| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2636459 | 348 (0.900) | 16 (0.060) | 6/84 | NT | 5.1% | intergenic (‑256/+29) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | CP009273 | = 2636469 | 332 (1.150) | intergenic (‑266/+19) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
Only 100 of 783 total aligned reads displayed.
AATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGG > CP009273/2636403‑2636536 | tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:5281787‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:1771266‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:3947488‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:19273457‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:1954651‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:14701569‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:27606740‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:29410423‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:30016561‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:3034624‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:11466143‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:30187818‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:8901921‑M2/68‑4 (MQ=255) atTGACCAGACAATTGCAACTTAATACATCATTCATAAAACATTACGCCAAGGTACATAAAGTAaccg < 1:481124‑M2/68‑5 (MQ=255) ttGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgt < 1:22472400‑M2/68‑6 (MQ=255) ccAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcg < 1:5020559‑M2/68‑10 (MQ=255) ccAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcg < 1:1731222‑M2/68‑10 (MQ=255) ccAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcg > 1:17930819‑M2/1‑59 (MQ=255) ccAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcg < 1:5930835‑M2/68‑10 (MQ=255) cAATTGCAACTTAGTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGGACATAAAGTAaccgtggcgtaat > 1:13012778‑M2/1‑54 (MQ=255) aaTTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATgg < 1:8412532/68‑1 (MQ=255) ttGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCt < 1:15230346/68‑1 (MQ=255) ttGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCt < 1:19973617/68‑1 (MQ=255) ttGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCt < 1:13851044/68‑1 (MQ=255) aaCTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCa > 1:18862963/1‑68 (MQ=255) aTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGc < 1:18162485/68‑1 (MQ=255) aTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGc < 1:16801561/68‑1 (MQ=255) aTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGc < 1:3314302/68‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCt < 1:22949156/68‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCt < 1:26134907/68‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCt < 1:11091958/68‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCt < 1:21976936/68‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCt < 1:29736131/68‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCt < 1:2155836/68‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCt < 1:21827276/68‑1 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACTGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt > 1:26951864/1‑68 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGcat > 1:28126123/1‑66 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt > 1:25874575/1‑68 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt > 1:26627591/1‑68 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt > 1:7523598/1‑68 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt > 1:21171276/1‑68 (MQ=255) tcattcatAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTaa > 1:4165305/1‑68 (MQ=255) ttcatAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaag > 1:6265685‑M2/1‑33 (MQ=255) ttcatAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGt < 1:22832776/68‑1 (MQ=255) ttcatAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGt < 1:24275680/68‑1 (MQ=255) aaaaCATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATg < 1:23519397/68‑1 (MQ=255) aaaaCATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATg > 1:10011507/1‑68 (MQ=255) aaaCATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATgg < 1:31890845/68‑1 (MQ=255) aaCATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGc < 1:18579944/68‑1 (MQ=255) aaCATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGc < 1:29178806/68‑1 (MQ=255) aTTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTc > 1:11669173/1‑68 (MQ=255) ttACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCa < 1:25184509/68‑1 (MQ=255) tcGCCAGGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTTTCCGACCGCTTTAATGTGGATGGCTTCAcc < 1:5568294/67‑1 (MQ=255) aCGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAcc < 1:23614028/68‑1 (MQ=255) aCGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAcc < 1:30734564/68‑1 (MQ=255) aCGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAcc < 1:25538259/68‑1 (MQ=255) aCGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAcc < 1:8164129/68‑1 (MQ=255) aCGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAcc < 1:16242038/68‑1 (MQ=255) 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1:15401215/1‑67 (MQ=255) aaGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTAc > 1:12444508/1‑67 (MQ=255) aaGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTAc > 1:11878243/1‑67 (MQ=255) aaGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTAc > 1:15863908/1‑67 (MQ=255) aaGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTAc > 1:8596413/1‑67 (MQ=255) aaGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTAc > 1:20567871/1‑67 (MQ=255) aaGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTAc > 1:20819337/1‑67 (MQ=255) aaGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTAc > 1:4428855/1‑67 (MQ=255) aaGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTAc > 1:23216945/1‑67 (MQ=255) aaGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTAc > 1:27206061/1‑67 (MQ=255) aaGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTAc > 1:28574529/1‑67 (MQ=255) 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aaCCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAg < 1:1020116/67‑1 (MQ=255) | AATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGG > CP009273/2636403‑2636536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |