| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3293574 = | 570 (1.200) | 28 (0.070) | 9/90 | NT | 6.2% | coding (250/303 nt) | yhbQ | GIY‑YIG nuclease superfamily protein |
| ? | CP009273 | 3293608 = | 387 (1.010) | coding (284/303 nt) | yhbQ | GIY‑YIG nuclease superfamily protein | |||||
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3293649‑3293574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tctgcaaacccCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCAGCGCGTCA > CP009273/3293608‑3293674 CTGGTTTAGTATCACGAGCAGTTCAATCCCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:35075363/68‑1CTGGTTGAGTTTCACGAGCATTTCAATCGCTTTTTTTCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTTAGAGCTCT < 1:1018268/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGGCTGCTTAACAGCTC < 1:31624526/67‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:33901985/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:32174378/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTC < 1:14661203/67‑1CTGGTTGAGTACCACGCGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:26802443/68‑1 gGGTTGAGTATCTCGAGGCCTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACCGCTCTG < 1:28564908/67‑1 gGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGCTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:13733367/67‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCTATCGCTTTTTATCTCCGGGGGTTGCACACTGCATAACAGCTCTG < 1:30357186/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCTATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:37168660/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:2956152/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:31218156/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:29280976/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:21735386/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:18788361/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:18375589/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:33084834/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:11051101/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:35984689/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:9032047/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:112609/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:7718044/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:7252975/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:6610051/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:39082443/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:38393151/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:15988271/68‑1 TGGGTGAGTATCACGAGCAATTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:2379273/68‑1 GTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCA > 1:7922887/1‑68 TTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:4942733/1‑68 TTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:39455403/1‑68 TTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:21009672/1‑68 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:28864989/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:1060911/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:25991883/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:19912048/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:16169079/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:16069583/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTAGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:11634136/1‑67 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:8063589/68‑1 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:26085665/68‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:20842984/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:2013098/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:20007852/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:27712281/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:25520232/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:5791967/61‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:20789997/61‑1 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:38664660/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:12466939/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:7658113/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:10844970/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:22921408/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:2342467/1‑65 ATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCC < 1:12692557/66‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:37709048/68‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:4285955/68‑1 CAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCG < 1:8386551/68‑1 CAATCGCTTTTAATCTCCCGGGTCTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCG < 1:22519125/68‑1 CGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGAT < 1:39344244/68‑1 CGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGAT < 1:24485402/68‑1 CGGGGTTTGCAGACCGCTTAACCGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGAT < 1:35752163/68‑1 GGGGTTTGCAGACTGCTTAACCGCGCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATA < 1:34460866/68‑1 GGGGTTCGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATA < 1:36909915/68‑1 CTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCA < 1:2271786/65‑1 GCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCA > 1:24634440/1‑67 GCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCA > 1:15627050/1‑67 AAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCAGC > 1:5944293/1‑67 AAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTAATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCAGCG < 1:6191551/68‑1 AAACCCCAGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCAGCG < 1:33674746/68‑1 AACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCATGCCGGTAACGCAATTCTGCGC > 1:37402300/1‑68 AACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCAGCGC < 1:28116615/68‑1 AACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCAGCGC > 1:27080796/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |