| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3701734 = | NA (NA) | 17 (0.040) | 8/96 | NT | 7.8% | intergenic (‑669/+242) | dppA/proK | dipeptide transporter/tRNA‑Pro |
| ? | CP009273 | 3701742 = | 236 (0.500) | intergenic (‑677/+234) | dppA/proK | dipeptide transporter/tRNA‑Pro | |||||
Only 100 of 408 total aligned reads displayed.
TCAACGAGCAGGCTTTTTTGCATCTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGggaggttc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3701791‑3701734‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG > CP009273/3701742‑3701816 TCAACGAGCAGGCTTTTTTGCATCTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGGGAGTTTCTa > 1:18777760/1‑67 AACGAGCAGGCTTTTTTGCATCTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGGGAGGTTCTCAT < 1:17032720/68‑1 GAGCAGGCTTTTTTGCATCTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGGGAGGTTCTCATCCT < 1:6150393/68‑1 AGGCTTTTTTGCATCTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCGCCGGGGGCAGGGAGGTTCTCATCCTCA < 1:21373414/66‑1 TTTTTTGCATCTGCAGCCCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGGGAGGTTCTCATCCTCATGAGC < 1:17501465/67‑1 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGATTTTGG > 1:11686159/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:10801860/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:15927660/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:22430226/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTGTCGAATTTGG > 1:16586600/1‑68 AGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:33963999/1‑67 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGGCGGCGCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:27105511/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:24450208/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:20888470/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:17993158/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:17166546/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:22889761/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:23066634/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:36821674/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:8110357/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:10470424/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGT < 1:35494473/67‑1 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGT < 1:38113242/67‑1 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGT < 1:12412413/67‑1 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGT < 1:5646684/67‑1 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGT < 1:1839752/67‑1 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGT < 1:10010062/67‑1 TTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGG > 1:9488893/1‑68 TTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCG < 1:37580638/67‑1 TTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGT < 1:216480/65‑1 TCTCTTCCTCTTTAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:35262241/68‑1 TCTCATCCTCCTGCGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGct < 1:28588494/68‑3 TCTCATCCTCATGTGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:29103577/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCATATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:31601465/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCATGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:30762093/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:1277205/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:38456814/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:3712820/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:36207538/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT > 1:13388088/1‑68 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:35351710/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:34892937/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:34283369/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:20288935/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:33745923/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:33023724/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:13773247/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:39614808/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:4403788/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:4528810/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:4817899/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:54773/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:5908677/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:11347361/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:6254433/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:6956765/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:7364510/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:7901040/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:11167287/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:8329812/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:8884397/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:11076008/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:32281494/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:21242301/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:19663627/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:22022737/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT > 1:15589747/1‑68 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:22621285/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:23586677/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT > 1:1484271/1‑68 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:2477610/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:25131031/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:25357753/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:259878/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:26238560/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:14284815/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:31270698/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:30549918/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:2979913/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:29481590/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:28185598/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:27901834/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:26666085/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGG < 1:32849240/67‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGG < 1:38809712/67‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTATTCGAATTTGGTCGGT > 1:6403957/1‑68 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATCCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:863799/68‑1 CTCATCGTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:15506055/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:671413/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:20105791/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:3468189/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:35903098/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:1510481/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:39249009/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:11590073/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:2564901/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:2740993/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTCAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:23903734/68‑1 CTCATCCTCAAGCGCTGCAGAAGCAAAAAAGCCTGCTCGTTAAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:6578110/68‑1 CTCATCCTAATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:129389/68‑1 TCAACGAGCAGGCTTTTTTGCATCTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGggaggttc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3701791‑3701734‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG > CP009273/3701742‑3701816 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |