| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2230114 | NA (NA) | 5 (0.010) +CTACAATAAGCTC |
4/86 | NT | NA | noncoding (102/150 nt) | REP156 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 3 REP sequences | REP156 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 3 REP sequences |
| ? | CP009273 | = 2230185 | NA (NA) | intergenic (+206/+37) | preA/mglC | dihydropyrimidine dehydrogenase, NADH‑dependent, subunit C/methyl‑galactoside transporter subunit | |||||
Only 100 of 554 total aligned reads displayed.
TGGCTCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAATCC > CP009273/2230118‑2230252 | gCTCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTAt > 1:11242963/1‑68 (MQ=255) cTCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTAt < 1:10834401/67‑1 (MQ=255) cTCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAAATCATGATGTTAt < 1:18630028/67‑1 (MQ=255) tCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTAtgt < 1:18336796/68‑1 (MQ=255) tCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTAtgt > 1:15042294/1‑68 (MQ=255) tCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTAtgt < 1:35905586/68‑1 (MQ=255) cTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGc < 1:34350712/68‑1 (MQ=255) tGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCg > 1:27307028/1‑68 (MQ=255) gTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGt < 1:26701947/68‑1 (MQ=255) gTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGt < 1:9055987/68‑1 (MQ=255) gTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGt < 1:29884674/68‑1 (MQ=255) aatgccggatgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGt > 1:15460414‑M2/13‑68 (MQ=255) ccggatgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTAt > 1:11833239‑M2/9‑68 (MQ=255) ccggatgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCAGGATGTTATGTGCGTTTAt > 1:8228137‑M2/9‑68 (MQ=255) cggatgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATg > 1:27565931‑M2/8‑68 (MQ=255) gatgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGa > 1:195163‑M2/6‑67 (MQ=255) gatgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGa > 1:10226239‑M2/6‑67 (MQ=255) atgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGAc < 1:3578709‑M2/63‑1 (MQ=255) atgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGAc < 1:38378392‑M2/63‑1 (MQ=255) ggcgTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGaa < 1:17473927/67‑1 (MQ=255) ggcgTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGaa < 1:17755961/67‑1 (MQ=255) ggcgTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAAt < 1:18142798/68‑1 (MQ=255) cgTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATg < 1:13079058/67‑1 (MQ=255) gAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGa < 1:27975893/68‑1 (MQ=255) aCGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGAc < 1:6605796/67‑1 (MQ=255) aCGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGAc < 1:21410244/67‑1 (MQ=255) cGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACca < 1:22147814/68‑1 (MQ=255) cGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACca < 1:16822780/68‑1 (MQ=255) cGCCTTATCCCGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACca < 1:34820139/68‑1 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACcac < 1:1902156/68‑1 (MQ=255) ccTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACcaca > 1:24429060/1‑68 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACcaca < 1:37938317/67‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACcaca < 1:15296396/67‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACcaca < 1:16100253/67‑1 (MQ=255) tgcGGCGTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcac > 1:28600478/3‑68 (MQ=255) ccGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTgagcttattgtaggccggatgcaacgctggcgcgtt < 1:881449‑M2/68‑37 (MQ=255) ccGGCCTACAAAACCACACAGATCTTGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca > 1:39153001/1‑68 (MQ=255) ccGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca < 1:17287254/68‑1 (MQ=255) ccGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca > 1:4337706/1‑68 (MQ=255) ccGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca < 1:3218119/68‑1 (MQ=255) cGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca > 1:14671483/1‑67 (MQ=255) cGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca > 1:22377907/1‑67 (MQ=255) ccTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCAcatca < 1:23585989/67‑1 (MQ=255) cTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCAtt < 1:25195728/68‑1 (MQ=255) cTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCAtt < 1:39429140/68‑1 (MQ=255) cTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCAtt < 1:19816416/68‑1 (MQ=255) aaaCCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCtt > 1:19149396/1‑67 (MQ=255) aCCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTAc > 1:37305535/1‑67 (MQ=255) ccACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTAcgc < 1:35479038/68‑1 (MQ=255) acacaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTAcgcgc < 1:8547182/68‑1 (MQ=255) acaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGt > 1:20032728/1‑68 (MQ=255) acaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGt > 1:5893806/1‑68 (MQ=255) acaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGt < 1:33022497/68‑1 (MQ=255) acaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGt > 1:32771021/1‑68 (MQ=255) acaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGt < 1:30269669/68‑1 (MQ=255) acaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGt > 1:9299759/1‑68 (MQ=255) gATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTAtt > 1:33439717/1‑68 (MQ=255) tCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTAt < 1:1206470/65‑1 (MQ=255) tCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTc < 1:8043115/68‑1 (MQ=255) tCATGATGTTATGTGCGTTGATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTAtt < 1:20373692/66‑1 (MQ=255) atgatgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAg < 1:12587378/68‑1 (MQ=255) atgatgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAg < 1:30898766/68‑1 (MQ=255) tgatgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGt > 1:17922301/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:5562918/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:38880278/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:36967795/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:36705707/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:5683044/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:17057097/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:4654277/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:5038234/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:6249051/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:35359380/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:21671185/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:6953865/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:7255434/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:30495605/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:29424017/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:7690358/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:22953049/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:26201666/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:26083129/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:25446896/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:23956750/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGAACAAATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:28825358/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGAGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:9647054/1‑68 (MQ=255) tgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa < 1:28467582/68‑1 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:36404908/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:13667624/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:31283234/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:29116136/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:25610655/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:24761642/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAAt < 1:14224447/68‑1 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAAt < 1:33926189/68‑1 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAAt < 1:10563460/68‑1 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACAGAATGCGGACCACATTcaca > 1:10052164/1‑39 (MQ=255) tATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAATcc > 1:31572467/1‑68 (MQ=255) tATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAATcc > 1:22726260/1‑68 (MQ=255) tATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAATcc > 1:16407088/1‑68 (MQ=255) | TGGCTCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAATCC > CP009273/2230118‑2230252 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |