New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4512275 = | 356 (0.750) | 35 (0.090) | 13/92 | NT | 10.0% | coding (1637/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
? | CP009273 | 4512318 = | 337 (0.860) | coding (1594/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4512351‑4512275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgcatcggTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGGTTTCTT > CP009273/4512318‑4512383 CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGC > 1:20953905/1‑68 CATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGC > 1:19320029/1‑68 ATCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCG > 1:31526390/1‑68 TCTGTCTTAGGGTAAGGATGTTTCGTTACTCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTGTACTGGCGCGT < 1:4532789/68‑1 TCTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT < 1:30022264/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGTGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:13158914/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:6008462/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:28150108/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:19683371/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:20819575/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:9120691/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:3816511/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:16145028/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:37058506/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTG < 1:34343029/68‑1 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT > 1:6797829/1‑67 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT > 1:24803343/1‑67 CTGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGT > 1:38729134/1‑67 TGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGC < 1:1540893/68‑1 TGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGC < 1:1195619/68‑1 TGTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGC < 1:12850433/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:22888475/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA < 1:11469513/68‑1 GTCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:38833198/1‑68 TCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:9913097/1‑67 TCATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCA > 1:21235465/1‑67 CATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATC < 1:26057328/68‑1 CATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATC > 1:13747496/1‑68 CATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATC > 1:7530077/1‑68 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG < 1:16221265/68‑1 ATACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG < 1:21769516/68‑1 taaGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:19004214/65‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:5778034/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:30704744/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:31261951/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:37831355/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:2512425/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:13336660/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:18140287/68‑1 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:6245423/1‑67 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:35595767/1‑67 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:39080846/1‑67 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCG > 1:10830687/1‑67 TACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTATCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG < 1:18237566/68‑1 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:29877047/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:19770336/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:28879018/1‑67 ACGGTAAGCATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:9723847/1‑67 ACGGTAAGCATGTATCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCCTTTCTACTGGCGCGTGCATCGG > 1:21054610/1‑67 ATGTTTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACG < 1:36321214/67‑1 TTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACA < 1:15796635/68‑1 TTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACA < 1:24267141/68‑1 TTCGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACA < 1:20889807/68‑1 CGTTAATCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATG < 1:22245677/68‑1 TCACCGCTGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:26446595/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:11190240/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:1000116/68‑1 TCACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCAACTGGCGCGTGCATCGGTTATTAACGAAACATGCTTACC < 1:22699400/68‑1 TCACCGATGCACGTTGCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:10500762/68‑1 TCAACGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACC < 1:27524678/68‑1 ACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGT < 1:3994752/68‑1 ACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGT < 1:32043287/68‑1 ACCGATGCACGTTTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGT < 1:16801871/68‑1 ACCGATGCACGTGTCGCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGT < 1:2579851/68‑1 CGTTTCGCGGGCGCTTCTACTGGCGCGGGCAGCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGAT < 1:37644793/68‑1 TTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:30437415/68‑1 TTCTCGGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCT < 1:13572653/68‑1 GGGCGTTTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGG < 1:2746899/68‑1 TTCTACTGGCGCGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTG < 1:14983518/68‑1 CGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTA > 1:16991491/1‑68 CGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTA > 1:34645968/1‑68 CGTGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTA > 1:4825397/1‑68 TGCATCGGTGATTAACGAAACATGCTTACCGTATGACAGATGCTTCAGGGCACTGGTAACCTGGTAGG > 1:18386229/1‑68 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |