| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4311466 = | 440 (1.050) | 24 (0.070) | 10/94 | NT | 7.4% | coding (48/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit |
| ? | CP009273 | 4311493 = | 233 (0.670) | coding (21/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit | |||||
Only 100 of 681 total aligned reads displayed.
TCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAT > CP009273/4311399‑4311532 | tCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGc < 1:11161135‑M2/67‑1 (MQ=255) aCCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTGGGCTGTgcg > 1:19990426/1‑67 (MQ=255) cctgacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGcc < 1:6195844‑M1/4‑1 (MQ=255) ccTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGcc < 1:14250504/68‑1 (MQ=255) ctgacgcgcgccgacatgatttaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCg > 1:11922895‑M1/64‑65 (MQ=255) ctgacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCg > 1:13050428‑M1/64‑65 (MQ=255) tgacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCa < 1:34000850‑M1/5‑1 (MQ=255) tCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCa > 1:17042941/1‑67 (MQ=255) tCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCa > 1:19827185/1‑67 (MQ=255) tCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCa > 1:27165283/1‑67 (MQ=255) tCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAg < 1:13486774/68‑1 (MQ=255) tCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAg < 1:22507479/68‑1 (MQ=255) tCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAg < 1:25655188/68‑1 (MQ=255) gacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGc > 1:13668735‑M1/62‑68 (MQ=255) gacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGc > 1:12701703‑M1/62‑68 (MQ=255) aTAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGc > 1:16195166/1‑67 (MQ=255) cgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCa > 1:19686354‑M1/60‑67 (MQ=255) aGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACg < 1:34257744/68‑1 (MQ=255) aGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACg > 1:8861691/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:30773900/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:24637276/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:18819344/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:24051276/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:7923595/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:5870242/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:4826478/1‑68 (MQ=255) gcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCACGGa > 1:23204492‑M1/57‑68 (MQ=255) cggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGa < 1:34732213/67‑1 (MQ=255) ggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACa < 1:5715921/68‑1 (MQ=255) ggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACa < 1:14734334/68‑1 (MQ=255) gccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCACGGACa > 1:27859798‑M1/55‑68 (MQ=255) cggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACAt < 1:17918138/67‑1 (MQ=255) cggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACAt < 1:27600893/67‑1 (MQ=255) cgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCACGGACAt > 1:19055084‑M1/53‑67 (MQ=255) ggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATcc > 1:20354610/1‑68 (MQ=255) tGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCa < 1:8067040/67‑1 (MQ=255) gATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAga < 1:4149718/68‑2 (MQ=255) ttAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTg > 1:15149076/1‑67 (MQ=255) ttAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTg > 1:26065633/1‑67 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:29181414/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:7195665/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:16575243/1‑68 (MQ=255) gcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:10232572/1‑67 (MQ=255) gTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTc > 1:10834052/1‑67 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCGTGTTCAGGGGGTTGGCTGTGCGGGAGCACGGACATGCAGTGGTGGCGGGTcgcg < 1:32920924/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCTGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:31171423/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:24286327/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:7649086/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTGGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:24844072/68‑1 (MQ=255) tcCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa < 1:8387350‑M1/66‑1 (MQ=255) ggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCACGGACATCCAGt < 1:17346205‑M1/20‑1 (MQ=255) ggCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:7432725/1‑68 (MQ=255) gCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:13194508/1‑67 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt > 1:3880827‑M1/1‑65 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa < 1:15560044‑M1/66‑1 (MQ=255) CGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTAt > 1:6731790‑M1/1‑67 (MQ=255) TGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCg > 1:29583822‑M1/1‑67 (MQ=255) TGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCg > 1:15958020‑M1/1‑67 (MQ=255) GCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTg > 1:31823112‑M1/1‑68 (MQ=255) ccAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTg < 1:18285506/67‑1 (MQ=255) cAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCa > 1:3199428/1‑68 (MQ=255) atgcacgcagataccgcgaccCGCCCGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTgcggg < 1:21229313‑M1/45‑3 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCAt < 1:21090365/65‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCAt < 1:29919251/65‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTc < 1:30306067/67‑1 (MQ=255) cgcagataccgcgaccCGCCAGCCCGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAg < 1:17571981‑M1/52‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:4496016/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:26936401/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:26320282/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:9218767/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:32270544/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:32657892/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:11664088/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:3582044/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:23595501/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc > 1:9609166/1‑67 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:25251515/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:22723908/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:20726032/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:28845904/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:28347718/67‑1 (MQ=255) cGGTGGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCt < 1:31554873/68‑1 (MQ=255) gtttGGCTGTGCGACAGCACGGACATCCTGTGCTGGCGGGTCGCTGTATCTGCGTCCATTCAGTGCTc < 1:25019505/66‑1 (MQ=255) ggTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTc < 1:6354496/68‑1 (MQ=255) ggTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTc < 1:23396397/68‑1 (MQ=255) ataccgcgaccCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCt < 1:3335446‑M1/56‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:26427763/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:10137715/67‑1 (MQ=255) accgcgaccCGCCAGCACGGCCATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCGGCGTGCATTCAGTGCTCCa < 1:55267‑M1/59‑1 (MQ=255) tGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCAt < 1:7056534/68‑1 (MQ=255) tGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCAt < 1:29816828/68‑1 (MQ=255) ggCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATa > 1:1410860/1‑68 (MQ=255) cgcgaccCGCCCGCCCGGCCATCCAGTGCGGGCGGGTCGCGGGATCTGCGTGCATTCAGTGCTccaga < 1:22792128‑M1/61‑3 (MQ=255) cgcgaccCGCCCGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATa < 1:22127637‑M1/61‑1 (MQ=255) cTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAg < 1:19347597/67‑1 (MQ=255) tgtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTg > 1:20606042/1‑68 (MQ=255) tgtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTg > 1:33665315/1‑68 (MQ=255) gtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGa < 1:21877797/68‑1 (MQ=255) gtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGa < 1:25801940/68‑1 (MQ=255) CGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAt < 1:10590088‑M1/67‑1 (MQ=255) | TCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAT > CP009273/4311399‑4311532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |