| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3851553 = | 370 (0.890) | 29 (0.090) | 9/86 | NT | 10.9% | coding (212/1494 nt) | yidJ | sulfatase/phosphatase superfamily protein |
| ? | CP009273 | 3851602 = | 191 (0.600) | coding (163/1494 nt) | yidJ | sulfatase/phosphatase superfamily protein | |||||
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
CCTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3851631‑3851553‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agtccggcccgtgCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAGACTATC > CP009273/3851602‑3851668 CCTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG > 1:5384590/1‑68 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGT < 1:17553567/68‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGT < 1:17710385/68‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:3180216/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:15874784/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:11378952/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:29635236/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:23325806/67‑1 TACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTC < 1:30502781/68‑1 TACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTC < 1:33943933/68‑1 TACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGT > 1:26241828/1‑67 CACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCG > 1:26515375/1‑68 CACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCG > 1:18507108/1‑68 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG < 1:33678443/68‑1 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG < 1:23238340/68‑1 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG < 1:10998817/68‑1 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCG > 1:14811060/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGC < 1:667941/68‑1 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:20788956/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:33317/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:22305378/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:16694261/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:15675033/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:40845/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:492792/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:13018339/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:12197667/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:6382965/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:28860685/1‑67 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCC < 1:34600375/68‑1 gGTTCCCCGGTGGGTCCGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGCCCGGCCC < 1:2830496/67‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG < 1:16277111/68‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG < 1:20715800/68‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG > 1:20556364/1‑68 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG < 1:1509440/68‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG > 1:7276493/1‑68 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:18801702/67‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:1822071/67‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:25844859/67‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:25393715/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:9181011/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGACCGGCCCGTGCAGG < 1:23105123/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCAACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:2671142/68‑1 TTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCG < 1:13892826/67‑1 TTTGAACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTCCCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCG < 1:34731090/67‑1 TTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGT < 1:1376315/67‑1 GCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACC < 1:14394622/68‑1 GCCTCCACCGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACC < 1:31117510/68‑1 GCCAGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACC < 1:28406679/68‑1 CACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGA < 1:9506496/68‑1 CACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGA > 1:19153731/1‑68 CCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGG < 1:22570869/67‑1 CCGGACTATTTACCGGTAGCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGG < 1:32344033/67‑1 aaACCGCTATCAACCCTAACCCGCCCGGCCCGCGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGA < 1:22082485/66‑1 aaaAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTT > 1:383170/4‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:19830716/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:34204600/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:15422966/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:21990956/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:15170532/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:5080651/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:13194085/1‑67 GTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC > 1:2552804/1‑68 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:5134310/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:5443644/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:11786352/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:21266277/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:32904707/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC < 1:8135826/66‑1 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC < 1:3252663/66‑1 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAAGTATAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:21328789/1‑67 CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:5761885/1‑67 CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:6842258/1‑67 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |