1104628/68‑1 (MQ=255) tCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt > 1:11708758/1‑67 (MQ=255) atctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgGGt > 1:21487664‑M1/65‑67 (MQ=255) atctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgGGt > 1:4422981‑M1/65‑67 (MQ=255) ccTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGc < 1:4188606/68‑1 (MQ=255) ctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcggaaaactattgGGTGcc < 1:19793188‑M1/6‑1 (MQ=255) cTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGcc > 1:20456888/1‑68 (MQ=255) cTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGcc > 1:4968547/1‑68 (MQ=255) cTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGATTTAAGTGAGGACGGTGcc > 1:18906553/1‑68 (MQ=255) cGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCgg > 1:25732892/1‑68 (MQ=255) cGTATTGCTGGTGATCACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCgg < 1:153923/68‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGaaa > 1:3517645/1‑68 (MQ=255) gCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAAtt > 1:24860964/1‑67 (MQ=255) gCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAAtt > 1:19472076/1‑67 (MQ=255) tGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc > 1:6889151/1‑67 (MQ=255) ggTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc > 1:6431529/1‑66 (MQ=255) tGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGctct > 1:7910796/1‑67 (MQ=255) tGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGctct < 1:20102667/67‑1 (MQ=255) 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cGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAcc < 1:5274014/68‑1 (MQ=255) cGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGGGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAcc < 1:22891424/68‑1 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa < 1:9285839/67‑1 (MQ=255) cTTACTGAGGATGCCCGTGGTGTTGATTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGATCTCCGTCACCCa < 1:25471611/67‑1 (MQ=255) tACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATa > 1:21287388/1‑68 (MQ=255) cTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGt < 1:1698400/68‑1 (MQ=255) cTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGt < 1:21966558/68‑1 (MQ=255) cTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGt < 1:4600820/68‑1 (MQ=255) tgtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtt > 1:22251576/1‑68 (MQ=255) tgtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtt > 1:12485811/1‑68 (MQ=255) tgtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtt > 1:9813015/1‑68 (MQ=255) gtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGa > 1:17167907/1‑42 (MQ=255) gtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGttt > 1:18254865/1‑68 (MQ=255) gtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGttt > 1:18023424/1‑68 (MQ=255) ggATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtttt > 1:298144/1‑67 (MQ=255) ggATGCCCGTGGTGTTCCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtttt > 1:14764020/1‑67 (MQ=255) aTGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTAc > 1:12049667/1‑67 (MQ=255) aTGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTAc > 1:28250788/1‑67 (MQ=255) aTGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTAc > 1:29170121/1‑67 (MQ=255) tGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACg > 1:22671041/1‑67 (MQ=255) tGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGc > 1:10348118/1‑68 (MQ=255) tGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGc > 1:10594529/1‑68 (MQ=255) tGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGc > 1:1427005/1‑68 (MQ=255) ccGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGc < 1:17694951/68‑1 (MQ=255) ccGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGc < 1:24751979/68‑1 (MQ=255) ccGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGc < 1:24148411/68‑1 (MQ=255) gtggtgTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCg < 1:14059303/68‑1 (MQ=255) gtggtgTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCg < 1:24235740/68‑1 (MQ=255) gtggtgTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCg < 1:30145166/68‑1 (MQ=255) gtgtTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTa > 1:16152682/1‑68 (MQ=255) tgtTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTa > 1:15941648/1‑67 (MQ=255) 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aCGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCgccagcggcca < 1:6608413/66‑1 (MQ=255) | ATTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCGCCAGCGGCCAGCGC > CP009273/3202789‑3202922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |