New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 3293574 = | 443 (1.000) | 22 (0.060) | 9/90 | NT | 6.7% | coding (250/303 nt) | yhbQ | GIY‑YIG nuclease superfamily protein |
? | CP009273 | 3293608 = | 259 (0.720) | coding (284/303 nt) | yhbQ | GIY‑YIG nuclease superfamily protein |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3293649‑3293574 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tctgcaaacccCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCAGCGCGTCA > CP009273/3293608‑3293674 CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:10085367/68‑1 CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:19687198/68‑1 CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:34526267/68‑1 CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:26060886/68‑1 CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:11364158/68‑1 CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:29914681/68‑1 CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTC < 1:34884908/67‑1 CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTC < 1:6718933/67‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:3815337/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:17573033/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:36265404/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:36235434/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:18910823/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:35289128/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:25148987/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:25956996/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:28650990/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:26305989/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:34459765/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:30057908/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:27232345/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:27827324/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:28380840/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:4469969/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:14228941/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:16877704/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:16278819/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:5201524/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:8877375/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:8086773/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:6752424/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:6005202/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:13644639/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT > 1:14328350/1‑67 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGCGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:34707139/68‑1 TGGTCGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:9004002/68‑1 TTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:14336139/1‑68 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAA > 1:36496316/1‑68 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:20638855/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:23083816/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:18114342/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:24740580/1‑67 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGCCTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:23846083/68‑1 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:22220882/68‑1 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:6878227/68‑1 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:26862823/68‑1 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:15181159/68‑1 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGATTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:28986983/68‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:24301029/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:23673465/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:7708200/67‑1 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< 1:8219176/68‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTGTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:10981571/68‑1 GAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGAT < 1:13824546/68‑1 CAATCGCTTTTACTCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCG < 1:8671673/68‑1 CAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCG < 1:1408562/68‑1 ATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGAT < 1:29959722/68‑1 TTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAAT < 1:16945678/68‑1 CTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGT < 1:32902044/68‑1 TTGCAGCCGGCTTAACACCGCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCA < 1:27018454/67‑1 CTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCAT < 1:34564759/66‑1 TGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCA < 1:26577869/68‑1 GCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCA > 1:7147994/1‑67 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |