| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1874084 = | 411 (0.920) | 86 (0.200) | 34/108 | NT | 17.8% | coding (122/360 nt) | yeaR | DUF1971 family protein, nitrate‑inducible |
| ? | CP009273 | 2507755 = | NA (NA) | intergenic (+32/‑55) | nupC/insL1 | nucleoside (except guanosine) transporter/IS186 transposase | |||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
TAAACAAACTGCACCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/1874152‑1874084‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCT > CP009273/2507755‑2507821 TAAACAAACTGCACCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACC < 1:33266433/68‑1TAAACAAACTGCACCTGCCGGAATATTCCAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACC < 1:12253399/68‑1 AAACAAACTGCACCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCC > 1:2927759/1‑68 AAACAAACTGCACCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCC < 1:13171114/68‑1 ACAAACTGCACCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCA > 1:16801223/1‑68 ACAAACTGCACCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCA > 1:6725823/1‑68 ACAAACTGCACCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCA > 1:20367998/1‑68 ACAAACTGCACCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCA > 1:20298676/1‑68 tTGCACCTGCCGGAAAATTCGAACGTGATCTTGATAAAGGAACGCGCCAGGTGGGTTACCCCATAAGa < 1:27373070/67‑2 CTGCACCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGC > 1:31272778/1‑68 CTGCACCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGC > 1:28958720/1‑68 TGCACCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGC > 1:26103153/1‑67 CCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAA < 1:8683601/68‑1 CCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTA > 1:1663334/1‑67 CCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAA > 1:29014326/1‑61 CTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAAC < 1:2574631/68‑1 CTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAAC < 1:20805225/68‑1 CTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAAC < 1:10633325/68‑1 CTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGAGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAAC < 1:34489610/68‑1 TGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACT < 1:31364987/68‑1 TGCCGGAATATTCGAACGGCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACT < 1:1470920/68‑1 TGCCGGAATATTCGAACGGCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACT < 1:33168407/68‑1 AATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:32655160/67‑1 AATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:1572433/67‑1 ATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGT < 1:31109968/68‑1 ATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGT > 1:32463428/1‑68 ATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGT < 1:19659337/68‑1 TATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT < 1:12278341/68‑1 TTCGAACGTCATCTTTATAAAGGAACGCGCCCGGGGTTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGTGTTGT < 1:19329977/68‑1 TTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 1:19143086/68‑1 TTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 1:35599391/68‑1 TTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 1:14615482/68‑1 TTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 1:29661081/68‑1 TTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 1:30812183/68‑1 GAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT < 1:4036497/68‑1 GAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT < 1:9656479/68‑1 GAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT < 1:22882572/68‑1 AACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG > 1:23651041/1‑60 ACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA < 1:34664726/67‑1 CGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT > 1:32354595/1‑68 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GGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATT > 1:7163372/1‑68 GGAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATT > 1:17801200/1‑68 GAACGCGCCCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTT > 1:36727267/1‑68 CCGGGGGTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGC < 1:30021116/67‑1 GTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGA < 1:25480789/67‑1 GTTTACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGA < 1:15034063/67‑1 ACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGATGTGGTATTACGCCTGAAATGATTTAACGTGCCGATGAATa > 1:6060497/1‑65 CCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT < 1:29855161/68‑1 CCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT < 1:34884413/68‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTC < 1:1765150/68‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTC < 1:5290474/68‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTC < 1:6639839/68‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTC < 1:16951148/68‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:34648062/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:22503298/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:21541678/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:11851258/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:35994621/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:1117237/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:37037812/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:7946973/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:11426192/1‑66 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> 1:29186682/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:11852095/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:16404712/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:23505360/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:21086032/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:13985573/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:13920336/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAC > 1:33873838/1‑66 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTAGTGGTATTACGCCTGATATGATATAACGTGCCGATGAATTAC > 1:15773396/1‑66 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCT < 1:31950591/68‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCT < 1:28056317/68‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCT < 1:35458486/68‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCT < 1:7936835/68‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCT < 1:13776708/68‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCT < 1:22603928/68‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTC > 1:8954138/1‑67 TAAACAAACTGCACCTGCCGGAATATTCGAACGTCATCTTGATAAAGGAACGCGCCCGGGGGTTTACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/1874152‑1874084‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCT > CP009273/2507755‑2507821 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |