| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 64557 | 326 (0.690) | 20 (0.050) | 8/94 | NT | 6.1% | coding (1224/2352 nt) | polB | DNA polymerase II |
| ? | CP009273 | = 64577 | 338 (0.850) | coding (1204/2352 nt) | polB | DNA polymerase II | |||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/64483‑64557‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agccctggcGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT < CP009273/64577‑64511 ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG < 1:32323465/68‑1ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG < 1:35846997/68‑1ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG < 1:18671307/68‑1ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG < 1:19134657/68‑1ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG < 1:528968/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:30466584/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:2716744/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:10694514/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:10073561/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTAAAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:28916413/1‑67 AGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAA > 1:14193807/1‑64 AGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACAAGCACTGAATCATAAACCCC > 1:8991721/1‑68 AAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:2011481/1‑68 AAAGGTGCGGATGATCCACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCCGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:5900523/1‑68 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGGGTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:23878865/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:26932360/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:32782404/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:39488377/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:23382666/1‑67 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:36490263/1‑67 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:35298233/1‑67 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:12176118/1‑67 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:3999629/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCGCTGGC < 1:16407704/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:32536989/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:25809452/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:2099507/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:7820506/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:25286842/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:11854227/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:35798291/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:6794737/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:23899152/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:39005760/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:642842/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:1495525/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:34280274/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:35067804/1‑67 GACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGA > 1:33502397/1‑68 GGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGGGACGTGGTGGGTTC > 1:12900842/1‑67 GGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCGGGCGGCTTCGTGATGGCTTC > 1:37022396/1‑67 AGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCCCGGCCAGGGCTTTAT > 1:7290770/1‑68 CACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGG > 1:38906485/1‑68 CACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGG > 1:22385247/1‑68 CACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGG > 1:22027552/1‑68 CACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGG > 1:32723094/1‑68 CACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGG > 1:18957764/1‑68 ACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGT > 1:10319953/1‑68 ACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGT > 1:24139137/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCTGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:14450320/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:33380637/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:4243203/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:32159967/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACGAT > 1:16497005/1‑68 AGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAA > 1:4621210/1‑68 AGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAA > 1:36745624/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:30747236/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:15567659/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:21715490/1‑68 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:1110970/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:16684367/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:17426537/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:18504065/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:34155440/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:19355184/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:8588220/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:26170903/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:27564446/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:202362/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:13741842/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:18336786/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:17639876/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:11742365/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:31182032/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:23051755/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:29929327/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:36907591/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:16207908/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:5832570/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:156887/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:16022592/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGAGTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGCCTATAAca > 1:1319834/1‑65 CTGGCGGCTACGTGTTGGATTCAGGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:12223324/67‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:38367481/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:38195580/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:37925286/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:29761541/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:2919063/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:37558003/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:3192662/68‑1 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:6581422/1‑64 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:37753711/1‑64 CGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGGTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT > 1:27081133/1‑68 CGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT > 1:6094236/1‑68 CGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT > 1:29544877/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |