| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4311466 = | 558 (1.250) | 25 (0.070) | 10/94 | NT | 5.8% | coding (48/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit |
| ? | CP009273 | 4311493 = | 346 (0.930) | coding (21/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit | |||||
Only 100 of 745 total aligned reads displayed.
TCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAT > CP009273/4311399‑4311532 | tCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGc < 1:36404435‑M2/67‑1 (MQ=255) cctgacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGcc < 1:3404013‑M1/4‑1 (MQ=255) ccTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCATCCTGTGGGCGTTgcgac > 1:20291637/1‑66 (MQ=255) ctgacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCg > 1:2475574‑M1/64‑65 (MQ=255) ctgacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCg > 1:16675137‑M1/64‑65 (MQ=255) tCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAg < 1:1882816/68‑1 (MQ=255) gccgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGc > 1:18493353‑M1/62‑68 (MQ=255) gacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGc > 1:17213873‑M1/62‑68 (MQ=255) gacgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGc > 1:33149501‑M1/62‑68 (MQ=255) cATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGc < 1:35788587/68‑1 (MQ=255) aTAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGc > 1:19961595/1‑67 (MQ=255) cgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGc < 1:10097590‑M1/7‑1 (MQ=255) cgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCa > 1:28540227‑M1/60‑67 (MQ=255) cgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCa > 1:32984827‑M1/60‑67 (MQ=255) cgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCa > 1:20784860‑M1/60‑67 (MQ=255) cgcgcgccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCa > 1:1733332‑M1/60‑67 (MQ=255) aGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACg > 1:35053117/1‑68 (MQ=255) aGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACg < 1:12707400/68‑1 (MQ=255) aGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACg < 1:31319368/68‑1 (MQ=255) aGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACg < 1:6964654/68‑1 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:14676660/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:28886456/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:29879858/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:7375709/1‑68 (MQ=255) gTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACgg > 1:6660099/1‑68 (MQ=255) cggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGa < 1:1760013/67‑1 (MQ=255) cggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGa < 1:22892793/67‑1 (MQ=255) cggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGa < 1:6356661/67‑1 (MQ=255) cggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGa < 1:21778159/67‑1 (MQ=255) ggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACa > 1:23937642/1‑68 (MQ=255) ggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACa < 1:29565163/68‑1 (MQ=255) ggcggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACa < 1:4935097/68‑1 (MQ=255) gccgacatgattgaattcactatggagcactgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCACGGACa > 1:9345537‑M1/55‑68 (MQ=255) cggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACAt < 1:3266372/67‑1 (MQ=255) cggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACAt < 1:27877389/67‑1 (MQ=255) cggTGAGGTTTAGCGCGTGCAGGCGGGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACAt < 1:22667139/67‑1 (MQ=255) ggTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATcc > 1:13372485/1‑68 (MQ=255) gATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGt < 1:9639280/68‑1 (MQ=255) gATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGt < 1:26832321/68‑1 (MQ=255) gATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGt < 1:21463243/68‑1 (MQ=255) tGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGt > 1:30162124/1‑66 (MQ=255) tGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGt > 1:5262489/1‑66 (MQ=255) ttAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCggg < 1:4295570/68‑1 (MQ=255) ttAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTgg < 1:27371984/68‑1 (MQ=255) ttAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTg > 1:5471660/1‑67 (MQ=255) ttAGCGCGTTCAGGCGGGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTgg < 1:19716835/68‑1 (MQ=255) aGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCg > 1:36165730/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:12110318/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:29448411/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:27116238/1‑68 (MQ=255) gcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCCCGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:8770035/1‑67 (MQ=255) gcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg < 1:25638085/67‑1 (MQ=255) gTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcg < 1:3667261/68‑1 (MQ=255) gTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcg < 1:3552059/68‑1 (MQ=255) ttCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcg < 1:28222778/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:23367800/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:2631554/68‑1 (MQ=255) tccGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:12986944/3‑68 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt < 1:8443253/65‑1 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt < 1:25870601/65‑1 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt < 1:32284752/65‑1 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:7943213/1‑66 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:36955467/1‑66 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTGCAGCCGGTTGGCTGGGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt < 1:1170608/65‑1 (MQ=255) tgcCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCg < 1:2661659/67‑1 (MQ=255) tgcCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCg < 1:2538465/67‑1 (MQ=255) tgcCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCg < 1:25247834/67‑1 (MQ=255) tgcCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCg < 1:1097428/67‑1 (MQ=255) gcCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTg < 1:31740611/68‑1 (MQ=255) gcCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTg < 1:24267822/68‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCa < 1:15094068/68‑1 (MQ=255) atccGGTTGGCGGTGCTCCAGCACGGACATCCAGGGCTGGCGGGGCGCGGGATCTGCGGGCATTCAGt < 1:10477043/66‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:19017788/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:9469509/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:21660351/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:23524146/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:15422952/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:34404878/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:19555557/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:3915605/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:25052416/67‑1 (MQ=255) ggTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCTGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTc < 1:15555512/68‑1 (MQ=255) ggTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTc < 1:16203916/68‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:11406666/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:3779664/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:13916028/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:14207568/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:33706719/67‑1 (MQ=255) accgcgaccCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCa < 1:7728679‑M1/59‑1 (MQ=255) tGGCTGTGCGCCAGCACGTACATCCAGTGCTGTCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCAt < 1:30414883/68‑1 (MQ=255) tGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCAt < 1:29126147/68‑1 (MQ=255) tGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCAt < 1:1820661/68‑1 (MQ=255) ggCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATa > 1:8239308/1‑68 (MQ=255) ggCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATa > 1:34883490/1‑68 (MQ=255) ggCGGTGCGCCAGCTCGGCCAGCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGGGCAGTCAGTGCTCCATa > 1:13641301/1‑68 (MQ=255) cgcgaccCGCCCGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTCTCTGCGTGCATTCGGTGCTCCatt < 1:19177240‑M1/61‑2 (MQ=255) cTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAg < 1:5840526/67‑1 (MQ=255) gtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGa < 1:16904404/68‑1 (MQ=255) gcgcCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGaa < 1:22145348/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAt < 1:31016242/68‑1 (MQ=255) | TCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAT > CP009273/4311399‑4311532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |