| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2811634 | NA (NA) | 77 (0.300) +AATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAAC |
4/60 | NT | 27.7% | intergenic (‑1/+198) | argY/argV | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
| ? | CP009273 | = 2811844 | 376 (0.790) | noncoding (65/77 nt) | argV | tRNA‑Arg | |||||
Only 100 of 517 total aligned reads displayed.
CGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGT > CP009273/2811576‑2811701 | cGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAac < 1:39256504/68‑1 (MQ=31)cGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAac < 1:24627569/68‑1 (MQ=31)cGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAac < 1:13283328/68‑1 (MQ=31) gAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAact > 1:34003572/1‑68 (MQ=33) aaCCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAactt > 1:5103298/1‑68 (MQ=35) aCCTCCGACCGCTCGTTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAactt < 1:12608373/67‑1 (MQ=25) aCCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAactta > 1:17226645/1‑68 (MQ=35) aCCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAactt > 1:30468894/1‑67 (MQ=35) aCCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAactt < 1:3854186/67‑1 (MQ=35) aCCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAactt < 1:16113837/67‑1 (MQ=35) ccTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAactt > 1:1442858/1‑66 (MQ=35) cTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAacttact < 1:16753543/68‑1 (MQ=39) ttCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGAtt < 1:24435210/66‑1 (MQ=255) gCCGAGTACTCTATCCATCTGAGCTAAGCAAGGATCCGGGAACATACTTTAATGCAGATTTTTTGAt > 1:3478025/1‑67 (MQ=16) gCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGATGGTTAGTTTAGTGGAGATTTTTTGAt > 1:6199984/1‑67 (MQ=14) gCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGAt > 1:37653243/1‑67 (MQ=255) gCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGAt > 1:38190135/1‑67 (MQ=255) gCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGAt > 1:4705984/1‑67 (MQ=255) gCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGAt > 1:39554004/1‑67 (MQ=255) gCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAATTAATTTACTGCAGATTTTTTGaa > 1:16993325/1‑66 (MQ=17) gCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAATTAATTTACTGCAGATATTTTTAt > 1:31290893/1‑67 (MQ=11) cGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATAcc < 1:32485638/68‑1 (MQ=255) cGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATAcc < 1:2429609/68‑1 (MQ=255) cGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATAcc > 1:27290345/1‑68 (MQ=255) cGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATAcc > 1:38976605/1‑68 (MQ=255) cGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATAcc < 1:10470616/68‑1 (MQ=255) cGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATAcc > 1:11457948/1‑68 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGTGATACGGATTCATCTGTAAACTTACTTTACTGAAGATTTTTTGATACCGcta < 1:12095729/67‑1 (MQ=21) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGctac < 1:5513537/68‑1 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGctac < 1:24867891/68‑1 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGctac < 1:5978682/68‑1 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGcta < 1:2002779/67‑1 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGcta < 1:36783630/67‑1 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGcta < 1:7441003/67‑1 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGcta < 1:32347229/67‑1 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGcta < 1:34463728/67‑1 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGct < 1:24079342/66‑1 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACAGct > 1:21454133/1‑66 (MQ=255) tctATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGctacta > 1:11704278/1‑68 (MQ=255) tctATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGctacta > 1:26114776/1‑68 (MQ=255) tATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTaaa < 1:19172724/68‑1 (MQ=255) aTCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTaaa > 1:3010889/1‑67 (MQ=255) aTCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTaaa > 1:19756119/1‑67 (MQ=255) aTCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTaaa > 1:11138590/1‑67 (MQ=255) aTCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTaaa > 1:10107365/1‑67 (MQ=255) ccAGCTGAGCTACGGATTCATCGGGAAACTTACTTAACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGcc > 1:35169157/1‑68 (MQ=255) ccAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGACACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATTCCGCTAGTAACGcc > 1:23697473/1‑68 (MQ=21) ccAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGcc > 1:9435659/1‑68 (MQ=255) ccAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGcc > 1:681292/1‑68 (MQ=255) ccAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGcc > 1:35519139/1‑68 (MQ=255) ccAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGcc > 1:36477439/1‑68 (MQ=255) ccAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGcc > 1:2308662/1‑68 (MQ=255) ccAGCTGAGCTAAGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGcc > 1:23235352/1‑68 (MQ=255) gCTGAGCTACGGATGCATCGGGAACATTACATTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTa > 1:18683742/1‑68 (MQ=21) gCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTa > 1:2935668/1‑68 (MQ=255) gCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTa > 1:10775847/1‑68 (MQ=255) gCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTa > 1:36145306/1‑68 (MQ=255) gCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGAAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTa > 1:20827290/1‑68 (MQ=255) tGAGCTACGGATTCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGt < 1:18239615/65‑1 (MQ=255) tGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGt < 1:4092174/65‑1 (MQ=255) tGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGt < 1:2839303/65‑1 (MQ=255) tGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGt < 1:9015963/65‑1 (MQ=255) tGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGt < 1:35736678/65‑1 (MQ=255) tGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATc < 1:22339018/68‑1 (MQ=255) tGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATc > 1:16228186/1‑68 (MQ=255) tGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATc > 1:38779943/1‑68 (MQ=255) tGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATc > 1:2861098/1‑68 (MQ=255) tGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATc < 1:27616054/68‑1 (MQ=255) tGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAACCCGTAta > 1:18346464/1‑67 (MQ=255) tGAGCTACGGATGCATCGGGAAAATTAATTTACTGCAGATTTTTTTATACCGCTAATaaa > 1:8090759/1‑60 (MQ=18) tcTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCaa < 1:8698279/66‑1 (MQ=255) gCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCaa < 1:15898746/67‑1 (MQ=255) gCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCaa < 1:15450405/67‑1 (MQ=255) gCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCaa < 1:18061568/67‑1 (MQ=255) gCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCaa < 1:15140116/67‑1 (MQ=255) gCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCaa < 1:13758214/67‑1 (MQ=255) gCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCaa < 1:6497003/67‑1 (MQ=255) gCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCaa < 1:26743669/67‑1 (MQ=255) gCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCaa < 1:1003359/67‑1 (MQ=255) gCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCaa < 1:33216957/67‑1 (MQ=255) gCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCaa < 1:3094927/67‑1 (MQ=255) tACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAg < 1:37247921/66‑1 (MQ=255) tACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAg < 1:22744119/66‑1 (MQ=255) tACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAg < 1:25932373/66‑1 (MQ=255) tACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAg < 1:14805445/66‑1 (MQ=255) tACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAg < 1:32015798/66‑1 (MQ=255) tACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAg < 1:7952360/66‑1 (MQ=255) tACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGt < 1:21560336/67‑1 (MQ=255) tACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGt < 1:4501446/67‑1 (MQ=255) tACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGt < 1:7613912/67‑1 (MQ=255) ggATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAaga < 1:21073100/68‑1 (MQ=255) ggATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAaga < 1:17728211/68‑1 (MQ=255) ggATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAaga > 1:21940881/1‑68 (MQ=255) gATGCATCGGGAATCTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTAACAAGTAagag > 1:18911483/1‑68 (MQ=255) aTGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAgaga > 1:12382741/1‑68 (MQ=255) aTGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAgaga > 1:32736760/1‑68 (MQ=255) aTGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAgaga > 1:29761054/1‑68 (MQ=255) tGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGAt > 1:25253643/1‑68 (MQ=255) aTCGGGAAACTTACTTTTATGCAGTTTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGt < 1:25504027/68‑1 (MQ=21) aTCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGt < 1:3165127/68‑1 (MQ=255) | CGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGT > CP009273/2811576‑2811701 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |