| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3202572 | 259 (0.620) | 17 (0.050) | 6/92 | NT | 8.8% | coding (1190/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| ? | CP009273 | = 3202615 | 140 (0.410) | coding (1233/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte | |||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
TACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGG > CP009273/3202548‑3202682 | tACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct < 1:17521527/68‑1 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:10168618/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:24122941/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:7242498/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:4310527/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:5844070/1‑67 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:33282915‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:24803541‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:27088810‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:32770658‑M2/1‑66 (MQ=255) gcTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctg < 1:23087321‑M2/68‑7 (MQ=255) aCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcg > 1:28406210‑M2/1‑59 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt > 1:21590001/1‑68 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt < 1:6565930/68‑1 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt < 1:30273823/68‑1 (MQ=255) tttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGc < 1:16828170/68‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGcc < 1:463874/68‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGAAGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaa > 1:1894842‑M2/1‑54 (MQ=255) tCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCg < 1:7432759/68‑1 (MQ=255) cACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagt > 1:15069743‑M2/1‑43 (MQ=255) cACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagt > 1:30550132‑M2/1‑43 (MQ=255) cACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCg < 1:28570311/67‑1 (MQ=255) cACGGCGTATACCTCCGCGCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagt > 1:31521008‑M2/1‑43 (MQ=255) aCGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtag > 1:31905166‑M2/1‑42 (MQ=255) aCGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtag > 1:26430661‑M2/1‑42 (MQ=255) aCGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtag > 1:6424105‑M2/1‑42 (MQ=255) ggCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTg > 1:18494047/1‑67 (MQ=255) cGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGcc < 1:7266807/67‑1 (MQ=255) cGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGcc < 1:13381919/67‑1 (MQ=255) cGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGcc < 1:20913935/67‑1 (MQ=255) cGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGcc < 1:5210374/67‑1 (MQ=255) cGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGcc < 1:222192/67‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtg < 1:25434904/68‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtg < 1:11383786/68‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgt < 1:29230827/67‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgt < 1:34730696/67‑1 (MQ=255) ataCCTCCGCGCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtg < 1:15116445/68‑1 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcgaaaaagtagcgcagtagataaaacacc < 1:9009591‑M2/68‑37 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:30071224/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:28119591/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGgtgt > 1:16968421/1‑66 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGAGATGCCGGAAATCCCGCTCCCGgtgt > 1:31380819/1‑66 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:29069670/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:9394572/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:34154865/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:8582755/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:26017551/1‑67 (MQ=255) tCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCt > 1:16223002/1‑67 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:8824235/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:2003913/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:4695899/68‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:18638160/68‑1 (MQ=255) cGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGcc < 1:25006175/68‑1 (MQ=255) cGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGcc < 1:3112301/68‑1 (MQ=255) gCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCt < 1:28524483/68‑1 (MQ=255) tctcGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGa > 1:19390993/1‑68 (MQ=255) tctcGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGa > 1:32079269/1‑68 (MQ=255) cGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtgg > 1:8128656/1‑68 (MQ=255) cGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtgg < 1:3520028/68‑1 (MQ=255) aCCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttg > 1:28272283/1‑68 (MQ=255) aCCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttg > 1:27444854/1‑68 (MQ=255) cGATGATGATTGGTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt < 1:24556828/68‑1 (MQ=255) cGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt < 1:25275683/68‑1 (MQ=255) cGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt < 1:15290525/68‑1 (MQ=255) cGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt < 1:7053217/68‑1 (MQ=255) cGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt < 1:30808259/68‑1 (MQ=255) cGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt < 1:28043202/68‑1 (MQ=255) cGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAcggttggt < 1:23074945/68‑1 (MQ=255) cGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCGGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt < 1:4137515/68‑1 (MQ=255) atgatgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCt < 1:6492666/56‑1 (MQ=255) gatgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCgg < 1:4023515/68‑1 (MQ=255) tgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGc < 1:11976625/67‑1 (MQ=255) tgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCa < 1:5459323/68‑1 (MQ=255) tgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCa > 1:29726171/1‑68 (MQ=255) tgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCa < 1:24619175/68‑1 (MQ=255) atTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAAt > 1:23527773/1‑68 (MQ=255) ttGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAAtt > 1:24658039/1‑68 (MQ=255) gctgctgcgctggcgaaaaagtagcgcagtagataaaacaccacaatcaacgccaccatcaccatcgt < 1:20346458‑M2/68‑63 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:14313738/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:13936260/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:27388812/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:27587670/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:11872596/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:11202469/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:10378510/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:4919544/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:17148013/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:18777176/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:1908158/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:29507380/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:31273436/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:22101829/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTgg < 1:21387764/68‑1 (MQ=255) gctgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGGGCGGCAATTgg < 1:12276743/68‑1 (MQ=255) tgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTc < 1:25907931/68‑1 (MQ=255) tgccgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGt < 1:16338037/67‑1 (MQ=255) tgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTgg < 1:15322664/68‑1 (MQ=255) tgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTgg < 1:24489337/68‑1 (MQ=255) tgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTgg > 1:19705068/1‑68 (MQ=255) tgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTgg < 1:1088199/68‑1 (MQ=255) | TACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGG > CP009273/3202548‑3202682 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |