| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3613476 | NA (NA) | 8 (0.020) | 7/100 | NT | 100% | coding (925/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3613512 | 0 (0.000) | coding (961/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
ATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACC > CP009273/3613454‑3613578 | aTACCCGGTGAATTAACCAGCCGCGCCGCCGGTGCGCTATGGCTGCACGCCACGCGGCGcggcaggta > 1:15498348‑M2/1‑59 (MQ=255) ggAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattct > 1:8956312‑M2/1‑53 (MQ=255) aTTTACCTGCCGCGCCGCGGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgg > 1:21140413‑M2/1‑48 (MQ=255) tATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacac < 1:8274071‑M2/68‑47 (MQ=255) gCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggca < 1:18375248‑M2/68‑51 (MQ=255) tGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcag < 1:16322861‑M2/67‑52 (MQ=255) tGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcag < 1:5389682‑M2/67‑52 (MQ=255) gcggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat < 1:21607686‑M2/67‑62 (MQ=255) cggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagccagacggatg < 1:15263596‑M2/67‑63 (MQ=255) cggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatg < 1:33206093‑M2/67‑63 (MQ=255) cggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatg < 1:11824536‑M2/67‑63 (MQ=255) ggcgcggcaggtatattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:3556199‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacccggcagacagacggatgcc < 1:30214181‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:5424022‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:32218386‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:28044978‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:27762901‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:2705901‑M2/68‑65 (MQ=255) 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ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:38974640‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:38200332‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:3914681‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:37115014‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:39233992‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:37010119‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:36862850‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:36699786‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:36617825‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:31462877‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:35719963‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:35004429‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:34445009‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:34390271‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:33479749‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:32633694‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:23749543‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:32052195‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:13381373‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:16433153‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:16118679‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:15732593‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:15667883‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:15569628‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:14026584‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:13888379‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:13626266‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:16927988‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:13182906‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:9351015‑M2/1‑4 (MQ=255) 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ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc < 1:18635141‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:17812213‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:17743039‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgca < 1:10256210‑M2/68‑65 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgc > 1:38089898‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgc > 1:6609547‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat > 1:13007381‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat > 1:23184884‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat > 1:2488129‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcggcagccacacggcagacagacggatgcc > 1:402251‑M2/1‑4 (MQ=255) 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cgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgt < 1:29875143‑M2/68‑67 (MQ=255) cgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgt < 1:37096936‑M2/68‑67 (MQ=255) | ATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACC > CP009273/3613454‑3613578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |