| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3612627 | 306 (0.690) | 11 (0.030) | 7/98 | NT | 5.4% | coding (76/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3612667 | 116 (0.300) | coding (116/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
GGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGT > CP009273/3612600‑3612721 | tAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGc < 1:22010458‑M2/67‑2 (MQ=255) gCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGcccc < 1:35564545‑M2/68‑5 (MQ=255) gCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGcccc < 1:3487375‑M2/68‑5 (MQ=255) cATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:10301740‑M2/68‑6 (MQ=255) cATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:10943834‑M2/68‑6 (MQ=255) cATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:4603134‑M2/68‑6 (MQ=255) cATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:11745732‑M2/68‑6 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccgg > 1:14841798‑M2/1‑62 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:9651615‑M2/67‑6 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:557548‑M2/67‑6 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:29077068‑M2/67‑6 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:13728958‑M2/67‑6 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccg < 1:12961998‑M2/67‑6 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGcccc > 1:10762051‑M2/1‑62 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGcccc > 1:5785048‑M2/1‑62 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGcccc > 1:15717007‑M2/1‑62 (MQ=255) aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGcccc > 1:7691188‑M2/1‑62 (MQ=255) ttGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccggc > 1:29995529‑M2/1‑61 (MQ=255) ttGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccggc > 1:12058256‑M2/1‑61 (MQ=255) ttGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccggc < 1:5887521‑M2/68‑8 (MQ=255) ttGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccggc < 1:27633538‑M2/68‑8 (MQ=255) ttGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccggc < 1:8168472‑M2/68‑8 (MQ=255) tGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCcggcg > 1:7433084/1‑68 (MQ=40) tGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCcggcg > 1:26766396/1‑68 (MQ=40) tGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCcggcg > 1:13036205/1‑68 (MQ=40) gTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCcggcgg < 1:20952850/68‑1 (MQ=40) ttCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGa > 1:20026868/1‑68 (MQ=40) tCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCTCGGCGGAg > 1:15464320/1‑68 (MQ=255) 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gTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACg > 1:13887021/1‑68 (MQ=40) gTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACg > 1:5524905/1‑68 (MQ=40) gTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACg > 1:657967/1‑68 (MQ=40) gTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACg > 1:7061363/1‑68 (MQ=40) gTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACg > 1:8376981/1‑68 (MQ=40) gTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACg > 1:8871003/1‑68 (MQ=40) gTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACg > 1:24434779/1‑68 (MQ=40) gTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACg > 1:21298599/1‑68 (MQ=40) gTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACg > 1:19537073/1‑68 (MQ=40) gTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACg > 1:19284450/1‑68 (MQ=40) 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aCCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGccccggctgaaccctgaacaatgctaccgccatactgcgtcatg < 1:5034706‑M2/67‑45 (MQ=255) ccTGTTCGGTGTGccccggctgaaccctgaacaatgctaccgccatactgcgtcatgtcaccctgac < 1:14200593‑M2/67‑55 (MQ=255) | GGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTACGTATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGT > CP009273/3612600‑3612721 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |