| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3612627 | 306 (0.690) | 11 (0.030) | 7/98 | NT | 5.4% | coding (76/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3612667 | 116 (0.300) | coding (116/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 544 total aligned reads displayed.
AAACCGGCGGCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCC > CP009273/3612561‑3612694 | aaaCCGGCGGCGCGTCAGGGTGACATGACGGAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGt > 1:9256433/1‑68 (MQ=255)aaaCCGGCGGCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGt < 1:18485118/68‑1 (MQ=40)aaaCCGGCGGCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGG < 1:7667261‑M1/67‑1 (MQ=255)aaaCCGGCGGCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGG < 1:10900158‑M1/67‑1 (MQ=255)aaaCCGGCGGCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGG < 1:13374981‑M1/67‑1 (MQ=255)aaaCCGGCGGCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGG < 1:21026285‑M1/67‑1 (MQ=255) aCCGGCGGCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTAc < 1:3209117/68‑1 (MQ=255) aCCGGCGGCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTAc < 1:12886579/68‑1 (MQ=255) aCCGGCGGCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTAc > 1:1225603/1‑68 (MQ=255) aCCGGCGGCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGATCAGGGTTCAGCCGGGGTAc < 1:16913555/68‑1 (MQ=255) cggcggCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGt < 1:30167425/68‑1 (MQ=255) cggcggCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGt < 1:11411372/68‑1 (MQ=255) cggcggCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGt < 1:18696199/68‑1 (MQ=255) cggcggCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGt < 1:10385467/68‑1 (MQ=255) ggcgCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTAtt < 1:9542125/67‑1 (MQ=255) cgcgTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGt > 1:14644353/1‑68 (MQ=255) cgTCAGCGTGACATGACGCAGTATTGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTg < 1:23976338/67‑1 (MQ=255) ggcAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGc < 1:3909069/65‑1 (MQ=255) cAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCC < 1:4937621‑M1/67‑1 (MQ=255) cAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCC < 1:15871086‑M1/67‑1 (MQ=255) ggTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCA > 1:37107974‑M1/1‑67 (MQ=255) gTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACC > 1:22818563‑M1/1‑68 (MQ=255) gACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGG < 1:447947‑M1/68‑1 (MQ=255) gACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGG < 1:23619958‑M1/68‑1 (MQ=255) gACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGG < 1:33854106‑M1/68‑1 (MQ=255) gACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCG > 1:32284055‑M1/1‑67 (MQ=255) aTGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGt > 1:21938407/1‑68 (MQ=40) aTGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGt > 1:34306328/1‑68 (MQ=40) gACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTgg < 1:6542019/68‑1 (MQ=40) 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gCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTgg > 1:30655303/1‑65 (MQ=40) aGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTg < 1:26488689/67‑1 (MQ=40) aTGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGt < 1:25381968/65‑1 (MQ=40) aTGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGt < 1:8278366/65‑1 (MQ=40) aTGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCg > 1:19822531/1‑68 (MQ=40) aTGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCg > 1:26770977/1‑68 (MQ=40) gCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtg > 1:20712988/1‑68 (MQ=40) gCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtg > 1:8934576/1‑68 (MQ=40) gCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtg > 1:1575420/1‑68 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgtt > 1:12607564/1‑67 (MQ=255) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgt > 1:23365626/1‑67 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgt > 1:10083397/1‑67 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgt > 1:29576935/1‑67 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgt > 1:32880137/1‑67 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgt > 1:33575652/1‑67 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgt > 1:15281492/1‑67 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgt > 1:27867906/1‑67 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgt > 1:15452814/1‑67 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgt > 1:17600710/1‑67 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgt > 1:6367659/1‑67 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgt > 1:35573546/1‑67 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGgtgt > 1:35420848/1‑67 (MQ=40) ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGtgtg < 1:2732764/68‑1 (MQ=40) tAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGc < 1:22010458‑M2/67‑2 (MQ=255) aaGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGGGc < 1:31345756/66‑1 (MQ=255) aGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGca > 1:20198191‑M2/1‑65 (MQ=255) cATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:10943834‑M2/68‑6 (MQ=255) cATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:10301740‑M2/68‑6 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:9651615‑M2/67‑6 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:17233584‑M2/67‑6 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGcccc > 1:5785048‑M2/1‑62 (MQ=255) ttGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccggc < 1:34044101‑M2/68‑8 (MQ=255) ttGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccggc < 1:27633538‑M2/68‑8 (MQ=255) tGTTCAGGGTTCAGCCGGGGccccccgaaccggccacgccggtgggggcaccaatacgtaccccg > 1:29217913‑M1/1‑20 (MQ=255) tGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCcggcg < 1:12032920/68‑1 (MQ=40) tGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCcggcg > 1:7433084/1‑68 (MQ=40) gTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCcggcgg < 1:1168551/68‑1 (MQ=40) tCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGa < 1:1304894/67‑1 (MQ=40) tCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGa < 1:36907863/67‑1 (MQ=40) tCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAg > 1:29993173/1‑68 (MQ=40) 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gTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATcc > 1:22418550/1‑68 (MQ=40) | AAACCGGCGGCGCGTCAGGGTGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCC > CP009273/3612561‑3612694 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |