New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 442683 | 373 (0.790) | 42 (0.110) | 15/90 | NT | 10.4% | coding (479/891 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
? | CP009273 | = 442722 | 422 (1.110) | coding (440/891 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/442606‑442683 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgctgcgccgcCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATCT < CP009273/442722‑442657 TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC < 1:15725244/68‑1 TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCGGAAGATAGCCAGCAGGATC < 1:5228660/68‑1 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT < 1:5729486/68‑1 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:10279123/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:20771442/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:39482777/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:12116193/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:2518393/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:30850700/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCGGCCACAGGCTGAAGAGAGCCAGCAGGATCGCT < 1:4168326/68‑1 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCTACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:23565655/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCGCAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:8363239/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:7921973/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:35092614/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:19053907/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:4716984/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:6582243/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:1227839/1‑67 GGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGC < 1:1666367/67‑1 GGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGC < 1:1005050/67‑1 AAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC < 1:35984044/67‑1 AATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGC < 1:34202514/68‑1 ATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGC < 1:36428209/67‑1 GAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGGGCTCGGgt > 1:36182237/1‑62 AGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGT > 1:12925037/1‑68 AGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGT > 1:11648855/1‑68 GGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGT > 1:7707020/1‑68 GGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGT > 1:20789443/1‑68 GCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGT > 1:39613831/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAG > 1:34677382/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAG > 1:1318128/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAG > 1:29046156/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGGGATCGGCGGCTGGGCGGGAACGGGTGAG > 1:20904427/1‑68 AGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGT > 1:37217006/1‑67 AGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGT > 1:23683474/1‑67 AGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATAGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGT > 1:32915843/1‑67 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTTACCGGTGAGTTag > 1:8416750/1‑66 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGTGTTCG > 1:20043010/1‑68 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACGGTGCGGTAACCGGTGAGTTCG > 1:10813494/1‑68 AGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGC > 1:9569354/1‑68 AGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCGACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGC > 1:8207233/1‑68 GATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGGTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCG > 1:26000611/1‑68 GATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCG > 1:4458538/1‑68 GATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGGGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCG > 1:22858659/1‑68 ATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCG > 1:9194177/1‑67 ATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCG > 1:8641692/1‑67 CCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCA > 1:10664585/1‑68 AGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGcc > 1:28733654/1‑66 ATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGAT > 1:32639066/1‑65 CGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTG < 1:14755008/67‑1 CGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:28245688/1‑66 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGCTCCT > 1:3281497/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCT < 1:27273665/68‑1 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:6249475/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:17930688/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:15874653/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:38122804/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:15310563/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:26253584/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:22056667/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:29758417/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:14002121/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:298669/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:24679086/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:30813912/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:33435349/1‑65 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGG < 1:21794783/68‑1 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:8270897/1‑67 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:4543451/1‑67 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:32250803/1‑67 TGCGCCGCCGGGGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:26892872/1‑67 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:15209230/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:29259755/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:11069078/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGGGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:11056397/68‑1 CGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:12227653/67‑1 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:37366037/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:30448839/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:18887511/1‑68 CGCGGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTAT < 1:38356892/67‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCTGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:21591484/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:13694085/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:26384290/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:27548444/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:27665722/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:28807310/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:29094863/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:30271956/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:24962749/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:7858327/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:39445774/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:23684216/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:34995388/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:5744396/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:35273568/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:20680821/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:36749524/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATC < 1:2008955/68‑1 CGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTAT < 1:38656670/67‑1 GCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATCT < 1:33726033/68‑1 TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/442606‑442683 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgctgcgccgcCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATCT < CP009273/442722‑442657 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |