| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 910575 = | 67 (0.170) | 5 (0.010) | 4/98 | NT | 8.3% | intergenic (‑262/+233) | ybjE/aqpZ | putative transporter/aquaporin Z |
| ? | CP009273 | = 2222782 | 52 (0.150) | intergenic (+238/+135) | yohP/dusC | uncharacterized protein/tRNA‑dihydrouridine synthase C | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACG > CP009273/2222717‑2222848 | gcgGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcg < 1:16833370‑M2/67‑5 (MQ=255) gcgGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcg < 1:27348557‑M2/67‑5 (MQ=255) ggTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgcc > 1:19914122‑M2/1‑61 (MQ=255) ggTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgcc > 1:122601‑M2/1‑61 (MQ=255) ggTGCCCTCGGCTTATACCTTACGGCTACCGGGTAGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgc < 1:12534091‑M2/66‑6 (MQ=255) gCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgcccgc < 1:1098328‑M2/67‑10 (MQ=255) gCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCa < 1:21572980/68‑1 (MQ=35) gCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCa > 1:18173994/1‑68 (MQ=35) gCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCa < 1:23248528/68‑1 (MQ=35) gCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCa > 1:17622119/1‑68 (MQ=35) gCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCa > 1:28706625/1‑68 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAg > 1:31240698/1‑67 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAg > 1:14465256/1‑67 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:7691905/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:191740/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:10627926/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:7852437/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:11192524/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:17444795/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:23496812/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:24001980/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:7817958/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:19398799/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:22918182/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:7085689/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:8757034/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:13744737/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:342426/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:22744437/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:12898257/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:20835351/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:12706441/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:22344425/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCCCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:23238327/68‑1 (MQ=25) cTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGcc < 1:20198410/68‑1 (MQ=35) cGGCTTATCCCTTACGGCTGCCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGccc > 1:19895177/1‑67 (MQ=25) cGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAGGCGCCCTCAGccc > 1:2641543/1‑67 (MQ=25) cGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGccc > 1:12559247/1‑67 (MQ=35) cGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGccc > 1:18480286/1‑67 (MQ=35) cGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGccc > 1:12470406/1‑67 (MQ=35) cGGCTTATCCCATACGGCTACCGGGTCGGGCGCTAGGTAACATCCCTGTAAAACGCCCCCTCAcccaa > 1:2253244/1‑66 (MQ=11) ggCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcac < 1:2647895/68‑1 (MQ=33) ggCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcac < 1:26798472/68‑1 (MQ=33) ggCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcac < 1:1328726/68‑1 (MQ=33) ggCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcac < 1:5014393/68‑1 (MQ=33) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:27074819/1‑68 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:28759659/1‑68 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:6108349/1‑68 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:9205398/1‑68 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:11344261/1‑68 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:17295212/1‑68 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:15335725/1‑68 (MQ=31) cTTATCCCTTACGGCTACCGGGGCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgcccgacccggtagc > 1:5666402‑M2/1‑50 (MQ=255) ttATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGAAACATCCCTGTAAAAcgcgcccgacccggtagcc > 1:13191719‑M2/1‑49 (MQ=255) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:18087847/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:15221196/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:16842609/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:15850783/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:2632218/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:12854270/1‑68 (MQ=31) tCCATGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:24856235/1‑68 (MQ=14) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGCACGCCGCGGCaa > 1:20699911/1‑68 (MQ=255) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGACCGCCTCGGCaa > 1:29121671/1‑68 (MQ=18) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:6273189/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:2436267/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:6933588/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:5595978/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:21377796/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:31623913/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:29757003/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:28709836/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:13841483/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTAGGCaa > 1:4259312/1‑68 (MQ=18) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCACGGCaa > 1:6977316/1‑68 (MQ=18) cccTGGAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:23088589/1‑68 (MQ=18) ccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAAt > 1:21067429/1‑68 (MQ=35) ccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAAt > 1:17622928/1‑68 (MQ=35) ccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAAt > 1:28207221/1‑68 (MQ=35) tGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAAttt < 1:107684/68‑1 (MQ=35) gTAAACCGCGCCCTCAGCCCCCCTCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTGCAGGGCACGCCTCGGCAAtttt > 1:14627353/1‑68 (MQ=11) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:30089959/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:8961525/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:10383249/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:11613108/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:23543119/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:25241459/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:6230298/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:25655276/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:1497075/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:13799227/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:30995046/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:1433843/1‑67 (MQ=35) aaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTACAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGAc > 1:28295271/1‑68 (MQ=25) aaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCACGTGGGCTGCCTCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGAc > 1:28077195/1‑68 (MQ=255) aaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGAc > 1:12045824/1‑67 (MQ=35) aaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGAc > 1:10307581/1‑67 (MQ=35) aCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCATTTTTGACg > 1:4111480/1‑67 (MQ=25) aCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACg > 1:5416664/1‑67 (MQ=35) aCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACg > 1:13639903/1‑67 (MQ=35) aCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACg > 1:19479700/1‑67 (MQ=35) | TGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACG > CP009273/2222717‑2222848 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |