| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2139980 | 269 (0.570) | 14 (0.040) | 9/94 | NT | 5.5% | coding (3234/3318 nt) | yegE | putative diguanylate cyclase |
| ? | CP009273 | = 2140007 | 257 (0.640) | coding (3261/3318 nt) | yegE | putative diguanylate cyclase | |||||
Only 100 of 389 total aligned reads displayed.
TCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCGTGCTTC > CP009273/2139940‑2140074 | gTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTgc > 1:36101660‑M2/1‑66 (MQ=255) ttttACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTgcc < 1:4746022‑M2/68‑4 (MQ=255) tttACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTgcc > 1:31863535‑M2/1‑64 (MQ=255) ttcccttAGTGATGGCTACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTgccgat > 1:32418002‑M2/3‑62 (MQ=255) aCCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTgccgat < 1:29336571‑M2/67‑7 (MQ=255) cccTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTgccgatgc > 1:17786236‑M2/1‑60 (MQ=255) ccTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTgccgatgcc > 1:10055950‑M2/1‑59 (MQ=255) ccTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTgccgatgc < 1:9679838‑M2/67‑9 (MQ=255) ccTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTgccgatgc < 1:12579492‑M2/67‑9 (MQ=255) ccTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTgccgatgc < 1:30910742‑M2/67‑9 (MQ=255) aGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCaa > 1:4369873/1‑67 (MQ=255) aGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAAc < 1:23913634/68‑1 (MQ=255) tGATGGATACGCTTTCTGGCATCTGCGTCGATCTGATTTATGGTGATGTGATTTCCGATGCCCaaac > 1:15682291/1‑65 (MQ=255) tGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAAcc > 1:10478484/1‑67 (MQ=255) tGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAAcc > 1:18826526/1‑67 (MQ=255) gATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCg < 1:31991705/67‑1 (MQ=255) aTGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAAcc > 1:4613437/1‑65 (MQ=255) tGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTgccgatgccagaaagcgt > 1:14367960‑M2/1‑50 (MQ=255) tGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCt < 1:16003729/67‑1 (MQ=255) tGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTg > 1:10978358/1‑68 (MQ=255) tGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTACGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTg > 1:22108160/1‑68 (MQ=255) ggATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTgg < 1:22647177/68‑1 (MQ=255) ggATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTgg > 1:7252049/1‑68 (MQ=255) ggATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTgg < 1:406190/68‑1 (MQ=255) aTACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGa < 1:27153998/67‑1 (MQ=255) tACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAt < 1:15305049/67‑1 (MQ=255) cGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAttt > 1:19466302/1‑67 (MQ=255) gCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAttt > 1:25100368/1‑66 (MQ=255) gCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAttt > 1:5546691/1‑66 (MQ=255) gCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAttt > 1:29111780/1‑66 (MQ=255) gCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAttt > 1:33252841/1‑66 (MQ=255) gCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAttt > 1:30194162/1‑66 (MQ=255) gCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAttt > 1:12882031/1‑66 (MQ=255) gCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAttt > 1:23097600/1‑66 (MQ=255) gCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGc > 1:3166985/1‑68 (MQ=255) cTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAttt > 1:11613942/1‑65 (MQ=255) cTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAttt > 1:26113550/1‑65 (MQ=255) tttCTGGCATCGGGGTCGATCTGATTTATGGTGCGGTGATTgccgatgccagaaagcgtatccatcac > 1:8097955‑M2/1‑41 (MQ=255) tttCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGCGGTGATTcccgatgccagaaagcgtatccatcac > 1:5822321‑M2/1‑41 (MQ=255) tttCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCt < 1:20438680/67‑1 (MQ=255) tttCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCt < 1:34856978/67‑1 (MQ=255) ttCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTgg < 1:27862768/68‑1 (MQ=255) tGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGa < 1:22959315/68‑1 (MQ=255) tGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGa < 1:5265865/68‑1 (MQ=255) tGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGa < 1:7922443/68‑1 (MQ=255) tGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGa > 1:28463489/1‑68 (MQ=255) ggCATCTTCGTCTATCTGATTTATGGTGATGTGATTTCCGATGACCAACCGCTGGATTTGCTGGTGaa < 1:27500681/68‑1 (MQ=255) ggCATCGGCGTCGATCTGATTCATGGTGAGGGGATTgccgacgccagaaagcgtatccatcactaagg > 1:26563213‑M2/1‑36 (MQ=255) gCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAt > 1:12435463/1‑68 (MQ=255) gCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAt > 1:16907254/1‑68 (MQ=255) cATCGGCGTCGATCTGTTTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAt < 1:39015440/67‑1 (MQ=255) aTCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAtag < 1:23388722/68‑1 (MQ=255) tCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAtagt < 1:6168151/68‑1 (MQ=255) tCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAtagt < 1:18291040/68‑1 (MQ=255) tCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAtagt < 1:17212292/68‑1 (MQ=255) tCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAtagt < 1:31157518/68‑1 (MQ=255) cGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAtagta < 1:37324079/68‑1 (MQ=255) cGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATagtagt < 1:36928700/67‑1 (MQ=255) cGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTAt < 1:30354109/67‑1 (MQ=255) cTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTcgc < 1:10847894/68‑1 (MQ=255) gATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGa < 1:39238552/68‑1 (MQ=255) tttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGAtt > 1:30030691/1‑68 (MQ=255) tttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGAtt > 1:8767789/1‑68 (MQ=255) tttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGAtt > 1:780074/1‑68 (MQ=255) tttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGAtt > 1:19038469/1‑68 (MQ=255) tttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGAtt > 1:21056086/1‑68 (MQ=255) tttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGAt < 1:15862707/67‑1 (MQ=255) tttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGAt < 1:20503109/67‑1 (MQ=255) ttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTa < 1:33733784/68‑1 (MQ=255) ttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTa > 1:9442504/1‑68 (MQ=255) ttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTa < 1:8888995/68‑1 (MQ=255) ttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTa < 1:6384132/68‑1 (MQ=255) ttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTa < 1:29508136/68‑1 (MQ=255) ttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTa < 1:13867396/68‑1 (MQ=255) ttATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTa < 1:28162127/68‑1 (MQ=255) aTGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAAc < 1:18564790/68‑1 (MQ=255) aTGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAAc < 1:7003006/68‑1 (MQ=255) aTGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAAc < 1:23624043/68‑1 (MQ=255) ggtgaggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTg > 1:36757212/1‑68 (MQ=255) ggtgaggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTg > 1:7532858/1‑68 (MQ=255) ggtgaggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTg > 1:35026228/1‑68 (MQ=255) ggtgaggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTg > 1:12073262/1‑68 (MQ=255) ggtgaggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTg > 1:20146991/1‑68 (MQ=255) ggtgaggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTg > 1:20798402/1‑68 (MQ=255) ggtgaggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTg > 1:25711274/1‑68 (MQ=255) ggtgaggtgaTTGCCGATGAACAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTg > 1:34437728/1‑68 (MQ=255) gaggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAgg < 1:32622002/68‑1 (MQ=255) gaggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAgg < 1:25293398/68‑1 (MQ=255) ggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGc < 1:24450877/67‑1 (MQ=255) ggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCg > 1:2418758/1‑68 (MQ=255) ggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCg > 1:14776349/1‑68 (MQ=255) ggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCg > 1:37971553/1‑68 (MQ=255) ggtgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCg > 1:16586421/1‑68 (MQ=255) tgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCGt < 1:23751015/67‑1 (MQ=255) tgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCGt < 1:36822056/67‑1 (MQ=255) tgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCGt > 1:32942409/1‑67 (MQ=255) tgaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCGt < 1:38678290/67‑1 (MQ=255) gaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCGTg < 1:3215469/67‑1 (MQ=255) gaTTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCGTg < 1:13319481/67‑1 (MQ=255) tGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCGTGCTTc < 1:3838391/68‑1 (MQ=255) | TCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATTAACTGAGGCGTGCTTC > CP009273/2139940‑2140074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |