| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3375198 = | 660 (1.390) | 46 (0.120) | 11/94 | NT | 8.2% | coding (1097/1368 nt) | degQ | serine endoprotease, periplasmic |
| ? | CP009273 | 3375228 = | 479 (1.200) | coding (1127/1368 nt) | degQ | serine endoprotease, periplasmic | |||||
Only 100 of 1047 total aligned reads displayed.
GTAGAAGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAGTTGTC > CP009273/3375161‑3375295 | tAGAAGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGaa > 1:39206971/1‑68 (MQ=255) aGAAGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGaa < 1:8994523/67‑1 (MQ=255) gAAGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAgg > 1:22453771/1‑68 (MQ=255) cttttagctgcccatcgctcaacgttgcaccttccagcgctggcgtgatcatttcagcgctggAAGGt < 1:27314809‑M2/5‑1 (MQ=255) cttttagctgaccatcgctcaacgttgcaccttccagcgctggcgtgatcatttcagcgctggAAGGt < 1:19306307‑M2/5‑1 (MQ=255) cttttagctgaccatcgctcaacgttgcaccttccagcgctggcgtgatcatttcagcgctggAAGGt < 1:18139632‑M2/5‑1 (MQ=255) cttttagctgaccatcgctcaacgttgcaccttccagcgctggcgtgatcatttcagcgctggAAGGt < 1:28948834‑M2/5‑1 (MQ=255) aaGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt > 1:32168204/1‑68 (MQ=255) agagACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:7493938/64‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:31957737/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:20081877/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:33488532/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:7800489/67‑1 (MQ=255) tGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCa > 1:32983774/1‑68 (MQ=255) agctgacccacgctcaacgatgcacctcccagcgctggcgtgatcatttcagcgcttgAAGGTGCAAc < 1:31213924‑M2/10‑1 (MQ=255) gctgaccatcgctcaacgttgcaccttCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCGGGAAGGTGGAACg < 1:20906952‑M1/41‑1 (MQ=255) cGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAAc < 1:3063497/67‑1 (MQ=255) cGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAAc < 1:3648503/67‑1 (MQ=255) cGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAAc < 1:4956367/67‑1 (MQ=255) cGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAAc < 1:9714984/67‑1 (MQ=255) gCTCGATACCCGCTCCTCTGCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAAcct < 1:28600136/68‑3 (MQ=255) gCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGt < 1:30891193/68‑1 (MQ=255) gCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGt < 1:6195998/68‑1 (MQ=255) ctgaccatcgctcaacgttgcaccttCCAGCGGTGAAATGATCACGGCCGCGCTGGAAGGTGCAACGt < 1:26839566‑M1/42‑1 (MQ=255) tgaccatcgctcaacgttgcaccttccagcgctggcgtgatcatttcagcgctggAAGGTGCAACg < 1:10614908‑M2/11‑1 (MQ=255) cTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGtt > 1:27694298/1‑68 (MQ=255) aCCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGa > 1:23490074/1‑68 (MQ=255) aGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATgg > 1:12315569/1‑68 (MQ=255) aGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATgg > 1:22653226/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGATGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:39018075/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:1844289/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:17413846/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:14731632/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:6822592/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:1612201/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:3950265/1‑68 (MQ=255) aCCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGATATGATCACCCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:1652169/1‑67 (MQ=255) aCCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCTCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATgg < 1:35897302/65‑1 (MQ=255) aCCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc < 1:12562826/67‑1 (MQ=255) aCCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCa > 1:9448348/1‑68 (MQ=255) aCCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCa > 1:32619510/1‑68 (MQ=255) aCCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCa > 1:26255750/1‑68 (MQ=255) cccctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAg < 1:27105158/65‑1 (MQ=255) acgttgcaccttCCCGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAg < 1:10929724‑M1/56‑1 (MQ=255) acgttgcaccttCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCGGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCa < 1:15447191‑M1/55‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATTGTCAGc < 1:1304457/68‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:37871817/68‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:2547361/68‑1 (MQ=255) cgttgccccaccccgcgcgggcgagatcatttcagcgctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:4192529‑M2/27‑1 (MQ=255) tctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATTGTCAGCt < 1:17200389/68‑1 (MQ=255) ttCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTaa > 1:12097389/1‑68 (MQ=255) ttCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTaa > 1:33827816/1‑68 (MQ=255) ttCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTaa > 1:21317757/1‑68 (MQ=255) gtcgGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAg > 1:35440489/1‑68 (MQ=255) gtcgGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAg > 1:22961477/1‑68 (MQ=255) gtcgGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTGGAGCGATGGTCAGCTAAAAg > 1:29957029/1‑68 (MQ=255) accttCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAg < 1:24991597‑M1/63‑1 (MQ=255) cgGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGAt > 1:29707587/1‑68 (MQ=255) ttCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGCGCGATGGTCAGCTAAAAGATg < 1:34455344‑M1/66‑1 (MQ=255) CCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATggc < 1:19580848‑M1/68‑1 (MQ=255) CCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATggc < 1:34793542‑M1/68‑1 (MQ=255) GCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATggcggc < 1:1157891‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAGCGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:38134445‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:1581358‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:21604037‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:4526206‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:37354039‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:24705498‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:31609015‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:5220621‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:34238731‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:26600684‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:14185917‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:28060254‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:14590370‑M1/68‑1 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGTCGGCAAAGGTa < 1:37142877/68‑1 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa > 1:8508454/1‑68 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGAGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa < 1:20623625/68‑1 (MQ=255) tCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTaaa > 1:13377695/1‑68 (MQ=255) tCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTaaa > 1:18875410/1‑68 (MQ=255) tCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTaaa > 1:28312613/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGa > 1:35090043/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGa > 1:21995200/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGa > 1:36657642/1‑68 (MQ=255) ccAGCGCTGGAAGGTGCAACCTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGa > 1:19888931/1‑68 (MQ=255) gctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAg > 1:15167939‑M2/6‑68 (MQ=255) gctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAg < 1:29198932‑M2/63‑1 (MQ=255) gctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAg > 1:2586214‑M2/6‑68 (MQ=255) 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aaGGTGCAACGTTGACCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAGTTGTc > 1:13763935/1‑68 (MQ=255) aaGGGGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAGTTGt < 1:25233624/67‑1 (MQ=255) | GTAGAAGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAGTTGTC > CP009273/3375161‑3375295 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |