| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 725679 | NA (NA) | 6 (0.010) | 5/100 | NT | NA | coding (641/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | = 725702 | NA (NA) | coding (664/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725608‑725679‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtggaACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG < CP009273/725702‑725637 GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:20804109/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:16631540/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTG < 1:29424942/67‑1GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTG < 1:7148430/67‑1GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTG < 1:13321321/67‑1GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGGGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTG < 1:21520560/67‑1 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:8078948/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:19668134/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:772614/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:27686896/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:16654338/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:26216046/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:20503464/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:28432126/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:29001037/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:29358505/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:26039283/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:22219975/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:9365211/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:30691131/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:5960949/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:33447186/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:3352273/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:11879371/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:453418/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:11757398/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:4312488/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:11495156/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:37884590/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:10144070/1‑68 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:6410600/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:36337552/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:22860599/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:22180280/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:10770503/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:8354662/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:8487634/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:19718697/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:1587094/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:17269482/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGGGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:11635175/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGGGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:9651440/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGAAGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:9346713/67‑1 ggGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:4674394/65‑1 gcGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCGGGTGG < 1:1187429/65‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGGCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:4076904/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:12692903/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:12713774/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:31932037/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:38911970/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:13571151/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:21675464/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:27796290/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:7653608/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:17238259/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:8304511/67‑1 TGCGGGAAGCGGCTGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCTGGTACTGACCGGGCTGGTGGA < 1:35253028/67‑1 TGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA < 1:13543334/67‑1 TGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA > 1:36442355/1‑67 CGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGT < 1:16336655/68‑1 CGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGT < 1:37524743/68‑1 CGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGT < 1:20967010/68‑1 AGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGT < 1:1437465/68‑1 CTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:33924938/67‑1 CTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:14287810/67‑1 CGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAG < 1:22685748/68‑1 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:38821516/67‑1 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGGGGAACGTCTGGGTGCGCCCGAAGCGGGCCACCAGCCCGGT < 1:33371057/68‑1 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:4389524/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:79825/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:4657248/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:2991246/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:34009104/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:11671050/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |