| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3630213 | 304 (0.640) | 48 (0.130) | 22/84 | NT | 17.5% | coding (558/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase |
| ? | CP009273 | = 3630199 | 224 (0.630) | coding (572/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3630134‑3630213‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacccgcgcgggtcTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < CP009273/3630199‑3630133 GCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAG > 1:4008547/1‑67 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGCGCAACGGTTTATGCCGGGTGAATGGGACCAGg > 1:39512060/1‑66 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA > 1:21450182/1‑67 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA < 1:29270455/67‑1 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA < 1:8110895/67‑1 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA < 1:1846193/67‑1 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAG < 1:11172168/66‑1 ACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACC < 1:1879347/68‑1 CCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCC < 1:1610772/68‑1 CGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCG < 1:36770934/68‑1 CGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCG < 1:29235668/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:24258532/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:618494/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:15031209/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:1448102/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:18042126/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:8853020/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:35416366/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:28868228/68‑1 CCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:6653174/1‑67 CACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGC > 1:1875140/1‑68 ACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCG < 1:6012003/68‑1 ACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCG < 1:14905890/68‑1 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:26279375/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:35256450/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG < 1:11438772/68‑1 CCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCCGACCCGCGCGGGTC > 1:23136869/1‑68 CCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGT < 1:16266288/67‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:37947280/68‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:1331079/68‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:25253683/68‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:6833054/68‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:10294724/68‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:3129906/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGACCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:39127008/68‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGCGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCAC < 1:23450351/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTGTGGGGCCA‑GTCAC > 1:38963547/1‑67 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCAC < 1:14266611/67‑1 CTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGGGGGTCTGGTGCCA‑GTCAC > 1:1081647/1‑65 CTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGGTGCGA‑TTCAC > 1:10009683/1‑65 CTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGGCGGGTGCCC‑TTCACTat > 1:8782912/1‑66 TCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCT > 1:19370518/1‑67 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGC < 1:34176232/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGC < 1:16179858/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGACTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGC < 1:10320857/68‑1 CTTCGACCAACGGTTTATCCAGAGTCAATGCCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGC < 1:10276282/68‑1 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCA < 1:23735759/68‑1 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCA > 1:10844160/1‑68 TTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TCCACTCTGCATAAACCGTTGCT < 1:9454931/67‑1 TGCAGAGTGAATGGCACCAGGCCCGCGCGGGTCGGGTGCGG‑TTCACTCGGCATAAACCGTTGGTCGAA > 1:10620028/1‑68 TGCAGAGGCAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAA < 1:33858074/68‑1 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAACCCGTTGCTCGAAG > 1:14950225/1‑68 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:37727409/1‑68 CAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGA > 1:29290154/1‑68 AGAGCGAATGCCACCAGACCCGCCCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGA < 1:37512347/67‑1 gtcAATGGCACCACACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAG < 1:31819379/62‑1 GTGAATGGCACCAGCCCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGT < 1:37751905/66‑1 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGT < 1:29570575/66‑1 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGT < 1:23389432/66‑1 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTGGCTCGAAGAGTT > 1:39255506/1‑67 GTGAATGGCACCACACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAG < 1:31787840/65‑1 GTGAAGGCCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTAACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAG < 1:27590190/65‑1 ATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGG < 1:33011439/68‑1 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:36497171/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:9664439/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:32949062/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:25646348/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGGCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT < 1:8888735/68‑1 TGGCACCAGACCCGCGCGCGTCTGGGGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:15408716/1‑68 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:230577/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:22506693/1‑66 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTGTGGATAATCCGTTGCTGGAAGAGGTACAGGTGCgg > 1:12138095/1‑66 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTG > 1:32800155/1‑68 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTG > 1:38829673/1‑68 AGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCG > 1:19469616/1‑68 ACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCGCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCtg > 1:8870663/1‑65 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTTCAGGTGCTGGCGGGC > 1:12600568/1‑68 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC < 1:14385925/68‑1 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC > 1:26251133/1‑68 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC < 1:11898534/68‑1 CCGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCG < 1:8376296/68‑1 CGCGCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGT > 1:11819913/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:22080013/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:20198800/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:26224477/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC < 1:16493423/68‑1 GCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:34931063/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:37201342/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:3072022/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGG < 1:30757167/67‑1 GGGTCTGGTGCCATTTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC < 1:38805526/67‑1 TCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG < 1:34015378/67‑1 TCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:31922672/1‑67 TCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:28848542/1‑67 TCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:12594690/1‑67 TCTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:5941372/1‑67 CTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < 1:28057055/68‑1 CTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGC < 1:6856112/67‑1 CTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:12146869/1‑66 CTGGCGCCA‑TACACTCTGCAAAAACCGTTGCGCGAAGAGTAACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGC < 1:37674973/67‑1 GCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3630134‑3630213‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacccgcgcgggtcTGGTGCCA‑TTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGCC < CP009273/3630199‑3630133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |