| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 699831 = | 380 (0.800) | 41 (0.100) | 9/96 | NT | 12.0% | coding (432/1947 nt) | nagE | fused N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components |
| ? | CP009273 | 699861 = | 276 (0.680) | coding (462/1947 nt) | nagE | fused N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components | |||||
Only 100 of 526 total aligned reads displayed.
TTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCT > CP009273/699794‑699928 | ttGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGCccgccg < 1:14504431/68‑1 (MQ=255) tgtgCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCgg > 1:17630912/1‑68 (MQ=255) tgtgCCGATTGCCACCGGATTCTTCAGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCgg > 1:38891027/1‑68 (MQ=255) gtgCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGt < 1:20195817/68‑1 (MQ=255) gtgCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGt < 1:15881732/68‑1 (MQ=255) gtgCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGt < 1:3055030/68‑1 (MQ=255) gtgCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGt < 1:12873078/68‑1 (MQ=255) tgCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGt > 1:25416258/1‑67 (MQ=255) gCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTAc < 1:20488391/68‑1 (MQ=255) gCCGATTGCCACAGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTAc < 1:8204305/68‑1 (MQ=255) cgccgcctgcatgcatagcgtgctgtaccggcggccagacgtaaccaaaaatggccgccGGTACAGCa < 1:34975197‑M2/9‑1 (MQ=255) ttGCCACCGTATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCa < 1:33506152/67‑1 (MQ=255) ttGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCa < 1:19956245/67‑1 (MQ=255) ttGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCa < 1:4301143/67‑1 (MQ=255) ttGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCa < 1:9087718/67‑1 (MQ=255) ttGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCa < 1:25830714/67‑1 (MQ=255) ttGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCa < 1:27144956/67‑1 (MQ=255) ttGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCAc < 1:13332706/68‑1 (MQ=255) ttGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCAc > 1:19616405/1‑68 (MQ=255) ttGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCAc > 1:9774419/1‑68 (MQ=255) ttGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCAc < 1:5800582/68‑1 (MQ=255) ttGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCGGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCa < 1:14900401/67‑1 (MQ=255) gccgcctgcatggatagcgtgctgtaccggcggccagacgtaaccaaaaatggccgccGGTACAGCAc < 1:29911521‑M2/10‑1 (MQ=255) gccgcctgcatggatagcgcgctgtaccggcggccagacgtaaccaaaaatggccgccGGTACAGCAc < 1:24296796‑M2/10‑1 (MQ=255) tGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACg < 1:18649392/68‑1 (MQ=255) gcctgcatggatagcgtgctgtaccggcggccagacgtaaccaaaaatggccgccGGTACAGCACGCt < 1:29317578‑M2/13‑1 (MQ=255) cACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCt < 1:26866363/67‑1 (MQ=255) cACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCt < 1:28244648/67‑1 (MQ=255) cACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCt < 1:2515158/67‑1 (MQ=255) cACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCt < 1:37465161/67‑1 (MQ=255) cACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTa < 1:10204721/68‑1 (MQ=255) cACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTa < 1:28422675/68‑1 (MQ=255) cACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTa < 1:3842350/68‑1 (MQ=255) ctgcatggatagcgtgctgtaccggcggccagacgaaaccaaaaatgcccgccGGTACAGCACGCTa < 1:11596077‑M2/14‑1 (MQ=255) aCCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTAt < 1:21417505/68‑1 (MQ=255) aCCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTAt < 1:17040044/68‑1 (MQ=255) aCCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTAt < 1:17861374/68‑1 (MQ=255) aCCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTAt < 1:35818187/68‑1 (MQ=255) aCCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTAt < 1:36546015/68‑1 (MQ=255) aCCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTAt < 1:37831811/68‑1 (MQ=255) aCCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTAt < 1:39332544/68‑1 (MQ=255) aCCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTAt < 1:11242120/68‑1 (MQ=255) aCCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTAt < 1:7853426/68‑1 (MQ=255) aCCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTAt < 1:1091059/68‑1 (MQ=255) ccGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATc < 1:4696376/68‑1 (MQ=255) ccGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATc < 1:31461967/68‑1 (MQ=255) ccGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATc < 1:16831299/68‑1 (MQ=255) ccGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATc < 1:266802/68‑1 (MQ=255) gcatggatcgcgtgcggtagcgggggcctgacgtaaccaaaaatgcccgccGGTACAGCACGCTATc < 1:3703582‑M2/16‑1 (MQ=255) cGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATcc < 1:33835105/68‑1 (MQ=255) ggATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCa < 1:11998530/68‑1 (MQ=255) aTTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCAt > 1:21031653/1‑67 (MQ=255) ttcttcTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATg < 1:10791948/67‑1 (MQ=255) tcttcaGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCa < 1:32728622/68‑1 (MQ=255) atagcgtgctgtaccGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAg < 1:24856753‑M1/53‑1 (MQ=255) atagcgtgctgtaccGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAg < 1:33281728‑M1/53‑1 (MQ=255) atagcgtgctgtaccGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAg < 1:7452929‑M1/53‑1 (MQ=255) agcgtgctgtaccGGCGGGCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCGCGCGTTCCATGCAggc < 1:6112563‑M1/55‑1 (MQ=255) agcgtgctgtaccGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCCCGCTATCCCTGCAggc < 1:3470115‑M1/55‑1 (MQ=255) agcgtgctgtaccGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAggc < 1:27500107‑M1/55‑1 (MQ=255) agcgtgctgtaccGGCGGCCATGTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCCCGCTAGCCATGCAggc < 1:1641208‑M1/55‑1 (MQ=255) cgtgctgtaccGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAggcgg < 1:31069032‑M1/57‑1 (MQ=255) gtgctgtaccGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCCCGCTATGCCTGGAggcggc < 1:95181‑M1/58‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGgcggcg < 1:34394912/67‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGa > 1:21868072/1‑68 (MQ=255) cTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGa > 1:6505182/1‑68 (MQ=255) cTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGa > 1:2883746/1‑68 (MQ=255) cTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGa < 1:23724949/68‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGa > 1:1242076/1‑68 (MQ=255) tGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAg < 1:19124336/68‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGt < 1:22360264/68‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTgg > 1:26254358/1‑68 (MQ=255) gCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGGAGGCGGCGAGTGGa < 1:13731094/68‑1 (MQ=255) gCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGa < 1:18163659/68‑1 (MQ=255) gCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGa > 1:5368885/1‑68 (MQ=255) gCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGa > 1:3302388/1‑68 (MQ=255) gCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGa > 1:32219774/1‑68 (MQ=255) ccGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGa < 1:14059138‑M1/65‑1 (MQ=255) GGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCg < 1:8062284‑M1/68‑1 (MQ=255) CGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGtt < 1:36335133‑M1/68‑1 (MQ=255) CGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGtt < 1:30165126‑M1/68‑1 (MQ=255) CGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGtt < 1:15295870‑M1/68‑1 (MQ=255) CGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGtt < 1:4957223‑M1/68‑1 (MQ=255) GGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGttt > 1:6695752‑M1/1‑68 (MQ=255) tttGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCggg < 1:23258311/68‑1 (MQ=255) gTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGgcgc > 1:23035760/1‑67 (MQ=255) ttACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGgcgc > 1:23486018/1‑66 (MQ=255) cGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTgg < 1:36088700/68‑1 (MQ=255) gTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTggg > 1:721455/1‑68 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGt > 1:10600222/1‑68 (MQ=255) cTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGt < 1:35567369/67‑1 (MQ=255) cTGGCCGCAGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGAACGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGt < 1:7672419/67‑1 (MQ=255) tggccgccGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTc < 1:2463446‑M2/60‑1 (MQ=255) ggccgccGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTcc < 1:6975654‑M2/61‑1 (MQ=255) ggccgccGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTcc < 1:8533549‑M2/61‑1 (MQ=255) ccgccGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCgg > 1:19061042‑M2/6‑68 (MQ=255) gccGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTa < 1:31893747‑M2/65‑1 (MQ=255) cGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTAt < 1:18436579‑M2/66‑1 (MQ=255) cGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTAt < 1:4079406‑M2/66‑1 (MQ=255) ggTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCt < 1:22507971/68‑1 (MQ=255) | TTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTGCCTGGTGCTGGCGGCCATTTTTGGTTACGTCTGGCCGCCGGTACAGCACGCTATCCATGCAGGCGGCGAGTGGATCGTTTCTGCGGGCGCGCTGGGTTCCGGTATCT > CP009273/699794‑699928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |