New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	CP009273	= 3613476	NA (NA)	8 (0.020)	7/100	NT	100%	coding (925/4236 nt)	rhsB	Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor
	?	CP009273	= 3613512	0 (0.000)					coding (961/4236 nt)	rhsB	Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor

CGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGA  >  CP009273/3613441‑3613531                                    |                                                        cGCACGACCCGGAATACCCGTAGATTTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC                         >  1:20861217‑M2/1‑68 (MQ=255) cGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTCCCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC                         >  1:16526043‑M2/1‑68 (MQ=255) cGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC                         >  1:6884309‑M2/1‑68 (MQ=255) cGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC                         >  1:30120427‑M2/1‑68 (MQ=255) cGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC                         >  1:24840970‑M2/1‑68 (MQ=255) cGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC                         >  1:14140019‑M2/1‑68 (MQ=255) cGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC                         >  1:20861196‑M2/1‑68 (MQ=255) cGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC                         >  1:15784851‑M2/1‑68 (MQ=255) cGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC                         >  1:19959451‑M2/1‑68 (MQ=255)  gCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:11749628‑M2/68‑1 (MQ=255)  gCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:25288946‑M2/68‑1 (MQ=255)  gCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:21778191‑M2/68‑1 (MQ=255)  gCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:18785280‑M2/68‑1 (MQ=255)  gCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        >  1:18649150‑M2/1‑68 (MQ=255)  gCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        >  1:12240952‑M2/1‑68 (MQ=255)  gCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:16700159‑M2/68‑1 (MQ=255)  gCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:10750149‑M2/68‑1 (MQ=255)  gCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:12977767‑M2/68‑1 (MQ=255)  gCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCAGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:18979813‑M2/68‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGTGAATTTACCTGCAGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:28777574‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:34629718‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:2694956‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:25600118‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:30478525‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:12423882‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:30879598‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:22022386‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:32100455‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:3483016‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:38136569‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:15896562‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:38958637‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:4567419‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:18237246‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG                        <  1:17093144‑M2/67‑1 (MQ=255)   cACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCAGGACGCCATGCG                        <  1:9049540‑M2/67‑1 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC                      >  1:29966094‑M2/1‑68 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC                      >  1:29966070‑M2/1‑68 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC                      >  1:25543085‑M2/1‑68 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC                      >  1:23443310‑M2/1‑68 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC                      >  1:33481826‑M2/1‑68 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC                      >  1:15112928‑M2/1‑68 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC                      >  1:19534272‑M2/1‑68 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC                      >  1:39016059‑M2/1‑68 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC                      <  1:18952039‑M2/68‑1 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC                      >  1:5391070‑M2/1‑68 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC                      >  1:16671381‑M2/1‑68 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC                      >  1:181929‑M2/1‑68 (MQ=255)    aCGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGG                       >  1:13145814‑M2/1‑67 (MQ=255)              aTACCCGGTGAATTAACCAGCCGCGCCGCCGGTGCGCTATGGCTGCACGCCACGCGGCGcggcaggta            >  1:15498348‑M2/1‑59 (MQ=255)                    ggAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattct      >  1:8956312‑M2/1‑53 (MQ=255)                         aTTTACCTGCCGCGCCGCGGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgg  >  1:21140413‑M2/1‑48 (MQ=255)                                    |                                                        CGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGA  >  CP009273/3613441‑3613531

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.