| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3615451 = | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/102 | NT | 100% | coding (2900/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | 3615469 = | 0 (0.000) | coding (2918/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGGACTCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAC > CP009273/3615403‑3615536 | cgaccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtAc < 1:27801860‑M2/2‑1 (MQ=255)cgaccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtAc < 1:34149056‑M2/2‑1 (MQ=255)cgaccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtAc < 1:36747897‑M2/2‑1 (MQ=255)cgaccagcggctcttcatattgtggccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtAc < 1:28495127‑M2/2‑1 (MQ=255) gaccagcggctcttcatattgggtcagagcgtagtgcaccaggcggtgctgacggtcgtaatggtAcc > 1:36061188‑M2/66‑68 (MQ=255) accagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg > 1:29648955‑M2/65‑68 (MQ=255) accagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg > 1:15314537‑M2/65‑68 (MQ=255) accagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg > 1:20405196‑M2/65‑68 (MQ=255) accagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:14471360‑M2/4‑1 (MQ=255) accagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg > 1:20489217‑M2/65‑68 (MQ=255) accagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagagcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg > 1:35681984‑M2/65‑68 (MQ=255) accagcggctcttcatattgtgtccgcgtggagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg > 1:36023647‑M2/65‑68 (MQ=255) accagcggctcttcatattgtgtccgcctgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg > 1:7268390‑M2/65‑68 (MQ=255) ccagcggctcttcattttgtgtccgcgggtagtgcaccagccgttgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:34406151‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcacgagggggtggtgactgtcgtaatggtACCg < 1:7520646‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCgg > 1:36559574‑M2/64‑68 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCgg < 1:3941273‑M2/5‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCgg > 1:2306930‑M2/64‑68 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCgg > 1:35343706‑M2/64‑68 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCgg < 1:2304366‑M2/5‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCgg < 1:16364876‑M2/5‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCgg > 1:14585028‑M2/64‑68 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:816551‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:8090424‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:11973751‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:21028837‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:31910846‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:13950931‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:14334552‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:20345956‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:36951095‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:33955239‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:15193347‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:18804319‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:26614548‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:2471084‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:10065745‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagcggctcttcatattgtggccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:5680795‑M2/4‑1 (MQ=255) ttcatattgtgtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg < 1:287040‑M2/4‑1 (MQ=255) gtccgcgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCg > 1:28590391‑M2/44‑47 (MQ=255) tgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtACCGGCTGGTGCGCACTACACGCGGACACAATATGaa > 1:32329141‑M2/32‑68 (MQ=255) cggtgctgactgtcgtaatggtACCGGTGGGT‑‑GCGCTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTgg > 1:6421812‑M2/23‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGCCACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:37084059‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTTGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:22802539‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCTCTATCTTTACGa > 1:36332537‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTAcgc > 1:17914160‑M2/1‑66 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTAc < 1:6242147‑M2/65‑1 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACg < 1:33182854‑M2/66‑1 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACg < 1:2509695‑M2/66‑1 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACg < 1:16033189‑M2/66‑1 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:34876711‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:35186071‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:4925989‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:5122797‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:6216921‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:639914‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:6589050‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:6764012‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:3353853‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:6813607‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:8854883‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:33523404‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:28415255‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:15996272‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:33499856‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:19670385‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:18653994‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:18251556‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:17635323‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:1709542‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:1687414‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:16681149‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:19811805‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:15210164‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:14608920‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:13417981‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:11761928‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:11537187‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:11251578‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:10505429‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:27658655‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:32793491‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:31593665‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:30390330‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:29873844‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:20061555‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:24285193‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:22371919‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:22319955‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:22288058‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:20609432‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:20515581‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAc < 1:25954602‑M2/68‑1 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAc < 1:34851954‑M2/68‑1 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAc < 1:12444845‑M2/68‑1 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCAATCTTTACGa > 1:6933986‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGCTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:30162596‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGCAGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:26690778‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGGATGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGa > 1:725033‑M2/1‑67 (MQ=255) ACCGACTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCGGGTCGAAAGTCGATATCTTTACGa > 1:35892203‑M2/1‑67 (MQ=255) | TCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGGACTCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGT‑‑GCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAC > CP009273/3615403‑3615536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |