| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3615451 = | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/102 | NT | 100% | coding (2900/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | 3615469 = | 0 (0.000) | coding (2918/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
TCGACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTaccgg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3615517‑3615451‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCC > CP009273/3615469‑3615538 CGACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTAC < 1:36781549/68‑1 CGACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTAC < 1:27801860/68‑1 GACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACC > 1:14373116/1‑68 GACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACC < 1:33675396/68‑1 ACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG > 1:21970274/1‑68 ACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG > 1:20489217/1‑68 ACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG > 1:20405196/1‑68 ACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG > 1:29648955/1‑68 ACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGAGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG > 1:35681984/1‑68 ACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGGAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG > 1:36023647/1‑68 ACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCCTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG > 1:7268390/1‑68 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACGAGGGGGTGGTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:7520646/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCTGTGCTGACTGTAATAAAGGTACCGG > 1:34928277/1‑68 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCGG < 1:20330065/68‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCGG > 1:36559574/1‑68 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCGG < 1:3941273/68‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCGG < 1:15304107/68‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCGG > 1:2306930/1‑68 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCGG < 1:2304366/68‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:2471084/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:10065745/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:34207923/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:26614548/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:33955239/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:2850707/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:29008179/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:31910846/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:19052303/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:11973751/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:7141610/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:13950931/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:6567635/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:15193347/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:8090424/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:18804319/67‑1 CCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCAGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG < 1:36646692/67‑1 GTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCG > 1:28590391/1‑47 TGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCGGCTGGTGCGCACTACACGCGGACACAATATGAA > 1:32329141/1‑68 TGACTGTCGTAATGGTACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAA > 1:20972090/1‑67 gCCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:26074449/2‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACCCGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:35265426/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGTCACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:16411041/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGCCACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:37084059/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTTGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:22802539/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGc > 1:17914160/1‑66 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAC < 1:34851954/68‑1 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAC < 1:12486974/68‑1 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:33499856/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:8316724/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:10505429/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:33523818/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:6813607/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:639914/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:6216921/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:5738717/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:4925989/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:36289390/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:30390330/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:11537187/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:11761928/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:13417981/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:14537866/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:14608920/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:15996272/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:16039839/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:1687414/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:1709542/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:17616309/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:18251556/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:18594652/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:19811805/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:20515581/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:22319955/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:22371919/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:24285193/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:28415255/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:27658655/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACG < 1:2509695/66‑1 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACG < 1:33182854/66‑1 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCAATCTTTACGA > 1:6933986/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGCTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:30162596/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATACGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:5648311/1‑67 ACCGGCTGGT‑‑GAACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:6686868/1‑67 ACCGGCTGGG‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:31464504/1‑67 ACCGGCAGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGA > 1:26690778/1‑67 ACCGACTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCGGGTCGAAAGTCGATATCTTTACGA > 1:35892203/1‑67 CCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAC > 1:11261433/1‑67 CCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAC > 1:25829604/1‑67 CCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAC > 1:7878378/1‑67 CCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAC > 1:15416260/1‑67 CCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAC > 1:32765905/1‑67 CGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCC < 1:11193250/68‑1 CGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCC < 1:9204416/68‑1 CGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCC < 1:9373672/68‑1 CGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCC < 1:29744176/68‑1 CGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCC < 1:6276076/68‑1 CGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCC < 1:20002452/68‑1 GGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCC > 1:4549955/1‑67 GGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCC > 1:34772053/1‑67 GCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCC > 1:5090655/1‑66 TCGACCAGCGGCTCTTCATATTGTGTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTaccgg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3615517‑3615451‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCC > CP009273/3615469‑3615538 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |